More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0027 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0027  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  100 
 
 
308 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.905993  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1055  Mg2 transporter protein CorA family protein  39.68 
 
 
310 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0663  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  39.03 
 
 
310 aa  251  1e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2215  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  45.18 
 
 
315 aa  250  3e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00295785  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0156  transporter  43.91 
 
 
311 aa  248  8e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2662  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  43.69 
 
 
312 aa  245  6e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2406  Mg2 transporter protein CorA family protein  42.95 
 
 
312 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1881  Mg2 transporter protein CorA family protein  42.58 
 
 
312 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000406477  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1539  Mg2 transporter protein CorA family protein  42.12 
 
 
313 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000914298  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3146  Mg2 transporter protein CorA family protein  43.67 
 
 
311 aa  238  6.999999999999999e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.896486  normal  0.696922 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0484  Mg2 transporter protein CorA family protein  42.17 
 
 
314 aa  238  1e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2925  Mg2+ transporter protein, CorA-like  41.75 
 
 
310 aa  238  1e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00031498  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2001  Mg2 transporter protein CorA family protein  44.41 
 
 
310 aa  237  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000539892  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1903  magnesium transporter CorA family protein  41.4 
 
 
313 aa  228  9e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00149373  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2050  magnesium transporter cora family protein  41.4 
 
 
313 aa  228  9e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.313249  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2083  magnesium transporter, CorA family  41.4 
 
 
313 aa  228  9e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1900  Mg2 transporter protein CorA family protein  40.84 
 
 
313 aa  227  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000765251  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1866  magnesium and cobalt transport protein  41.16 
 
 
313 aa  227  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000280155  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1856  magnesium and cobalt transport protein  41.4 
 
 
313 aa  227  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3269  magnesium transporter, CorA family  40.84 
 
 
313 aa  226  3e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.639337  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2151  magnesium transporter, CorA family  41.16 
 
 
313 aa  226  3e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0239499  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2040  magnesium transporter, CorA family  40.84 
 
 
313 aa  226  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0746182  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2119  magnesium transporter CorA family protein  42.16 
 
 
295 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.153353  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2452  magnesium and cobalt transporter  45.49 
 
 
314 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.920957  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0023  Mg2 transporter protein CorA family protein  36.77 
 
 
310 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2767  putative cation transporter  45.14 
 
 
314 aa  219  5e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0994122  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3494  Mg2 transporter protein CorA family protein  39 
 
 
316 aa  218  7.999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000281654  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2211  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  38.64 
 
 
310 aa  209  3e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0326  Mg2+ and Co2+ transporter  35.46 
 
 
316 aa  199  5e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1185  Mg2 transporter protein CorA family protein  38.06 
 
 
308 aa  194  2e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0715  transporter  36.74 
 
 
306 aa  190  2e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0409266 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2252  Mg2 transporter protein CorA family protein  34.52 
 
 
310 aa  189  4e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000868965  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1711  magnesium transporter CorA family protein  34.88 
 
 
314 aa  188  1e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000354996  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4695  Mg2 transporter protein CorA family protein  36.94 
 
 
312 aa  187  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.551554  normal  0.0119033 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1723  Mg2+ and Co2+ transporter  36.54 
 
 
314 aa  186  3e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00210024  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06390  Mg2+/Co2+ transporter  35.12 
 
 
319 aa  183  3e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.139821  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11050  Mg2+/Co2+ transporter  35.12 
 
 
323 aa  181  2e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0387037  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1715  hypothetical protein  33.01 
 
 
314 aa  176  3e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.014259  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0242  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  34.82 
 
 
308 aa  176  4e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.291265  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1574  cationic transporter  38.27 
 
 
274 aa  150  4e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0474991  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1967  CorA family protein  36.96 
 
 
315 aa  145  1e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00999125  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3219  magnesium and cobalt transport protein, putative  29.75 
 
 
313 aa  140  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2823  Mg2 transporter protein CorA family protein  29.75 
 
 
313 aa  140  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.714315  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0019  Mg2 transporter protein CorA family protein  28.11 
 
 
303 aa  137  2e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2402  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  39.59 
 
