18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1625 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1625  DNA primase, large subunit  100 
 
 		 307 aa  615  1e-175  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.179853  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1912  DNA primase large subunit  32.8 
 
 		 307 aa  166  5e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.424658 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0623  DNA primase, large subunit  25.81 
 
 		 356 aa  95.1  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.426261  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2192  DNA primase large subunit  27.62 
 
 		 364 aa  77.4  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1028  DNA primase large subunit  25.45 
 
 		 330 aa  75.9  0.0000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.163924  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0065  DNA primase large subunit  26.18 
 
 		 341 aa  67  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0952  DNA primase large subunit  22.92 
 
 		 346 aa  63.9  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0880  DNA primase large subunit  23.05 
 
 		 413 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0852  DNA primase large subunit  23.19 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.10596 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1401  DNA primase large subunit  24.15 
 
 		 349 aa  60.5  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0829  DNA primase, large subunit  22.16 
 
 		 371 aa  56.6  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1917  DNA primase large subunit  21.99 
 
 		 349 aa  53.5  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1229  DNA primase, large subunit  24.27 
 
 		 364 aa  52  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0793  DNA primase large subunit  22.03 
 
 		 338 aa  51.6  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0232424  normal  0.488052 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1462  DNA primase large subunit  21.76 
 
 		 334 aa  50.8  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1393  DNA primase large subunit  21.35 
 
 		 362 aa  49.7  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.402871  normal  0.321171 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1252  DNA primase large subunit  21.62 
 
 		 354 aa  44.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1489  DNA primase large subunit  20.63 
 
 		 384 aa  43.1  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>