162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1657 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1657  Mg2+ transporter protein, CorA-like  100 
 
 
344 aa  708    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.180392 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2525  Mg2+ transporter protein, CorA-like  48.33 
 
 
309 aa  288  8e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0224722  normal  0.599163 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2618  Mg2+ transporter protein, CorA-like  50.16 
 
 
307 aa  281  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2717  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  43.58 
 
 
303 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2955  magnesium/cobalt transporter CorA family protein  43.9 
 
 
303 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.045506 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0019  Mg2 transporter protein CorA family protein  40.45 
 
 
303 aa  228  1e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2798  transporter, putative  53.76 
 
 
211 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00161167  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0663  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  30.98 
 
 
310 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2406  Mg2 transporter protein CorA family protein  30.25 
 
 
312 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2151  magnesium transporter, CorA family  30.52 
 
 
313 aa  123  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0239499  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2119  magnesium transporter CorA family protein  30.52 
 
 
295 aa  123  6e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.153353  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1866  magnesium and cobalt transport protein  30.52 
 
 
313 aa  123  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000280155  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1856  magnesium and cobalt transport protein  30.52 
 
 
313 aa  122  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1903  magnesium transporter CorA family protein  30.52 
 
 
313 aa  122  7e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00149373  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2050  magnesium transporter cora family protein  30.52 
 
 
313 aa  122  7e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.313249  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2083  magnesium transporter, CorA family  30.52 
 
 
313 aa  122  7e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2040  magnesium transporter, CorA family  30.52 
 
 
313 aa  122  8e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0746182  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3269  magnesium transporter, CorA family  30.52 
 
 
313 aa  122  8e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.639337  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1900  Mg2 transporter protein CorA family protein  30.52 
 
 
313 aa  122  8e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000765251  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1539  Mg2 transporter protein CorA family protein  30.12 
 
 
313 aa  119  7e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000914298  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0027  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  28.09 
 
 
308 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.905993  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1881  Mg2 transporter protein CorA family protein  29.39 
 
 
312 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000406477  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3146  Mg2 transporter protein CorA family protein  30.36 
 
 
311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.896486  normal  0.696922 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3494  Mg2 transporter protein CorA family protein  30.25 
 
 
316 aa  110  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000281654  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2215  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  28.57 
 
 
315 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00295785  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0326  Mg2+ and Co2+ transporter  28.41 
 
 
316 aa  107  3e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2767  putative cation transporter  29.08 
 
 
314 aa  106  5e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0994122  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2452  magnesium and cobalt transporter  29.08 
 
 
314 aa  106  5e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.920957  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4695  Mg2 transporter protein CorA family protein  30.22 
 
 
312 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.551554  normal  0.0119033 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2252  Mg2 transporter protein CorA family protein  27.27 
 
 
310 aa  104  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000868965  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2001  Mg2 transporter protein CorA family protein  39.04 
 
 
310 aa  103  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000539892  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0156  transporter  29.72 
 
 
311 aa  102  8e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0484  Mg2 transporter protein CorA family protein  27.51 
 
 
314 aa  100  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06390  Mg2+/Co2+ transporter  26.82 
 
 
319 aa  100  4e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.139821  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1055  Mg2 transporter protein CorA family protein  29.44 
 
 
310 aa  100  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1715  hypothetical protein  28.4 
 
 
314 aa  97.1  4e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.014259  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0023  Mg2 transporter protein CorA family protein  27.39 
 
 
310 aa  95.1  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0715  transporter  26.98 
 
 
306 aa  94.4  3e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0409266 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2662  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  26.28 
 
 
312 aa  94.4  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1185  Mg2 transporter protein CorA family protein  28.68 
 
 
308 aa  92.4  9e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11050  Mg2+/Co2+ transporter  23.17 
 
 
323 aa  91.3  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0387037  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1574  cationic transporter  27.02 
 
 
274 aa  88.6  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0474991  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2925  Mg2+ transporter protein, CorA-like  28.16 
 
 
310 aa  88.6  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00031498  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0242  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  26.64 
 
 
308 aa  87.4  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.291265  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2980  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  44.94 
 