 
314 aa  124  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0013956  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2448  Mg2 transporter protein CorA family protein  39.59 
 
 
314 aa  124  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000474618  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1826  Mg2+ and Co2+ transporter-like protein  26.79 
 
 
305 aa  119  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0690  divalent cation transport-related protein  29.9 
 
 
293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0846569  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2822  Mg2 transporter protein CorA family protein  27.11 
 
 
311 aa  105  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.601446 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3218  magnesium and cobalt transport protein, putative  27.11 
 
 
311 aa  105  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1657  Mg2+ transporter protein, CorA-like  28.09 
 
 
344 aa  103  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.180392 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2525  Mg2+ transporter protein, CorA-like  24.19 
 
 
309 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0224722  normal  0.599163 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0003  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.21 
 
 
317 aa  95.5  9e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00000548112  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2224  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.9 
 
 
291 aa  91.3  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000656607  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0170  Mg2+ and Co2+ transporter  24.81 
 
 
304 aa  89.4  7e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0476  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.11 
 
 
316 aa  89.4  8e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2618  Mg2+ transporter protein, CorA-like  24.29 
 
 
307 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2717  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  24.2 
 
 
303 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0360  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.77 
 
 
316 aa  87.8  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.126315  hitchhiker  0.00222475 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2955  magnesium/cobalt transporter CorA family protein  23.84 
 
 
303 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.045506 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1928  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.82 
 
 
362 aa  87.4  3e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185921  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1559  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.36 
 
 
316 aa  86.3  6e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1071  Mg2+ and Co2+ transporter  26.85 
 
 
301 aa  85.9  7e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2768  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.73 
 
 
354 aa  84  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2267  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.07 
 
 
360 aa  83.6  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0974553 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2060  Mg2+ and Co2+ transporter  25.86 
 
 
307 aa  82.4  0.000000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1006  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.04 
 
 
547 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3662  magnesium and cobalt transport protein  32.74 
 
 
358 aa  80.5  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0696  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.68 
 
 
355 aa  80.5  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181573  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0560  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.91 
 
 
321 aa  80.5  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0376  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.26 
 
 
351 aa  80.1  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00229946  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3419  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.38 
 
 
355 aa  79  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222754  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1527  Mg2+ and Co2+ transporter  30.57 
 
 
302 aa  77.8  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00743319  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0359  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.21 
 
 
351 aa  76.6  0.0000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000101398  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3012  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.56 
 
 
354 aa  75.9  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.815439  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0795  magnesium/cobalt transporter CorA  22.45 
 
 
380 aa  75.5  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4037  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.93 
 
 
327 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0252  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.48 
 
 
353 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000575717 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.91 
 
 
353 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0176371  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4989  magnesium and cobalt transport protein CorA  21.91 
 
 
376 aa  73.2  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  19.87 
 
 
316 aa  73.2  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0556  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.56 
 
 
354 aa  73.2  0.000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0785  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.21 
 
 
332 aa  73.2  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0685097  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1521  magnesium/cobalt transporter CorA  21.2 
 
 
375 aa  72  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.954015 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0433  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.84 
 
 
356 aa  70.5  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4178  magnesium and cobalt transport protein CorA  20.6 
 
 
322 aa  70.9  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2085  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.26 
 
 
353 aa  70.1  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2983  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.41 
 
 
354 aa  70.1  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.23033  normal  0.025318 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2333  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.07 
 
 
387 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4182  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.47 
 
 
381 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10618  Magnesium and cobalt transport protein  24.74 
 
 
363 aa  70.1  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4221  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.47 
 
 
381 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2520  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.61 
 
 
357 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00107852  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1913  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.63 
 
 
375 aa  69.3  0.00000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2798  transporter, putative  25.49 
 
 
211 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00161167  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2713  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.95 
 
 
367 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3070  magnesium and cobalt transport protein CorA  21.31 
 
 
339 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0787  magnesium and cobalt transport protein CorA  21.71 
 
 
341 aa  68.2  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00324534  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0582  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.3 
 
 
354 aa  67  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000747796  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1416  magnesium/cobalt transporter CorA  23.53 
 
 
354 aa  67  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.623057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>