200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_3218 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_3218  magnesium and cobalt transport protein, putative  100 
 
 
311 aa  633  1e-180  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2822  Mg2 transporter protein CorA family protein  100 
 
 
311 aa  633  1e-180  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.601446 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2823  Mg2 transporter protein CorA family protein  38.11 
 
 
313 aa  146  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.714315  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3219  magnesium and cobalt transport protein, putative  38.11 
 
 
313 aa  146  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2406  Mg2 transporter protein CorA family protein  27.3 
 
 
312 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1185  Mg2 transporter protein CorA family protein  29.59 
 
 
308 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3146  Mg2 transporter protein CorA family protein  27.21 
 
 
311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.896486  normal  0.696922 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2151  magnesium transporter, CorA family  25.85 
 
 
313 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0239499  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1866  magnesium and cobalt transport protein  25.85 
 
 
313 aa  119  6e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000280155  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1881  Mg2 transporter protein CorA family protein  25.5 
 
 
312 aa  119  7e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000406477  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2119  magnesium transporter CorA family protein  25.59 
 
 
295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.153353  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1903  magnesium transporter CorA family protein  25.76 
 
 
313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00149373  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1856  magnesium and cobalt transport protein  25.76 
 
 
313 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2050  magnesium transporter cora family protein  25.76 
 
 
313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.313249  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3269  magnesium transporter, CorA family  25.76 
 
 
313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.639337  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2040  magnesium transporter, CorA family  25.76 
 
 
313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0746182  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2083  magnesium transporter, CorA family  25.76 
 
 
313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1539  Mg2 transporter protein CorA family protein  25.25 
 
 
313 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000914298  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1900  Mg2 transporter protein CorA family protein  25.76 
 
 
313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000765251  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2211  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  29.79 
 
 
310 aa  110  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0156  transporter  27.15 
 
 
311 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0242  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  26 
 
 
308 aa  106  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.291265  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0027  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  27.11 
 
 
308 aa  105  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.905993  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2215  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  24.05 
 
 
315 aa  104  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00295785  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4695  Mg2 transporter protein CorA family protein  25.42 
 
 
312 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.551554  normal  0.0119033 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0326  Mg2+ and Co2+ transporter  27.46 
 
 
316 aa  100  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1055  Mg2 transporter protein CorA family protein  23.26 
 
 
310 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0663  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  24.58 
 
 
310 aa  100  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2001  Mg2 transporter protein CorA family protein  24.57 
 
 
310 aa  100  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000539892  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2662  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  26.26 
 
 
312 aa  98.6  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0484  Mg2 transporter protein CorA family protein  23.39 
 
 
314 aa  97.1  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0715  transporter  24.44 
 
 
306 aa  94.4  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0409266 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2252  Mg2 transporter protein CorA family protein  24.6 
 
 
310 aa  93.2  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000868965  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1715  hypothetical protein  25.67 
 
 
314 aa  89.7  5e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.014259  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1723  Mg2+ and Co2+ transporter  22.97 
 
 
314 aa  87.4  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00210024  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3494  Mg2 transporter protein CorA family protein  24.75 
 
 
316 aa  87.4  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000281654  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2925  Mg2+ transporter protein, CorA-like  25.77 
 
 
310 aa  85.5  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00031498  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0023  Mg2 transporter protein CorA family protein  23.31 
 
 
310 aa  82.4  0.000000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1967  CorA family protein  26.32 
 
 
315 aa  81.3  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00999125  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11050  Mg2+/Co2+ transporter  24.67 
 
 
323 aa  80.5  0.00000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0387037  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2767  putative cation transporter  23.53 
 
 
314 aa  79  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0994122  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2452  magnesium and cobalt transporter  23.53 
 
 
314 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.920957  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1711  magnesium transporter CorA family protein  22.48 
 
 
314 aa  75.9  0.0000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000354996  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1574  cationic transporter  24.27 
 
 
274 aa  73.6  0.000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0474991  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06390  Mg2+/Co2+ transporter  24 
 
 
319 aa  66.2  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.139821  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3190  Mg2 transporter protein CorA family protein  21.95 
 