 
450 aa  83.6  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.107621  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1723  Mg2+ and Co2+ transporter  24.49 
 
 
314 aa  83.2  0.000000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00210024  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3905  Mg2+ transporter protein, CorA-like  40.62 
 
 
461 aa  81.6  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1711  magnesium transporter CorA family protein  22.67 
 
 
314 aa  77.8  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000354996  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2211  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  25.78 
 
 
310 aa  77.4  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3219  magnesium and cobalt transport protein, putative  27.63 
 
 
313 aa  75.1  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2823  Mg2 transporter protein CorA family protein  27.63 
 
 
313 aa  75.1  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.714315  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3218  magnesium and cobalt transport protein, putative  23.56 
 
 
311 aa  62.4  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0690  divalent cation transport-related protein  25.7 
 
 
293 aa  62.4  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0846569  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2822  Mg2 transporter protein CorA family protein  23.56 
 
 
311 aa  62.4  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.601446 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2424  Mg2 transporter protein CorA family protein  24.86 
 
 
318 aa  60.8  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2713  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.48 
 
 
367 aa  58.5  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1527  Mg2+ and Co2+ transporter  26.53 
 
 
302 aa  57  0.0000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00743319  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0795  magnesium/cobalt transporter CorA  27.71 
 
 
380 aa  56.2  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2937  putative cobalt/magnesium uptake transporter  30.21 
 
 
354 aa  56.2  0.0000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1725  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.65 
 
 
372 aa  56.2  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2791  putative cobalt/magnesium uptake transporter  30.21 
 
 
354 aa  56.2  0.0000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3204  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.67 
 
 
379 aa  54.7  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.648086  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0376  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.87 
 
 
351 aa  55.1  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00229946  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2182  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.47 
 
 
327 aa  54.3  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.709225  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2267  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.07 
 
 
360 aa  53.9  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0974553 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1967  CorA family protein  23.79 
 
 
315 aa  53.5  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00999125  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1071  Mg2+ and Co2+ transporter  22.59 
 
 
301 aa  53.5  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0646  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.88 
 
 
353 aa  53.1  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0359  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.84 
 
 
351 aa  53.5  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000101398  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0875  magnesium transporter CorA family protein  30.86 
 
 
305 aa  52.8  0.000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00265274  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.89 
 
 
316 aa  52  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1826  Mg2+ and Co2+ transporter-like protein  20.23 
 
 
305 aa  52.4  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0360  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.69 
 
 
316 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.126315  hitchhiker  0.00222475 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0150  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  23.68 
 
 
345 aa  51.6  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1559  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.69 
 
 
316 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2853  magnesium/cobalt transporter CorA  30.56 
 
 
320 aa  51.2  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2609  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.7 
 
 
320 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3052  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.56 
 
 
320 aa  51.2  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3662  magnesium and cobalt transport protein  28 
 
 
358 aa  50.8  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2837  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.48 
 
 
331 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129191  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1913  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.43 
 
 
375 aa  50.8  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2129  Mg2 transporter protein CorA family protein  32.65 
 
 
315 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0400102  normal  0.185773 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3019  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.7 
 
 
320 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.657438  normal  0.513335 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1189  magnesium/cobalt transporter CorA  31.96 
 
 
365 aa  50.4  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2774  magnesium/cobalt transporter CorA  28.7 
 
 
320 aa  50.1  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.227712 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1912  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.85 
 
 
374 aa  49.7  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107117  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0476  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.95 
 
 
316 aa  50.1  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0003  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.2 
 
 
317 aa  49.7  0.00008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00000548112  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1371  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.48 
 
 
387 aa  48.9  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1740  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.8 
 
 
354 aa  48.9  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1997  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.97 
 
 
395 aa  48.9  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.223184  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4178  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.45 
 
 
322 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2333  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.68 
 
 
387 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1617  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.1 
 
 
354 aa  48.1  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1811  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.41 
 
 
333 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0433  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.88 
 
 
356 aa  47.8  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1675  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.53 
 
 
314 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0933  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.8 
 
 
325 aa  47.8  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1870  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.44 
 
 
363 aa  47.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1521  magnesium/cobalt transporter CorA  26.45 
 
 
375 aa  47  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.954015 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>