155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2618 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2618  Mg2+ transporter protein, CorA-like  100 
 
 		 307 aa  628  1e-179  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2525  Mg2+ transporter protein, CorA-like  68.4 
 
 		 309 aa  437  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0224722  normal  0.599163 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2717  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  54.58 
 
 		 303 aa  338  5e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2955  magnesium/cobalt transporter CorA family protein  53.92 
 
 		 303 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.045506 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2798  transporter, putative  72.25 
 
 		 211 aa  314  9e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00161167  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1657  Mg2+ transporter protein, CorA-like  50.16 
 
 		 344 aa  285  7e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.180392 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0019  Mg2 transporter protein CorA family protein  36.4 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0326  Mg2+ and Co2+ transporter  27.13 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0663  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  25.82 
 
 		 310 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0484  Mg2 transporter protein CorA family protein  26.26 
 
 		 314 aa  105  8e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3494  Mg2 transporter protein CorA family protein  29.06 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000281654  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2406  Mg2 transporter protein CorA family protein  24.03 
 
 		 312 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2252  Mg2 transporter protein CorA family protein  24.32 
 
 		 310 aa  100  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000868965  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1881  Mg2 transporter protein CorA family protein  23.94 
 
 		 312 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000406477  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1866  magnesium and cobalt transport protein  24.09 
 
 		 313 aa  98.6  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000280155  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0027  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  24.29 
 
 		 308 aa  98.2  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.905993  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2151  magnesium transporter, CorA family  24.09 
 
 		 313 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0239499  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1903  magnesium transporter CorA family protein  24.63 
 
 		 313 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00149373  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2001  Mg2 transporter protein CorA family protein  25.26 
 
 		 310 aa  97.8  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000539892  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2050  magnesium transporter cora family protein  24.63 
 
 		 313 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.313249  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2083  magnesium transporter, CorA family  24.63 
 
 		 313 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1539  Mg2 transporter protein CorA family protein  23.36 
 
 		 313 aa  97.8  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000914298  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1900  Mg2 transporter protein CorA family protein  24.63 
 
 		 313 aa  97.8  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000765251  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3146  Mg2 transporter protein CorA family protein  25.86 
 
 		 311 aa  97.8  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.896486  normal  0.696922 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2040  magnesium transporter, CorA family  24.25 
 
 		 313 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0746182  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3269  magnesium transporter, CorA family  24.25 
 
 		 313 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.639337  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1856  magnesium and cobalt transport protein  24.25 
 
 		 313 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0156  transporter  24.46 
 
 		 311 aa  96.3  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0242  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  24.92 
 
 		 308 aa  96.3  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.291265  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1185  Mg2 transporter protein CorA family protein  25.57 
 
 		 308 aa  95.9  8e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2119  magnesium transporter CorA family protein  24.6 
 
 		 295 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.153353  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2215  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  23.89 
 
 		 315 aa  89  8e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00295785  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1055  Mg2 transporter protein CorA family protein  25.44 
 
 		 310 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2452  magnesium and cobalt transporter  23.53 
 
 		 314 aa  86.7  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.920957  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2767  putative cation transporter  23.53 
 
 		 314 aa  86.7  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0994122  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1715  hypothetical protein  24.19 
 
 		 314 aa  84.3  0.000000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.014259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11050  Mg2+/Co2+ transporter  22.64 
 
 		 323 aa  83.6  0.000000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0387037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4695  Mg2 transporter protein CorA family protein  28.21 
 
 		 312 aa  82.8  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.551554  normal  0.0119033 
 
 
-
 
NC_002950  PG0715  transporter  24.6 
 
 		 306 aa  82.4  0.000000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0409266 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2211  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  24.72 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2662  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  23.51 
 
 		 312 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0023  Mg2 transporter protein CorA family protein  26.59 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1711  magnesium transporter CorA family protein  20.56 
 
 		 314 aa  75.5  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000354996  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1723  Mg2+ and Co2+ transporter  21.69 
 