 
332 aa  65.9  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.38171  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2402  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  27.15 
 
 
314 aa  65.9  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0013956  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2448  Mg2 transporter protein CorA family protein  27.15 
 
 
314 aa  65.9  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000474618  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0690  divalent cation transport-related protein  22.26 
 
 
293 aa  63.5  0.000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0846569  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1913  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.09 
 
 
375 aa  63.5  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1521  magnesium/cobalt transporter CorA  25.37 
 
 
375 aa  60.5  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.954015 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2525  Mg2+ transporter protein, CorA-like  23.31 
 
 
309 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0224722  normal  0.599163 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1826  Mg2+ and Co2+ transporter-like protein  20.66 
 
 
305 aa  58.9  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0019  Mg2 transporter protein CorA family protein  20.38 
 
 
303 aa  57.4  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3204  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.33 
 
 
379 aa  57  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.648086  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1740  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.9 
 
 
354 aa  56.6  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2665  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.68 
 
 
390 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.111176 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0252  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.91 
 
 
353 aa  55.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000575717 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2074  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.15 
 
 
357 aa  55.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2955  magnesium/cobalt transporter CorA family protein  20.77 
 
 
303 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.045506 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2608  Mg2+/Co2+ transporter  25.62 
 
 
331 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.301217  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.65 
 
 
353 aa  54.7  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0176371  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0675  Mg2 transporter protein CorA family protein  24.69 
 
 
324 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1266  Fis family transcriptional regulator  25.62 
 
 
331 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.336858 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4292  Mg2 transporter protein CorA family protein  25.61 
 
 
334 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0017  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.55 
 
 
317 aa  53.9  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.692068  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0668  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.07 
 
 
385 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0284032  normal  0.71068 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0648  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.07 
 
 
385 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2717  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  21.29 
 
 
303 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0560  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.67 
 
 
321 aa  53.1  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3905  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.97 
 
 
334 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3613  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.97 
 
 
334 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0245  Mg2 transporter protein CorA family protein  22.02 
 
 
319 aa  52  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0279376  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1997  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.89 
 
 
395 aa  52  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.223184  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2333  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.34 
 
 
387 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0470  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.77 
 
 
320 aa  51.6  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0795  magnesium/cobalt transporter CorA  27.78 
 
 
380 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1189  magnesium/cobalt transporter CorA  34.18 
 
 
365 aa  51.2  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1617  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.77 
 
 
354 aa  51.2  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3662  magnesium and cobalt transport protein  30.38 
 
 
358 aa  51.2  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0789  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  22.05 
 
 
322 aa  51.2  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.957399  normal  0.0628578 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2267  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.77 
 
 
360 aa  50.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0974553 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.09 
 
 
316 aa  50.4  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2374  magnesium and cobalt transport protein CorA  30 
 
 
331 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.150786  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3221  magnesium and cobalt transport protein, putative  22.7 
 
 
303 aa  50.4  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2825  Mg2 transporter protein CorA family protein  22.7 
 
 
304 aa  50.4  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.756576  normal  0.926767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2408  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.95 
 
 
339 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518253  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0003  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.96 
 
 
317 aa  50.1  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00000548112  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0436  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.28 
 
 
354 aa  50.1  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2837  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.34 
 
 
331 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129191  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1657  Mg2+ transporter protein, CorA-like  23.56 
 
 
344 aa  50.1  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.180392 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3070  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.95 
 
 
339 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0787  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.46 
 
 
341 aa  49.7  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00324534  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0400  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  21.36 
 
 
316 aa  49.3  0.00008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.373431  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2486  Mg2 transporter protein CorA family protein  22.69 
 
 
321 aa  49.3  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0125813  normal  0.0747701 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0783  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.91 
 
 
316 aa  49.3  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1967  Mg2 transporter protein CorA family protein  22.46 
 
 
324 aa  49.3  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2768  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.5 
 
 
354 aa  48.5  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0800  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  31.43 
 
 
344 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0550  Mg2 transporter protein CorA family protein  23.32 
 
 
325 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.361398  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>