162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_06390 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_06390  Mg2+/Co2+ transporter  100 
 
 
319 aa  654    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.139821  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11050  Mg2+/Co2+ transporter  55.28 
 
 
323 aa  365  1e-100  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0387037  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1539  Mg2 transporter protein CorA family protein  39.44 
 
 
313 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000914298  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1903  magnesium transporter CorA family protein  38.51 
 
 
313 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00149373  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2050  magnesium transporter cora family protein  38.51 
 
 
313 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.313249  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2083  magnesium transporter, CorA family  38.51 
 
 
313 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1866  magnesium and cobalt transport protein  38.51 
 
 
313 aa  231  9e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000280155  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1856  magnesium and cobalt transport protein  38.82 
 
 
313 aa  231  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2151  magnesium transporter, CorA family  38.51 
 
 
313 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0239499  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2040  magnesium transporter, CorA family  38.82 
 
 
313 aa  231  1e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0746182  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2215  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  37.35 
 
 
315 aa  231  1e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00295785  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3269  magnesium transporter, CorA family  38.82 
 
 
313 aa  231  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.639337  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1900  Mg2 transporter protein CorA family protein  38.51 
 
 
313 aa  231  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000765251  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2406  Mg2 transporter protein CorA family protein  37.19 
 
 
312 aa  223  3e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2119  magnesium transporter CorA family protein  38.82 
 
 
295 aa  223  4e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.153353  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0156  transporter  36.88 
 
 
311 aa  217  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1881  Mg2 transporter protein CorA family protein  36.56 
 
 
312 aa  217  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000406477  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3146  Mg2 transporter protein CorA family protein  36.45 
 
 
311 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.896486  normal  0.696922 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2767  putative cation transporter  37.46 
 
 
314 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0994122  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2452  magnesium and cobalt transporter  37.15 
 
 
314 aa  213  4.9999999999999996e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.920957  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2001  Mg2 transporter protein CorA family protein  37.81 
 
 
310 aa  207  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000539892  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0484  Mg2 transporter protein CorA family protein  37.89 
 
 
314 aa  205  8e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0663  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  37.17 
 
 
310 aa  203  4e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2662  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  35.62 
 
 
312 aa  192  6e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0027  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  33.54 
 
 
308 aa  186  3e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.905993  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0023  Mg2 transporter protein CorA family protein  36.56 
 
 
310 aa  186  7e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1055  Mg2 transporter protein CorA family protein  35.2 
 
 
310 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1715  hypothetical protein  30.25 
 
 
314 aa  176  6e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.014259  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1723  Mg2+ and Co2+ transporter  34.66 
 
 
314 aa  172  6.999999999999999e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00210024  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0326  Mg2+ and Co2+ transporter  32.18 
 
 
316 aa  167  1e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1574  cationic transporter  34.46 
 
 
274 aa  166  4e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0474991  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1711  magnesium transporter CorA family protein  34.19 
 
 
314 aa  166  5e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000354996  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3494  Mg2 transporter protein CorA family protein  29.5 
 
 
316 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000281654  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0715  transporter  33.66 
 
 
306 aa  163  4.0000000000000004e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0409266 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4695  Mg2 transporter protein CorA family protein  29.91 
 
 
312 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.551554  normal  0.0119033 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2925  Mg2+ transporter protein, CorA-like  29.94 
 
 
310 aa  158  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00031498  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2211  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  30.94 
 
 
310 aa  157  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0242  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  31.23 
 
 
308 aa  152  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.291265  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1185  Mg2 transporter protein CorA family protein  30.28 
 
 
308 aa  146  5e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2252  Mg2 transporter protein CorA family protein  29.33 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000868965  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1967  CorA family protein  31.06 
 
 
315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00999125  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2402  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  31.25 
 
 
314 aa  119  7.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0013956  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2448  Mg2 transporter protein CorA family protein  31.25 
 
 
314 aa  119  7.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000474618  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3219  magnesium and cobalt transport protein, putative  28.96 
 
 
313 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2823  Mg2 transporter protein CorA family protein  28.96 
 
 
313 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.714315  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0019  Mg2 transporter protein CorA family protein  25.43 
 
 
303 aa  102  8e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1826  Mg2+ and Co2+ transporter-like protein  23.47 
 
 
305 aa  97.4  3e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0690  divalent cation transport-related protein  23.39 
 
 
293 aa  89  9e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0846569  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1657  Mg2+ transporter protein, CorA-like  26.82 
 
 
344 aa  86.3  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.180392 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0170  Mg2+ and Co2+ transporter  23.2 
 
