More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0047 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0047  phosphoribosyltransferase  100 
 
 
217 aa  429  1e-119  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0667  uracil phosphoribosyltransferase  46.48 
 
 
210 aa  168  7e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2128  uracil phosphoribosyltransferase  47.2 
 
 
211 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.641959  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0611  uracil phosphoribosyltransferase  42.53 
 
 
219 aa  166  4e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.736678  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0608  uracil phosphoribosyltransferase  46.48 
 
 
210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1643  uracil phosphoribosyltransferase  46.73 
 
 
211 aa  161  8.000000000000001e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.637349  normal  0.301686 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1210  uracil phosphoribosyltransferase  38.79 
 
 
216 aa  159  4e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.926992  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0811  uracil phosphoribosyltransferase  40.38 
 
 
207 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0026  uracil phosphoribosyltransferase  38.99 
 
 
215 aa  145  7.0000000000000006e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00981557 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0942  uracil phosphoribosyltransferase  39.53 
 
 
370 aa  144  1e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0456  uracil phosphoribosyltransferase  35.19 
 
 
211 aa  141  6e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3424  uracil phosphoribosyltransferase  36.11 
 
 
209 aa  141  7e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1306  uracil phosphoribosyltransferase  37.85 
 
 
214 aa  141  9e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.12178  normal  0.272748 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0260  uracil phosphoribosyltransferase  37.85 
 
 
209 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000384888  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1036  uracil phosphoribosyltransferase  37.85 
 
 
211 aa  140  9.999999999999999e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0997591 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0633  uracil phosphoribosyltransferase  37.21 
 
 
213 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2462  uracil phosphoribosyltransferase  37.04 
 
 
209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3834  uracil phosphoribosyltransferase  34.72 
 
 
209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000428341  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3312  uracil phosphoribosyltransferase  35.65 
 
 
209 aa  139  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000424943  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0877  uracil phosphoribosyltransferase  37.9 
 
 
225 aa  139  4.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.197275 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2172  uracil phosphoribosyltransferase  36.57 
 
 
209 aa  138  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0574841  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17920  uracil phosphoribosyltransferase  36.87 
 
 
226 aa  138  6e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1245  uracil phosphoribosyltransferase  36.57 
 
 
209 aa  138  7e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000033391  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1787  uracil phosphoribosyltransferase  37.21 
 
 
209 aa  137  8.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.823416  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0360  uracil phosphoribosyltransferase  38.39 
 
 
216 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00755742  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1883  uracil phosphoribosyltransferase  38.39 
 
 
216 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.140076  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1233  uracil phosphoribosyltransferase  38.39 
 
 
216 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1387  uracil phosphoribosyltransferase  38.39 
 
 
216 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12130  uracil phosphoribosyltransferase  36.92 
 
 
213 aa  137  1e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1242  uracil phosphoribosyltransferase  38.39 
 
 
216 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0425998  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1077  uracil phosphoribosyltransferase  38.39 
 
 
216 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.475788  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0790  uracil phosphoribosyltransferase  38.39 
 
 
216 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0641631  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5113  uracil phosphoribosyltransferase  33.8 
 
 
209 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000923033  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1016  uracil phosphoribosyltransferase  37.91 
 
 
216 aa  136  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2767  uracil phosphoribosyltransferase  37.5 
 
 
209 aa  136  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1579  Uracil phosphoribosyltransferase  33.64 
 
 
209 aa  135  4e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5493  uracil phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
209 aa  135  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000780071  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5440  uracil phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
209 aa  135  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000136173  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5164  uracil phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
209 aa  135  5e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000108027  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4997  uracil phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
209 aa  135  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.57452e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5014  uracil phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
209 aa  135  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000524858  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5557  uracil phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
209 aa  135  5e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000695057  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5514  uracil phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
209 aa  135  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166649  hitchhiker  9.91191e-23 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5406  uracil phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
209 aa  135  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.45769e-62 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2598  uracil phosphoribosyltransferase  34.72 
 
 
209 aa  135  5e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.603921  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5437  uracil phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
209 aa  135  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000902075  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1551  uracil phosphoribosyltransferase  39.35 
 
 
224 aa  134  8e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04610  uracil phosphoribosyltransferase  35.19 
 
 
209 aa  134  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.107009  hitchhiker  0.000000328703 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0394  uracil phosphoribosyltransferase  33.8 
 
 
209 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0099  uracil phosphoribosyltransferase  37.38 
 
