More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3725 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3725  ABC transporter related protein  100 
 
 		 249 aa  486  1e-136  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2731  ABC transporter related  49.6 
 
 		 255 aa  222  4.9999999999999996e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4277  ABC transporter related protein  47.83 
 
 		 262 aa  218  5e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4783  ABC transporter related  53.59 
 
 		 263 aa  217  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.05 
 
 		 253 aa  201  9.999999999999999e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  41.34 
 
 		 260 aa  199  5e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3790  ABC transporter related  44.73 
 
 		 262 aa  195  6e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00500294  normal  0.911746 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2708  ABC transporter related  51.04 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2322  ABC transporter related protein  48.07 
 
 		 261 aa  193  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  39.2 
 
 		 266 aa  194  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3736  ABC transporter-related protein  42.19 
 
 		 311 aa  193  3e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.652525 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  46.03 
 
 		 536 aa  191  9e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21290  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  48.28 
 
 		 257 aa  191  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3280  ABC transporter related  38.65 
 
 		 326 aa  191  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2099  ABC transporter related  43.33 
 
 		 261 aa  189  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  41.63 
 
 		 268 aa  189  5e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4490  ABC transporter, ATPase subunit  45.78 
 
 		 265 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0876356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1424  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  35.08 
 
 		 251 aa  187  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000297439  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0840  ABC transporter related  37.85 
 
 		 321 aa  186  4e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3182  ABC transporter related  37.85 
 
 		 321 aa  186  4e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1033  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.85 
 
 		 285 aa  185  6e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  37.8 
 
 		 258 aa  185  6e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0867  ABC transporter related  44.98 
 
 		 261 aa  184  9e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.468249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1348  ABC transporter related  44.98 
 
 		 261 aa  184  9e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893482  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1330  ABC transporter related  44.98 
 
 		 261 aa  184  9e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4086  ABC transporter related  37.35 
 
 		 279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.778722 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3382  ABC transporter related  38.15 
 
 		 308 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3884  ABC transporter related  44.62 
 
 		 267 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2963  ABC transporter related  37.75 
 
 		 293 aa  182  3e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0443  ABC transporter related  46.61 
 
 		 257 aa  182  4.0000000000000006e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.152213 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04360  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  46.58 
 
 		 285 aa  182  5.0000000000000004e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1116  ABC transporter related  40.66 
 
 		 307 aa  181  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2599  ABC transporter related  43.03 
 
 		 254 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5060  ABC transporter related protein  45.76 
 
 		 264 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17610  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  48.31 
 
 		 251 aa  179  2.9999999999999997e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0432  ABC transporter related  35.14 
 
 		 262 aa  179  4e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  41.03 
 
 		 409 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0760  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.36 
 
 		 271 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1095  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  38.82 
 
 		 262 aa  178  8e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.927351  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5100  ABC transporter related  39.84 
 
 		 253 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130853  normal  0.02881 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  39.57 
 
 		 418 aa  177  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0712  ABC transporter-related protein  43.51 
 
 		 324 aa  177  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  43.57 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3153  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  44.35 
 
 		 263 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1214  ABC transporter related  42.91 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.719028  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1898  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  44.35 
 
 		 265 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303699  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2035  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  44.35 
 
 		 263 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3192  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  44.35 
 
 		 265 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1413  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  43.2 
 
 		 295 aa  176  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0874  ABC transporter related  35.74 
 
 		 269 aa  176  3e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0878  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  44.35 
 
 		 265 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.382345  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2712  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  44.35 
 
 		 265 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203934  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2273  ABC transporter related  41.43 
 
 		 254 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.788065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1642  ABC transporter related protein  41.7 
 
 		 274 aa  176  4e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4222  ABC transporter related  43.1 
 
 		 254 aa  176  4e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2653  ABC transporter related protein  41.77 
 
 		 275 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.015626  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  38.43 
 
 		 264 aa  173  1.9999999999999998e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4240  ABC transporter related  41.81 
 
 		 285 aa  173  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0187  ABC transporter related  37.6 
 
 		 275 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184625  normal  0.796471 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  36.51 
 
 		 455 aa  173  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2164  ABC transporter related  36.78 
 
 		 270 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04153  iron-dicitrate transporter subunit  40.48 
 
 		 255 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4864  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  40.48 
 
 		 255 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3713  ABC transporter related protein  40.48 
 
 		 255 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04116  hypothetical protein  40.48 
 
 		 255 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2492  ABC transporter related  41.67 
 
 		 419 aa  172  3.9999999999999995e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0593  ABC transporter-like  41.92 
 
 		 262 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1009  ABC transporter related  36.55 
 
 		 297 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0975  ABC transporter related  36.55 
 
 		 297 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0997  ABC transporter related  36.55 
 
 		 297 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0652  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, ATP-binding protein  41.35 
 
 		 274 aa  172  5.999999999999999e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0686  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, ATP-binding protein  41.35 
 
 		 274 aa  172  5.999999999999999e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0739  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  40.08 
 
 		 255 aa  171  9e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  39.92 
 
 		 270 aa  171  9e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23980  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  47.79 
 
 		 339 aa  171  9e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.862389 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4566  ABC transporter related  42.5 
 
 		 280 aa  171  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  43.35 
 
 		 490 aa  171  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 		 264 aa  170  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  38.43 
 
 		 405 aa  169  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3279  ABC transporter related  44.3 
 
 		 262 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4079  ABC transporter related  43.28 
 
 		 268 aa  169  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.465594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3366  ABC transporter related  36.14 
 
 		 297 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2416  iron ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.3 
 
 		 262 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.484616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0685  ABC transporter related  40.26 
 
 		 265 aa  169  4e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1138  ABC transporter component  41.57 
 
 		 266 aa  169  4e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.92157  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1927  ABC transporter related  43.67 
 
 		 262 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0701632 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0442  ABC transporter related  38.89 
 
 		 261 aa  169  4e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0670  ABC transporter related  40.26 
 
 		 265 aa  169  4e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  32.57 
 
 		 266 aa  169  5e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2584  ABC transporter related  46.47 
 
 		 273 aa  169  5e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2100  ABC transporter-related protein  41.47 
 
 		 262 aa  169  5e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3914  ABC transporter related  47.86 
 
 		 274 aa  168  7e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00146418  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  44.2 
 
 		 424 aa  168  9e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_590  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, ATPase component  39.66 
 
 		 275 aa  168  9e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.139681  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5102  ABC transporter  39.48 
 
 		 259 aa  168  9e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0622  ABC transporter related  39.66 
 
 		 275 aa  167  1e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.258343  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0404  ABC transporter related  38.75 
 
 		 283 aa  167  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0136  ABC transporter related  37.5 
 
 		 272 aa  166  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3529  ABC transporter related  39.84 
 
 		 260 aa  167  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2793  ABC transporter related  42.62 
 
 		 414 aa  166  2e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>