More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2767 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2767  putative cation transporter  100 
 
 
314 aa  634    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0994122  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2452  magnesium and cobalt transporter  99.36 
 
 
314 aa  629  1e-179  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.920957  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2406  Mg2 transporter protein CorA family protein  48.25 
 
 
312 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1881  Mg2 transporter protein CorA family protein  47.94 
 
 
312 aa  311  9e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000406477  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2001  Mg2 transporter protein CorA family protein  51.59 
 
 
310 aa  310  2e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000539892  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2215  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  50.47 
 
 
315 aa  307  1.0000000000000001e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00295785  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0156  transporter  50 
 
 
311 aa  305  6e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1539  Mg2 transporter protein CorA family protein  47.63 
 
 
313 aa  300  3e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000914298  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0326  Mg2+ and Co2+ transporter  47.17 
 
 
316 aa  297  2e-79  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3146  Mg2 transporter protein CorA family protein  49.04 
 
 
311 aa  287  1e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.896486  normal  0.696922 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1900  Mg2 transporter protein CorA family protein  46.06 
 
 
313 aa  287  2e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000765251  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3269  magnesium transporter, CorA family  46.06 
 
 
313 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.639337  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1903  magnesium transporter CorA family protein  46.06 
 
 
313 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00149373  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2040  magnesium transporter, CorA family  46.06 
 
 
313 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0746182  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2083  magnesium transporter, CorA family  46.06 
 
 
313 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2050  magnesium transporter cora family protein  46.06 
 
 
313 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.313249  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1866  magnesium and cobalt transport protein  45.74 
 
 
313 aa  285  5.999999999999999e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000280155  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1856  magnesium and cobalt transport protein  46.06 
 
 
313 aa  285  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2151  magnesium transporter, CorA family  45.43 
 
 
313 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0239499  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2662  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  49.84 
 
 
312 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0484  Mg2 transporter protein CorA family protein  44.9 
 
 
314 aa  282  6.000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2119  magnesium transporter CorA family protein  46.8 
 
 
295 aa  275  7e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.153353  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3494  Mg2 transporter protein CorA family protein  42.68 
 
 
316 aa  264  1e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000281654  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1055  Mg2 transporter protein CorA family protein  41.8 
 
 
310 aa  258  8e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0663  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  42.42 
 
 
310 aa  251  1e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1711  magnesium transporter CorA family protein  41.58 
 
 
314 aa  247  1e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000354996  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1723  Mg2+ and Co2+ transporter  43.19 
 
 
314 aa  243  1.9999999999999999e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00210024  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11050  Mg2+/Co2+ transporter  40.92 
 
 
323 aa  238  1e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0387037  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2211  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  41.4 
 
 
310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0023  Mg2 transporter protein CorA family protein  40.19 
 
 
310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2925  Mg2+ transporter protein, CorA-like  41.29 
 
 
310 aa  223  3e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00031498  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1715  hypothetical protein  38.34 
 
 
314 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.014259  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0027  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  45.14 
 
 
308 aa  219  5e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.905993  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06390  Mg2+/Co2+ transporter  39.38 
 
 
319 aa  209  7e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.139821  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4695  Mg2 transporter protein CorA family protein  36.88 
 
 
312 aa  208  9e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.551554  normal  0.0119033 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2252  Mg2 transporter protein CorA family protein  35.28 
 
 
310 aa  177  2e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000868965  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1185  Mg2 transporter protein CorA family protein  37.33 
 
 
308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1967  CorA family protein  34.92 
 
 
315 aa  163  3e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00999125  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0715  transporter  33.1 
 
 
306 aa  162  7e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0409266 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0242  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  33.33 
 
 
308 aa  157  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.291265  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2402  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  35.44 
 
 
314 aa  155  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0013956  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2448  Mg2 transporter protein CorA family protein  35.44 
 
 
314 aa  155  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000474618  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1574  cationic transporter  35.58 
 
 
274 aa  141  9.999999999999999e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0474991  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3219  magnesium and cobalt transport protein, putative  27.68 
 
 
313 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2823  Mg2 transporter protein CorA family protein  27.68 
 
