181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2525 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2525  Mg2+ transporter protein, CorA-like  100 
 
 		 309 aa  634    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0224722  normal  0.599163 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2618  Mg2+ transporter protein, CorA-like  68.4 
 
 		 307 aa  419  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2798  transporter, putative  94.79 
 
 		 211 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00161167  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2717  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  51.96 
 
 		 303 aa  325  7e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2955  magnesium/cobalt transporter CorA family protein  52.01 
 
 		 303 aa  322  4e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.045506 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1657  Mg2+ transporter protein, CorA-like  48.33 
 
 		 344 aa  275  1.0000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.180392 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0019  Mg2 transporter protein CorA family protein  36.67 
 
 		 303 aa  222  4.9999999999999996e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0663  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  27.63 
 
 		 310 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0326  Mg2+ and Co2+ transporter  27.52 
 
 		 316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0484  Mg2 transporter protein CorA family protein  23.86 
 
 		 314 aa  112  6e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3494  Mg2 transporter protein CorA family protein  26.48 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000281654  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2406  Mg2 transporter protein CorA family protein  24.64 
 
 		 312 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1900  Mg2 transporter protein CorA family protein  25.44 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000765251  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2119  magnesium transporter CorA family protein  25.44 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.153353  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1903  magnesium transporter CorA family protein  25.44 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00149373  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0156  transporter  27.34 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2050  magnesium transporter cora family protein  25.44 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.313249  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2040  magnesium transporter, CorA family  25.44 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0746182  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3269  magnesium transporter, CorA family  25.44 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.639337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2083  magnesium transporter, CorA family  25.44 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1856  magnesium and cobalt transport protein  25.44 
 
 		 313 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1539  Mg2 transporter protein CorA family protein  26.48 
 
 		 313 aa  103  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000914298  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1866  magnesium and cobalt transport protein  26.88 
 
 		 313 aa  103  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000280155  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2151  magnesium transporter, CorA family  26.88 
 
 		 313 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0239499  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2001  Mg2 transporter protein CorA family protein  27.17 
 
 		 310 aa  102  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000539892  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1881  Mg2 transporter protein CorA family protein  24.31 
 
 		 312 aa  102  7e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000406477  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2767  putative cation transporter  24.7 
 
 		 314 aa  99.8  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0994122  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2452  magnesium and cobalt transporter  24.7 
 
 		 314 aa  99.8  5e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.920957  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2215  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  23.91 
 
 		 315 aa  99  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00295785  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0027  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  24.19 
 
 		 308 aa  98.6  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.905993  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1055  Mg2 transporter protein CorA family protein  26.92 
 
 		 310 aa  97.4  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3146  Mg2 transporter protein CorA family protein  25.79 
 
 		 311 aa  96.7  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.896486  normal  0.696922 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1723  Mg2+ and Co2+ transporter  23 
 
 		 314 aa  95.9  8e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00210024  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1715  hypothetical protein  25.81 
 
 		 314 aa  95.5  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.014259  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0715  transporter  26.21 
 
 		 306 aa  90.1  4e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0409266 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11050  Mg2+/Co2+ transporter  26.53 
 
 		 323 aa  90.1  4e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0387037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2211  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  25.27 
 
 		 310 aa  88.6  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1185  Mg2 transporter protein CorA family protein  23.83 
 
 		 308 aa  85.9  7e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2662  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  24.02 
 
 		 312 aa  82.4  0.000000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2252  Mg2 transporter protein CorA family protein  21.72 
 
 		 310 aa  82.4  0.000000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000868965  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1711  magnesium transporter CorA family protein  22.65 
 
 		 314 aa  80.1  0.00000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000354996  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0242  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  24.3 
 
 		 308 aa  79.3  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.291265  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4695  Mg2 transporter protein CorA family protein  24.1 
 
 		 312 aa  76.6  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.551554  normal  0.0119033 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0023  Mg2 transporter protein CorA family protein  21.96 
 
 		 310 aa  75.9  0.0000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2925  Mg2+ transporter protein, CorA-like  22.73 
 
