99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2955 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2955  magnesium/cobalt transporter CorA family protein  100 
 
 		 303 aa  622  1e-177  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.045506 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2717  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  97.69 
 
 		 303 aa  610  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2525  Mg2+ transporter protein, CorA-like  52.01 
 
 		 309 aa  322  3e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0224722  normal  0.599163 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2618  Mg2+ transporter protein, CorA-like  53.92 
 
 		 307 aa  318  1e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1657  Mg2+ transporter protein, CorA-like  43.9 
 
 		 344 aa  238  1e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.180392 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2798  transporter, putative  55.29 
 
 		 211 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00161167  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0019  Mg2 transporter protein CorA family protein  35.57 
 
 		 303 aa  175  7e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0663  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  27.27 
 
 		 310 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0326  Mg2+ and Co2+ transporter  25 
 
 		 316 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0484  Mg2 transporter protein CorA family protein  25.76 
 
 		 314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3494  Mg2 transporter protein CorA family protein  26.17 
 
 		 316 aa  103  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000281654  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2406  Mg2 transporter protein CorA family protein  23.47 
 
 		 312 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0156  transporter  25.27 
 
 		 311 aa  100  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1881  Mg2 transporter protein CorA family protein  23.76 
 
 		 312 aa  97.8  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000406477  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1055  Mg2 transporter protein CorA family protein  25 
 
 		 310 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2001  Mg2 transporter protein CorA family protein  24.91 
 
 		 310 aa  97.8  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000539892  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0715  transporter  25.55 
 
 		 306 aa  97.8  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0409266 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3146  Mg2 transporter protein CorA family protein  22.15 
 
 		 311 aa  92.4  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.896486  normal  0.696922 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2452  magnesium and cobalt transporter  23.32 
 
 		 314 aa  91.7  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.920957  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2767  putative cation transporter  23.32 
 
 		 314 aa  92  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0994122  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0023  Mg2 transporter protein CorA family protein  24.46 
 
 		 310 aa  87.4  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2211  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  24.01 
 
 		 310 aa  88.2  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2215  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  22.02 
 
 		 315 aa  87.4  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00295785  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0027  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  23.84 
 
 		 308 aa  87.4  3e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.905993  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2662  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  25.18 
 
 		 312 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1539  Mg2 transporter protein CorA family protein  21.94 
 
 		 313 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000914298  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2252  Mg2 transporter protein CorA family protein  23.3 
 
 		 310 aa  82.8  0.000000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000868965  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2050  magnesium transporter cora family protein  23.3 
 
 		 313 aa  82  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.313249  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1900  Mg2 transporter protein CorA family protein  23.3 
 
 		 313 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000765251  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1903  magnesium transporter CorA family protein  23.3 
 
 		 313 aa  82  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00149373  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1866  magnesium and cobalt transport protein  23.3 
 
 		 313 aa  82  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000280155  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2083  magnesium transporter, CorA family  23.3 
 
 		 313 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2151  magnesium transporter, CorA family  23.3 
 
 		 313 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0239499  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2040  magnesium transporter, CorA family  23.3 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0746182  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3269  magnesium transporter, CorA family  23.3 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.639337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4695  Mg2 transporter protein CorA family protein  23.13 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.551554  normal  0.0119033 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1856  magnesium and cobalt transport protein  23.3 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1723  Mg2+ and Co2+ transporter  20.73 
 
 		 314 aa  79.3  0.00000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00210024  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2925  Mg2+ transporter protein, CorA-like  21.82 
 
 		 310 aa  77.8  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00031498  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06390  Mg2+/Co2+ transporter  22.54 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.139821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0242  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  21.27 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.291265  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1715  hypothetical protein  23.38 
 
 		 314 aa  74.3  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.014259  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2119  magnesium transporter CorA family protein  22.66 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.153353  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1826  Mg2+ and Co2+ transporter-like protein  22.38 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1185  Mg2 transporter protein CorA family protein  20.66 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1574  cationic transporter  20.73 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0474991  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3905  Mg2+ transporter protein, CorA-like  41.33 
 
 		 461 aa  68.9  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1967  CorA family protein  23.05 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00999125  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0170  Mg2+ and Co2+ transporter  22.53 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11050  Mg2+/Co2+ transporter  20.06 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0387037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2980  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  37.84 
 