 		 314 aa  75.5  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00210024  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1574  cationic transporter  24.44 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0474991  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06390  Mg2+/Co2+ transporter  22.46 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.139821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2925  Mg2+ transporter protein, CorA-like  22.63 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00031498  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2980  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  44.59 
 
 		 450 aa  70.1  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.107621  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3905  Mg2+ transporter protein, CorA-like  48.39 
 
 		 461 aa  67.8  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3219  magnesium and cobalt transport protein, putative  27.49 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2823  Mg2 transporter protein CorA family protein  27.49 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.714315  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1967  CorA family protein  22.03 
 
 		 315 aa  65.9  0.0000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00999125  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1826  Mg2+ and Co2+ transporter-like protein  19.78 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1928  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.56 
 
 		 362 aa  61.2  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185921  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2074  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.95 
 
 		 357 aa  59.7  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2713  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.67 
 
 		 367 aa  59.3  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0787  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.86 
 
 		 341 aa  58.9  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00324534  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4191  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.33 
 
 		 382 aa  58.9  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.259759  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1997  magnesium and cobalt transport protein CorA  25 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.223184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0795  magnesium/cobalt transporter CorA  25 
 
 		 380 aa  56.6  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0137  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.13 
 
 		 368 aa  56.2  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0560  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.02 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2333  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.89 
 
 		 387 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1811  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.26 
 
 		 333 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1189  magnesium/cobalt transporter CorA  35.56 
 
 		 365 aa  54.7  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0170  Mg2+ and Co2+ transporter  22.31 
 
 		 304 aa  54.3  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3419  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.08 
 
 		 355 aa  55.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222754  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3218  magnesium and cobalt transport protein, putative  21.88 
 
 		 311 aa  54.7  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2822  Mg2 transporter protein CorA family protein  21.88 
 
 		 311 aa  54.7  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.601446 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1992  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.77 
 
 		 360 aa  53.5  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2060  Mg2+ and Co2+ transporter  21.31 
 
 		 307 aa  53.5  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2267  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.17 
 
 		 360 aa  53.1  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0974553 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3190  Mg2 transporter protein CorA family protein  26.43 
 
 		 332 aa  52.8  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.38171  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3204  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.17 
 
 		 379 aa  52.8  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.648086  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1725  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.08 
 
 		 372 aa  52.4  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2085  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.63 
 
 		 353 aa  52.4  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0646  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.35 
 
 		 353 aa  52.4  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0668  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.29 
 
 		 385 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0284032  normal  0.71068 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0150  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  24.5 
 
 		 345 aa  51.2  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2182  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.29 
 
 		 327 aa  51.2  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.709225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0648  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.29 
 
 		 385 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0359  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.48 
 
 		 351 aa  50.8  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000101398  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0376  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.52 
 
 		 351 aa  50.8  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00229946  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2665  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.22 
 
 		 390 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.111176 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1740  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.11 
 
 		 354 aa  50.1  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2402  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  22.12 
 
 		 314 aa  49.3  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0013956  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2448  Mg2 transporter protein CorA family protein  22.12 
 
 		 314 aa  49.3  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000474618  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1521  magnesium/cobalt transporter CorA  36.51 
 
 		 375 aa  49.3  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.954015 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2424  Mg2 transporter protein CorA family protein  23.81 
 
 		 318 aa  49.3  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2937  putative cobalt/magnesium uptake transporter  35.06 
 
 		 354 aa  48.9  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2791  putative cobalt/magnesium uptake transporter  35.06 
 
 		 354 aa  48.9  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.99 
 
 		 316 aa  48.9  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3662  magnesium and cobalt transport protein  21.77 
 
 		 358 aa  48.9  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0933  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.22 
 
 		 325 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0003  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.89 
 
 		 317 aa  48.1  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00000548112  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4037  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.23 
 
 		 327 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0054  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.26 
 
 		 325 aa  48.1  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349471  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0690  divalent cation transport-related protein  20.65 
 
 		 293 aa  47  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0846569  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0785  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.03 
 
 		 332 aa  47  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0685097  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0783  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.58 
 
 		 316 aa  46.6  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>