More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0027 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0027  alanine aminotransferase  100 
 
 		 400 aa  811    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0177  alanine aminotransferase  39.65 
 
 		 391 aa  289  6e-77  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.127101 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1781  aminotransferase class I and II  38.48 
 
 		 405 aa  288  1e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1660  aminotransferase class I and II  38.89 
 
 		 404 aa  285  1.0000000000000001e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0815  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  38.38 
 
 		 543 aa  269  5.9999999999999995e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000101796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1772  aminotransferase AlaT  38.36 
 
 		 404 aa  259  7e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1458  aminotransferase  38.58 
 
 		 404 aa  257  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1540  aminotransferase AlaT  39.21 
 
 		 409 aa  257  3e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.790745 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0692  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  36.91 
 
 		 545 aa  255  9e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4338  aminotransferase class I and II  37.94 
 
 		 440 aa  255  1.0000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0717  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  36.63 
 
 		 546 aa  254  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.890628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1563  aminotransferase AlaT  37.56 
 
 		 404 aa  254  1.0000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0842  aminotransferase AlaT  39.75 
 
 		 426 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.387526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2026  aminotransferase AlaT  38.95 
 
 		 409 aa  253  4.0000000000000004e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3310  aminotransferase AlaT  39.3 
 
 		 404 aa  252  7e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000424805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1348  aminotransferase AlaT  38.46 
 
 		 410 aa  252  9.000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.613177  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1391  aminotransferase AlaT  38.89 
 
 		 404 aa  250  3e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0476582  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01427  aminotransferase AlaT  37.06 
 
 		 404 aa  248  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7259  aminotransferase AlaT  39.53 
 
 		 404 aa  248  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0619  aminotransferase AlaT  37.12 
 
 		 404 aa  246  4.9999999999999997e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2553  aminotransferase AlaT  37.56 
 
 		 404 aa  246  6e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1819  aminotransferase AlaT  38.06 
 
 		 404 aa  246  6e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1676  aminotransferase AlaT  36.32 
 
 		 403 aa  246  6.999999999999999e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000605131  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2553  aminotransferase AlaT  36.25 
 
 		 406 aa  245  8e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000352326 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0064  aminotransferase AlaT  39.15 
 
 		 415 aa  245  8e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0437  aminotransferase AlaT  38.25 
 
 		 418 aa  245  9.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0903  aminotransferase AlaT  37.62 
 
 		 429 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1047  aminotransferase AlaT  37.62 
 
 		 429 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1558  aminotransferase AlaT  38.06 
 
 		 404 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.302938  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1450  aminotransferase AlaT  38.06 
 
 		 404 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2774  aminotransferase AlaT  37.31 
 
 		 404 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.363004  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1490  aminotransferase AlaT  37.31 
 
 		 404 aa  243  3e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004034  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  38.4 
 
 		 377 aa  243  3e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1565  aminotransferase class I and II  37.19 
 
 		 404 aa  243  3e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114117  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16560  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  37.93 
 
 		 505 aa  243  3.9999999999999997e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0044181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1097  aminotransferase AlaT  35.24 
 
 		 404 aa  243  5e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.832418  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1468  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  36.91 
 
 		 534 aa  243  5e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.64807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1967  aminotransferase AlaT  38.68 
 
 		 409 aa  242  7e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000390932  normal  0.209887 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2838  aminotransferase AlaT  35.52 
 
 		 406 aa  242  7e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00546919  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0691  aminotransferase class I and II  37.04 
 
 		 410 aa  242  7.999999999999999e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0228341  hitchhiker  0.0000000562842 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3601  aminotransferase AlaT  37.76 
 
 		 405 aa  241  1e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.16413 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16360  aminotransferase  36.75 
 
 		 412 aa  241  2e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2834  aminotransferase AlaT  37.31 
 
 		 405 aa  240  2.9999999999999997e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0052694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1475  aminotransferase AlaT  34.3 
 
 		 404 aa  239  9e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.714124 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2471  aminotransferase AlaT  37.81 
 
 		 404 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00191502  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2559  aminotransferase AlaT  37.81 
 
 		 404 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2516  aminotransferase AlaT  37.81 
 
 		 404 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0408382  normal  0.443228 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2571  aminotransferase AlaT  37.81 
 
 		 404 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.853927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07490  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  36.75 
 
 		 403 aa  238  2e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1994  aminotransferase AlaT  37.25 
 
 		 427 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2327  aminotransferase AlaT  38.05 
 
