25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1650 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1650  DNA primase large subunit  100 
 
 		 361 aa  724    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2038  DNA primase, large subunit  57.69 
 
 		 427 aa  418  1e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0159  DNA primase, large subunit  62.15 
 
 		 360 aa  417  9.999999999999999e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0993  DNA primase, large subunit  60.82 
 
 		 362 aa  393  1e-108  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.438183  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2529  DNA primase, large subunit  40.98 
 
 		 389 aa  238  2e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.436606  normal  0.303957 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2192  DNA primase large subunit  35.29 
 
 		 364 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1028  DNA primase large subunit  36.13 
 
 		 330 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.163924  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0880  DNA primase large subunit  34.77 
 
 		 413 aa  197  3e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1462  DNA primase large subunit  35.53 
 
 		 334 aa  182  6e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0793  DNA primase large subunit  34.73 
 
 		 338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0232424  normal  0.488052 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1393  DNA primase large subunit  32.28 
 
 		 362 aa  156  5.0000000000000005e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.402871  normal  0.321171 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1252  DNA primase large subunit  30.81 
 
 		 354 aa  151  1e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1229  DNA primase, large subunit  27.37 
 
 		 364 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1489  DNA primase large subunit  30.14 
 
 		 384 aa  144  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0623  DNA primase, large subunit  28.74 
 
 		 356 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.426261  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0065  DNA primase large subunit  26.3 
 
 		 341 aa  112  9e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0952  DNA primase large subunit  36.63 
 
 		 346 aa  107  4e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1917  DNA primase large subunit  35.75 
 
 		 349 aa  104  2e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1401  DNA primase large subunit  35.08 
 
 		 349 aa  103  3e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0852  DNA primase large subunit  34.97 
 
 		 349 aa  98.2  2e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.10596 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0829  DNA primase, large subunit  21.11 
 
 		 371 aa  77.8  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01730  hypothetical protein  29.31 
 
 		 502 aa  52.8  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00260  Subunit of DNA primase (Eurofung)  29.35 
 
 		 500 aa  44.3  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0283839 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34043  DNA-directed DNA polymerase alpha, DNA primase subunit  24.72 
 
 		 513 aa  44.3  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1167  DNA primase, large subunit  20.8 
 
 		 373 aa  43.5  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>