 
210 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2519  uracil phosphoribosyltransferase  35.98 
 
 
216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0756  uracil phosphoribosyltransferase  35.65 
 
 
209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.100559  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2185  uracil phosphoribosyltransferase  33.64 
 
 
211 aa  132  3e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0012098  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2188  uracil phosphoribosyltransferase  35.07 
 
 
216 aa  132  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0831132  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2718  uracil phosphoribosyltransferase  35.94 
 
 
209 aa  132  5e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.856102  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2063  uracil phosphoribosyltransferase  36.49 
 
 
216 aa  132  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36489  normal  0.305714 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0119  uracil phosphoribosyltransferase  39.9 
 
 
225 aa  131  7.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1302  uracil phosphoribosyltransferase  36.02 
 
 
216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0489544  normal  0.116474 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1718  uracil phosphoribosyltransferase  35.65 
 
 
209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3258  uracil phosphoribosyltransferase  36.02 
 
 
216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0567794  normal  0.970145 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2186  uracil phosphoribosyltransferase  35.48 
 
 
209 aa  129  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2148  uracil phosphoribosyltransferase  35.48 
 
 
209 aa  129  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.853574  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0985  uracil phosphoribosyltransferase  35.07 
 
 
216 aa  129  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.286642  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4825  uracil phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
209 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576364  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2394  uracil phosphoribosyltransferase  36.02 
 
 
208 aa  129  4.0000000000000003e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0693016  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2717  uracil phosphoribosyltransferase  36.28 
 
 
225 aa  128  6e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.841671  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2316  uracil phosphoribosyltransferase  35.07 
 
 
216 aa  128  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.542066 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3184  uracil phosphoribosyltransferase  36.87 
 
 
209 aa  128  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.609479  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2209  uracil phosphoribosyltransferase  35.07 
 
 
216 aa  128  6e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683076  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2331  uracil phosphoribosyltransferase  35.07 
 
 
216 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.829387  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2255  uracil phosphoribosyltransferase  36.67 
 
 
218 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.549393  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1681  uracil phosphoribosyltransferase  35.07 
 
 
232 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0731793  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2515  uracil phosphoribosyltransferase  34.58 
 
 
208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5620  uracil phosphoribosyltransferase  34.6 
 
 
216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301605  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1963  uracil phosphoribosyltransferase  35.81 
 
 
213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1569  uracil phosphoribosyltransferase  35.05 
 
 
210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2293  uracil phosphoribosyltransferase  35.07 
 
 
238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2857  uracil phosphoribosyltransferase  33.8 
 
 
209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219047 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1586  uracil phosphoribosyltransferase  32.87 
 
 
209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0143232  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1720  uracil phosphoribosyltransferase  39.02 
 
 
225 aa  126  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1512  uracil phosphoribosyltransferase  35.58 
 
 
232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.299119  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2983  uracil phosphoribosyltransferase  35.35 
 
 
210 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.19059  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1986  uracil phosphoribosyltransferase  33.18 
 
 
216 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.252014  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1439  Uracil phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
203 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000704473  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0833  uracil phosphoribosyltransferase  34.56 
 
 
303 aa  125  3e-28  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00074745  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1697  uracil phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
209 aa  125  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0240  uracil phosphoribosyltransferase  32.87 
 
 
208 aa  126  3e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0843  uracil phosphoribosyltransferase  36.92 
 
 
211 aa  126  3e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2386  uracil phosphoribosyltransferase  32.24 
 
 
216 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2073  uracil phosphoribosyltransferase  34.11 
 
 
215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0788  uracil phosphoribosyltransferase  34.6 
 
 
216 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0190472  normal  0.0749115 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1893  uracil phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
209 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.439463  normal  0.245011 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2102  uracil phosphoribosyltransferase  36.92 
 
 
209 aa  124  8.000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3218  uracil phosphoribosyltransferase  34.42 
 
 
215 aa  124  8.000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.225057  normal  0.810636 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2661  uracil phosphoribosyltransferase  33.64 
 
 
209 aa  124  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0832  uracil phosphoribosyltransferase  35.21 
 
 
206 aa  124  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0298265 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5192  uracil phosphoribosyltransferase  35.02 
 
 
209 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.420046  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5573  uracil phosphoribosyltransferase  35.02 
 
 
209 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5281  uracil phosphoribosyltransferase  35.02 
 
 
209 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0831  uracil phosphoribosyltransferase  36.62 
 
 
210 aa  124  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.155687  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>