 		 403 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218058  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5139  aminotransferase class I and II  36.65 
 
 		 405 aa  237  3e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0279  aminotransferase AlaT  35.41 
 
 		 422 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.306917  normal  0.798305 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3429  aminotransferase AlaT  36.82 
 
 		 405 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.412347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2723  aminotransferase class I and II  35.73 
 
 		 414 aa  236  6e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27500  aminotransferase AlaT  37.79 
 
 		 403 aa  236  6e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0223  normal  0.0677346 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1830  aminotransferase AlaT  35.57 
 
 		 409 aa  236  8e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0461  aminotransferase class I and II  37.01 
 
 		 418 aa  235  9e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02215  aspartate aminotransferase  36.82 
 
 		 405 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1366  aminotransferase class I and II  36.82 
 
 		 405 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.465492  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2522  aminotransferase AlaT  37.79 
 
 		 403 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0098496  normal  0.421504 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1362  aminotransferase AlaT  36.82 
 
 		 405 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.594502 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2439  aminotransferase AlaT  36.82 
 
 		 405 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2445  aminotransferase AlaT  36.82 
 
 		 405 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01072  aminotransferase AlaT  35.56 
 
 		 406 aa  235  1.0000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10342  aminotransferase AlaT  34.66 
 
 		 429 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.535364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02175  hypothetical protein  36.82 
 
 		 405 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2666  aminotransferase AlaT  36.82 
 
 		 405 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.180875  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1914  aminotransferase class I and II  36.52 
 
 		 403 aa  234  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2583  aminotransferase AlaT  36.82 
 
 		 405 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.45985  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1600  aminotransferase AlaT  35.98 
 
 		 404 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0619302  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1164  aminotransferase AlaT  35 
 
 		 423 aa  233  4.0000000000000004e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000136093 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2267  aminotransferase AlaT  36.96 
 
 		 403 aa  233  5e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0850565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2387  aminotransferase AlaT  35.64 
 
 		 414 aa  231  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2136  aminotransferase AlaT  35.61 
 
 		 404 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000003299  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05990  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  37.53 
 
 		 415 aa  232  1e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.338799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15420  aminotransferase AlaT  37.28 
 
 		 403 aa  232  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.169298  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1914  aminotransferase AlaT  35.61 
 
 		 404 aa  232  1e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000233272  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2248  aminotransferase AlaT  35.61 
 
 		 404 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000013752  hitchhiker  0.00000000752949 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2235  aminotransferase AlaT  35.61 
 
 		 404 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000654312  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4521  aminotransferase AlaT  35.61 
 
 		 404 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2340  aminotransferase AlaT  36.09 
 
 		 404 aa  231  2e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.599264  hitchhiker  0.0000284015 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  36.53 
 
 		 375 aa  231  2e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0437  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  35.54 
 
 		 518 aa  230  3e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2483  aminotransferase AlaT  35.35 
 
 		 404 aa  230  4e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1481  aminotransferase AlaT  38.05 
 
 		 403 aa  230  4e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0167  aminotransferase AlaT  34.83 
 
 		 404 aa  230  4e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2040  aminotransferase AlaT  35.86 
 
 		 404 aa  229  5e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00341686  hitchhiker  0.00762729 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2186  aminotransferase AlaT  35.35 
 
 		 404 aa  229  6e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0116007  hitchhiker  0.0000796171 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1326  aminotransferase AlaT  34.65 
 
 		 413 aa  229  6e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0763036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2197  aminotransferase AlaT  36.2 
 
 		 412 aa  229  6e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141545  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1697  aminotransferase AlaT  37.12 
 
 		 404 aa  229  6e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00135773  normal  0.0103936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1935  aminotransferase AlaT  35.35 
 
 		 404 aa  229  6e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00236574  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1447  aminotransferase AlaT  37.79 
 
 		 403 aa  229  9e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0541953  normal  0.418968 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1993  aminotransferase AlaT  36.52 
 
 		 404 aa  229  9e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000340923  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2145  aminotransferase AlaT  35.61 
 
 		 404 aa  229  9e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0123768  normal  0.013049 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1779  aminotransferase, classes I and II  37.79 
 
 		 403 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1552  aminotransferase AlaT  38.16 
 
 		 409 aa  228  1e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3843  aminotransferase AlaT  37.79 
 
 		 403 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0237926  normal  0.409513 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2271  aminotransferase AlaT  35.47 
 
 		 406 aa  228  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0597182  normal  0.143817 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>