 
304 aa  83.6  0.000000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2060  Mg2+ and Co2+ transporter  21.81 
 
 
307 aa  81.3  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1071  Mg2+ and Co2+ transporter  26.19 
 
 
301 aa  79.3  0.00000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2955  magnesium/cobalt transporter CorA family protein  22.54 
 
 
303 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.045506 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2525  Mg2+ transporter protein, CorA-like  23.02 
 
 
309 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0224722  normal  0.599163 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2717  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  22.89 
 
 
303 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2822  Mg2 transporter protein CorA family protein  25.15 
 
 
311 aa  74.3  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.601446 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3218  magnesium and cobalt transport protein, putative  25.15 
 
 
311 aa  74.3  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1527  Mg2+ and Co2+ transporter  23.08 
 
 
302 aa  72  0.00000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00743319  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0003  magnesium and cobalt transport protein CorA  21.96 
 
 
317 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00000548112  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1559  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.18 
 
 
316 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2618  Mg2+ transporter protein, CorA-like  21.25 
 
 
307 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2798  transporter, putative  25.17 
 
 
211 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00161167  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0031  Mg2+ and Co2+ transporter  22.73 
 
 
308 aa  63.2  0.000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0126  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.61 
 
 
322 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000115284  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1928  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.64 
 
 
362 aa  61.2  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185921  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0476  magnesium and cobalt transport protein CorA  21.5 
 
 
316 aa  59.3  0.00000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0360  magnesium and cobalt transport protein CorA  21.53 
 
 
316 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.126315  hitchhiker  0.00222475 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0010  Mg2+ and Co2+ transporter  22.83 
 
 
228 aa  58.2  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000139051  hitchhiker  0.00000000019085 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1294  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.66 
 
 
322 aa  57.8  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3012  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.98 
 
 
354 aa  56.2  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.815439  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1482  Mg2 transporter protein CorA family protein  20.34 
 
 
325 aa  55.8  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0136304  normal  0.215972 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1999  magnesium and cobalt transport protein CorA  20.2 
 
 
324 aa  55.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.403451  normal  0.552456 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0875  magnesium transporter CorA family protein  23.47 
 
 
305 aa  54.7  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00265274  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0098  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  26.19 
 
 
322 aa  53.9  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194887  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2408  magnesium and cobalt transport protein CorA  18.84 
 
 
339 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518253  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0646  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.18 
 
 
353 aa  53.5  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3221  magnesium and cobalt transport protein, putative  21.85 
 
 
303 aa  53.1  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2825  Mg2 transporter protein CorA family protein  21.85 
 
 
304 aa  53.1  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.756576  normal  0.926767 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3070  magnesium and cobalt transport protein CorA  20 
 
 
339 aa  53.1  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0447  magnesium transporter CorA family protein  26.59 
 
 
287 aa  52.4  0.000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0266087  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0171  magnesium and cobalt transport protein CorA  21.05 
 
 
365 aa  52.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215108  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2064  magnesium and cobalt transport protein, putative  21.29 
 
 
323 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00816438  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11264  magnesium and cobalt transport transmembrane protein corA  27.72 
 
 
366 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00777117  hitchhiker  0.000740018 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0376  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.64 
 
 
351 aa  51.6  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00229946  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0065  Mg2+ transporter protein, CorA-like  36.36 
 
 
323 aa  50.4  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4111  Mg2 transporter protein CorA family protein  23.33 
 
 
417 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4178  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.7 
 
 
322 aa  50.1  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3662  magnesium and cobalt transport protein  26.57 
 
 
358 aa  50.1  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3190  Mg2 transporter protein CorA family protein  21.7 
 
 
332 aa  50.1  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.38171  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1091  magnesium and cobalt transport protein CorA  21.82 
 
 
322 aa  50.1  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1742  Mg2+ transporter protein, CorA-like  28.43 
 
 
323 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2421  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.96 
 
 
322 aa  49.3  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1732  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.05 
 
 
355 aa  49.3  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0556  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.65 
 
 
354 aa  49.3  0.00008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0359  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.66 
 
 
351 aa  49.3  0.00009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000101398  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C30  Mg2+ and Co2+ transporter  34.21 
 
 
316 aa  48.5  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0357  Mg2+ and Co2+ transporter  25.74 
 
 
316 aa  48.9  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.641395  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1874  Mg2+ transporter protein, CorA-like  21.29 
 
 
323 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0287  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.23 
 
 
436 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523176  normal  0.774272 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1997  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.42 
 
 
395 aa  47.8  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.223184  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>