22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1229 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_1229  DNA primase, large subunit  100 
 
 
364 aa  746    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2192  DNA primase large subunit  30.05 
 
 
364 aa  169  8e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0880  DNA primase large subunit  25.98 
 
 
413 aa  155  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1650  DNA primase large subunit  27.37 
 
 
361 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1028  DNA primase large subunit  27.79 
 
 
330 aa  144  3e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.163924  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1489  DNA primase large subunit  36.53 
 
 
384 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2038  DNA primase, large subunit  34.63 
 
 
427 aa  138  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0993  DNA primase, large subunit  27.12 
 
 
362 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.438183  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0159  DNA primase, large subunit  36.5 
 
 
360 aa  134  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1462  DNA primase large subunit  27.35 
 
 
334 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1252  DNA primase large subunit  26.8 
 
 
354 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0623  DNA primase, large subunit  26.94 
 
 
356 aa  129  6e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.426261  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1393  DNA primase large subunit  37.07 
 
 
362 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.402871  normal  0.321171 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0852  DNA primase large subunit  28.7 
 
 
349 aa  126  5e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.10596 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1401  DNA primase large subunit  36.04 
 
 
349 aa  124  3e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0952  DNA primase large subunit  37.37 
 
 
346 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1917  DNA primase large subunit  29.46 
 
 
349 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0793  DNA primase large subunit  39.44 
 
 
338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0232424  normal  0.488052 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0065  DNA primase large subunit  28.64 
 
 
341 aa  92  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0829  DNA primase, large subunit  29.78 
 
 
371 aa  80.5  0.00000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2529  DNA primase, large subunit  27.59 
 
 
389 aa  79.7  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.436606  normal  0.303957 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1625  DNA primase, large subunit  24.27 
 
 
307 aa  52  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.179853  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>