26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0829 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0829  DNA primase, large subunit  100 
 
 
371 aa  764    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1917  DNA primase large subunit  38.28 
 
 
349 aa  182  1e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0852  DNA primase large subunit  36 
 
 
349 aa  175  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.10596 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1401  DNA primase large subunit  37.02 
 
 
349 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0952  DNA primase large subunit  37.59 
 
 
346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0623  DNA primase, large subunit  27.61 
 
 
356 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.426261  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1028  DNA primase large subunit  24.72 
 
 
330 aa  103  4e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.163924  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2192  DNA primase large subunit  28.17 
 
 
364 aa  96.3  8e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0065  DNA primase large subunit  27.92 
 
 
341 aa  94.4  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0880  DNA primase large subunit  26.15 
 
 
413 aa  86.3  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1229  DNA primase, large subunit  29.78 
 
 
364 aa  80.5  0.00000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1650  DNA primase large subunit  21.11 
 
 
361 aa  77.8  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1462  DNA primase large subunit  36.94 
 
 
334 aa  76.6  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0793  DNA primase large subunit  27.72 
 
 
338 aa  69.3  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0232424  normal  0.488052 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0159  DNA primase, large subunit  19.53 
 
 
360 aa  69.3  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1252  DNA primase large subunit  25.41 
 
 
354 aa  68.2  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0993  DNA primase, large subunit  20.76 
 
 
362 aa  66.6  0.0000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.438183  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2038  DNA primase, large subunit  19.02 
 
 
427 aa  63.9  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1393  DNA primase large subunit  35.48 
 
 
362 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.402871  normal  0.321171 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1489  DNA primase large subunit  29.73 
 
 
384 aa  62  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1625  DNA primase, large subunit  22.16 
 
 
307 aa  56.6  0.0000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.179853  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2529  DNA primase, large subunit  24.87 
 
 
389 aa  54.3  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.436606  normal  0.303957 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1167  DNA primase, large subunit  23.91 
 
 
373 aa  52.8  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1006  DNA primase, large subunit  22.73 
 
 
369 aa  50.4  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1675  DNA primase large subunit  21.72 
 
 
369 aa  47  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0940  DNA primase, large subunit  22.59 
 
 
369 aa  47  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.410078  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>