 
313 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.714315  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0003  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.01 
 
 
317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00000548112  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0690  divalent cation transport-related protein  29.11 
 
 
293 aa  120  3.9999999999999996e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0846569  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0019  Mg2 transporter protein CorA family protein  31.02 
 
 
303 aa  116  3.9999999999999997e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0476  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.86 
 
 
316 aa  114  3e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1559  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.69 
 
 
316 aa  110  3e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0360  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.36 
 
 
316 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.126315  hitchhiker  0.00222475 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1826  Mg2+ and Co2+ transporter-like protein  28.52 
 
 
305 aa  103  5e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2525  Mg2+ transporter protein, CorA-like  24.7 
 
 
309 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0224722  normal  0.599163 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2717  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  23.64 
 
 
303 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2955  magnesium/cobalt transporter CorA family protein  23.32 
 
 
303 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.045506 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1657  Mg2+ transporter protein, CorA-like  29.08 
 
 
344 aa  91.7  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.180392 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1071  Mg2+ and Co2+ transporter  28.25 
 
 
301 aa  86.7  4e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0126  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.26 
 
 
322 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000115284  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.96 
 
 
316 aa  79.3  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0739  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.71 
 
 
374 aa  79.3  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000829129 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2822  Mg2 transporter protein CorA family protein  23.53 
 
 
311 aa  79  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.601446 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3218  magnesium and cobalt transport protein, putative  23.53 
 
 
311 aa  79  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1527  Mg2+ and Co2+ transporter  24.05 
 
 
302 aa  78.2  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00743319  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1294  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.92 
 
 
322 aa  77  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2618  Mg2+ transporter protein, CorA-like  23.44 
 
 
307 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3662  magnesium and cobalt transport protein  28.07 
 
 
358 aa  75.9  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0875  magnesium transporter CorA family protein  25.42 
 
 
305 aa  75.1  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00265274  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0560  magnesium and cobalt transport protein CorA  21.82 
 
 
321 aa  74.7  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4037  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.32 
 
 
327 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2798  transporter, putative  28.89 
 
 
211 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00161167  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2520  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.68 
 
 
357 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00107852  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2060  Mg2+ and Co2+ transporter  21.81 
 
 
307 aa  73.6  0.000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0376  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.29 
 
 
351 aa  72.8  0.000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00229946  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1189  magnesium/cobalt transporter CorA  31.03 
 
 
365 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2983  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.82 
 
 
354 aa  71.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.23033  normal  0.025318 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1725  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.67 
 
 
372 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0865  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.26 
 
 
352 aa  70.5  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.916446  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0098  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  22.87 
 
 
322 aa  70.9  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194887  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1928  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.88 
 
 
362 aa  70.5  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185921  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2665  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.73 
 
 
390 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.111176 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2713  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.63 
 
 
367 aa  70.1  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2408  magnesium and cobalt transport protein CorA  20.42 
 
 
339 aa  69.7  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518253  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1811  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.66 
 
 
333 aa  69.7  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1870  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.1 
 
 
363 aa  69.3  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0170  Mg2+ and Co2+ transporter  23.41 
 
 
304 aa  68.6  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10618  Magnesium and cobalt transport protein  37.78 
 
 
363 aa  68.6  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0668  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.36 
 
 
385 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0284032  normal  0.71068 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2267  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.78 
 
 
360 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0974553 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0173  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.71 
 
 
352 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3012  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.02 
 
 
354 aa  68.2  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.815439  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0648  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.36 
 
 
385 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1521  magnesium/cobalt transporter CorA  24.73 
 
 
375 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.954015 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0359  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.82 
 
 
351 aa  68.2  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000101398  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0933  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.66 
 
 
325 aa  67  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0789  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  31.43 
 
 
322 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.957399  normal  0.0628578 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0696  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.5 
 
 
355 aa  66.6  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181573  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0969  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.83 
 
 
356 aa  66.2  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231272  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1738  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.57 
 
 
352 aa  66.2  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.277865 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1041  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.77 
 
 
348 aa  66.2  0.0000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.78816  normal  0.435904 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1913  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.56 
 
 
375 aa  66.2  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>