 		 310 aa  75.5  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00031498  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1574  cationic transporter  21.34 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0474991  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06390  Mg2+/Co2+ transporter  23.1 
 
 		 319 aa  73.6  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.139821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3905  Mg2+ transporter protein, CorA-like  44.87 
 
 		 461 aa  73.2  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1826  Mg2+ and Co2+ transporter-like protein  20.6 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1967  CorA family protein  21.03 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00999125  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2980  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  42.25 
 
 		 450 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.107621  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2402  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  23.89 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0013956  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2448  Mg2 transporter protein CorA family protein  23.89 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000474618  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1928  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.44 
 
 		 362 aa  62.8  0.000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185921  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0359  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.33 
 
 		 351 aa  62  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000101398  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0054  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.96 
 
 		 325 aa  61.2  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349471  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0376  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.43 
 
 		 351 aa  59.7  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00229946  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2182  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.68 
 
 		 327 aa  59.3  0.00000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.709225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3218  magnesium and cobalt transport protein, putative  23.31 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2822  Mg2 transporter protein CorA family protein  23.31 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.601446 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2333  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.32 
 
 		 387 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1371  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.1 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0933  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.97 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0646  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.97 
 
 		 353 aa  57  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0489  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.33 
 
 		 383 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2713  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.44 
 
 		 367 aa  56.6  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3219  magnesium and cobalt transport protein, putative  24.01 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2823  Mg2 transporter protein CorA family protein  24.01 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.714315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1189  magnesium/cobalt transporter CorA  32.38 
 
 		 365 aa  55.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2267  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.27 
 
 		 360 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0974553 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3070  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.41 
 
 		 339 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1416  magnesium/cobalt transporter CorA  28.87 
 
 		 354 aa  54.3  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.623057  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0137  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.97 
 
 		 368 aa  54.7  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3204  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.33 
 
 		 379 aa  54.7  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.648086  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2937  putative cobalt/magnesium uptake transporter  30.85 
 
 		 354 aa  53.9  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1041  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.44 
 
 		 348 aa  53.9  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.78816  normal  0.435904 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2060  Mg2+ and Co2+ transporter  20.82 
 
 		 307 aa  53.9  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3419  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.22 
 
 		 355 aa  54.3  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222754  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1738  magnesium and cobalt transport protein CorA  18.95 
 
 		 352 aa  53.9  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.277865 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4182  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.14 
 
 		 381 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2791  putative cobalt/magnesium uptake transporter  30.85 
 
 		 354 aa  53.9  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4221  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.14 
 
 		 381 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0795  magnesium/cobalt transporter CorA  34.52 
 
 		 380 aa  53.5  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2408  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.74 
 
 		 339 aa  53.1  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1484  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  43.55 
 
 		 273 aa  52.8  0.000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.182514  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4191  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.65 
 
 		 382 aa  52.4  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.259759  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0690  divalent cation transport-related protein  23.13 
 
 		 293 aa  52.4  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0846569  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1725  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.97 
 
 		 372 aa  51.6  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0173  magnesium and cobalt transport protein CorA  18.95 
 
 		 352 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2074  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.4 
 
 		 357 aa  50.4  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1811  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.13 
 
 		 333 aa  50.4  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0263  Mg2 transporter protein CorA family protein  21.99 
 
 		 300 aa  50.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.990966  normal  0.524479 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0787  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.88 
 
 		 341 aa  50.4  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00324534  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1399  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.43 
 
 		 354 aa  50.4  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1740  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.71 
 
 		 354 aa  49.7  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0003  magnesium and cobalt transport protein CorA  21.63 
 
 		 317 aa  49.7  0.00006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00000548112  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2520  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.27 
 
 		 357 aa  49.7  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00107852  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1870  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.41 
 
 		 363 aa  49.3  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3190  Mg2 transporter protein CorA family protein  26.92 
 
 		 332 aa  48.9  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.38171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2424  Mg2 transporter protein CorA family protein  22.94 
 
 		 318 aa  49.3  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>