 		 450 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.107621  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0003  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.12 
 
 		 317 aa  59.7  0.00000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00000548112  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2791  putative cobalt/magnesium uptake transporter  18.67 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2060  Mg2+ and Co2+ transporter  23.04 
 
 		 307 aa  57  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2937  putative cobalt/magnesium uptake transporter  18.67 
 
 		 354 aa  56.2  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2822  Mg2 transporter protein CorA family protein  20.77 
 
 		 311 aa  54.3  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.601446 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3218  magnesium and cobalt transport protein, putative  20.77 
 
 		 311 aa  54.3  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2448  Mg2 transporter protein CorA family protein  22.76 
 
 		 314 aa  53.5  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000474618  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2402  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  22.76 
 
 		 314 aa  53.5  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0013956  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0476  magnesium and cobalt transport protein CorA  20.74 
 
 		 316 aa  51.6  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0787  magnesium and cobalt transport protein CorA  20.73 
 
 		 341 aa  51.6  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00324534  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3219  magnesium and cobalt transport protein, putative  23.59 
 
 		 313 aa  50.1  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2823  Mg2 transporter protein CorA family protein  23.59 
 
 		 313 aa  50.1  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.714315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0173  magnesium and cobalt transport protein CorA  21.38 
 
 		 352 aa  49.7  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4191  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.75 
 
 		 382 aa  49.3  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.259759  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1738  magnesium and cobalt transport protein CorA  20.98 
 
 		 352 aa  49.3  0.00008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.277865 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0360  magnesium and cobalt transport protein CorA  20.44 
 
 		 316 aa  49.3  0.00009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.126315  hitchhiker  0.00222475 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1559  magnesium and cobalt transport protein CorA  20.37 
 
 		 316 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0054  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.75 
 
 		 325 aa  47.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349471  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2270  Mg2 transporter protein CorA family protein  22.7 
 
 		 314 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0371321  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2182  magnesium and cobalt transport protein CorA  21.79 
 
 		 327 aa  47.4  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.709225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0865  magnesium and cobalt transport protein CorA  19.73 
 
 		 352 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.916446  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1041  magnesium and cobalt transport protein CorA  21.79 
 
 		 348 aa  47.4  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.78816  normal  0.435904 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2713  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.38 
 
 		 367 aa  46.6  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0690  divalent cation transport-related protein  19.83 
 
 		 293 aa  46.6  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0846569  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0560  magnesium and cobalt transport protein CorA  20.45 
 
 		 321 aa  45.8  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2267  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.37 
 
 		 360 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0974553 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1675  magnesium and cobalt transport protein CorA  21.71 
 
 		 314 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2074  magnesium and cobalt transport protein CorA  20.57 
 
 		 357 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2181  Mg2 transporter protein CorA family protein  22.04 
 
 		 314 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0833206  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0646  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.41 
 
 		 353 aa  45.1  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1912  magnesium and cobalt transport protein CorA  20 
 
 		 374 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107117  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1811  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.25 
 
 		 333 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0137  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.88 
 
 		 368 aa  44.3  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1521  magnesium/cobalt transporter CorA  33.33 
 
 		 375 aa  44.3  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.954015 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1484  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  38.71 
 
 		 273 aa  43.9  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.182514  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2424  Mg2 transporter protein CorA family protein  31.88 
 
 		 318 aa  43.9  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0150  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  21.64 
 
 		 345 aa  43.9  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1725  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.13 
 
 		 372 aa  43.9  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2665  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.12 
 
 		 390 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.111176 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1740  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.78 
 
 		 354 aa  43.5  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1527  Mg2+ and Co2+ transporter  21.79 
 
 		 302 aa  43.5  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00743319  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0359  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.5 
 
 		 351 aa  43.1  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000101398  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1913  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.82 
 
 		 375 aa  43.1  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0795  magnesium/cobalt transporter CorA  26.14 
 
 		 380 aa  42.7  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1928  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.82 
 
 		 362 aa  42.7  0.008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185921  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0376  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.5 
 
 		 351 aa  42.4  0.009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00229946  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3419  magnesium and cobalt transport protein CorA  19.39 
 
 		 355 aa  42.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222754  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.02 
 
 		 353 aa  42.4  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0176371  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>