More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2823 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_3219  magnesium and cobalt transport protein, putative  100 
 
 
313 aa  635    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2823  Mg2 transporter protein CorA family protein  100 
 
 
313 aa  635    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.714315  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2406  Mg2 transporter protein CorA family protein  33.9 
 
 
312 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1881  Mg2 transporter protein CorA family protein  33.56 
 
 
312 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000406477  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2215  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  30.58 
 
 
315 aa  168  9e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00295785  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0484  Mg2 transporter protein CorA family protein  31.83 
 
 
314 aa  167  1e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3146  Mg2 transporter protein CorA family protein  31.96 
 
 
311 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.896486  normal  0.696922 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1539  Mg2 transporter protein CorA family protein  32.88 
 
 
313 aa  166  4e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000914298  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0663  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  32.19 
 
 
310 aa  160  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1715  hypothetical protein  30.14 
 
 
314 aa  159  6e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.014259  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1055  Mg2 transporter protein CorA family protein  31.76 
 
 
310 aa  159  6e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2040  magnesium transporter, CorA family  30.82 
 
 
313 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0746182  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1900  Mg2 transporter protein CorA family protein  30.82 
 
 
313 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000765251  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3269  magnesium transporter, CorA family  30.82 
 
 
313 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.639337  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2119  magnesium transporter CorA family protein  30.82 
 
 
295 aa  157  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.153353  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1903  magnesium transporter CorA family protein  30.82 
 
 
313 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00149373  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2050  magnesium transporter cora family protein  30.82 
 
 
313 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.313249  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2083  magnesium transporter, CorA family  30.82 
 
 
313 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1856  magnesium and cobalt transport protein  30.82 
 
 
313 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1866  magnesium and cobalt transport protein  30.82 
 
 
313 aa  155  9e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000280155  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2151  magnesium transporter, CorA family  30.82 
 
 
313 aa  155  9e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0239499  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2822  Mg2 transporter protein CorA family protein  38.11 
 
 
311 aa  154  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.601446 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3218  magnesium and cobalt transport protein, putative  38.11 
 
 
311 aa  154  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0027  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  29.75 
 
 
308 aa  151  2e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.905993  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2452  magnesium and cobalt transporter  27.68 
 
 
314 aa  150  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.920957  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2767  putative cation transporter  27.68 
 
 
314 aa  149  4e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0994122  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0242  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  30.14 
 
 
308 aa  149  4e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.291265  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0715  transporter  29.41 
 
 
306 aa  149  8e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0409266 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2662  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  30.7 
 
 
312 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2252  Mg2 transporter protein CorA family protein  27.93 
 
 
310 aa  144  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000868965  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0156  transporter  30.63 
 
 
311 aa  142  7e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4695  Mg2 transporter protein CorA family protein  26.35 
 
 
312 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.551554  normal  0.0119033 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1185  Mg2 transporter protein CorA family protein  28.28 
 
 
308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3494  Mg2 transporter protein CorA family protein  30.51 
 
 
316 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000281654  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2001  Mg2 transporter protein CorA family protein  28.28 
 
 
310 aa  132  6.999999999999999e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000539892  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0023  Mg2 transporter protein CorA family protein  29.35 
 
 
310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1967  CorA family protein  29.9 
 
 
315 aa  126  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00999125  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2925  Mg2+ transporter protein, CorA-like  30.1 
 
 
310 aa  124  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00031498  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2211  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  30.31 
 
 
310 aa  123  4e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0326  Mg2+ and Co2+ transporter  26.74 
 
 
316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06390  Mg2+/Co2+ transporter  28.57 
 
 
319 aa  119  7e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.139821  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11050  Mg2+/Co2+ transporter  29.35 
 
 
323 aa  119  9e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0387037  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2402  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  31.43 
 
 
314 aa  116  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0013956  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2448  Mg2 transporter protein CorA family protein  31.43 
 
 
314 aa  116  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000474618  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1711  magnesium transporter CorA family protein  25.75 
 
 
314 aa  108  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000354996  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2825  Mg2 transporter protein CorA family protein  27.15 
 
 
304 aa  106  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.756576  normal  0.926767 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3221  magnesium and cobalt transport protein, putative  27.15 
 
 
303 aa  106  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1723  Mg2+ and Co2+ transporter  26.25 
 
 
314 aa  104  2e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00210024  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1574  cationic transporter  25.46 
 
 
274 aa  103  3e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0474991  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0019  Mg2 transporter protein CorA family protein  25.17 
 
 
303 aa  100  4e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0690  divalent cation transport-related protein  27.04 
 
 
293 aa  95.9  8e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0846569  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0560  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.71 
 
 
321 aa  87.8  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0003  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.47 
 
 
317 aa  86.7  4e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00000548112  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1826  Mg2+ and Co2+ transporter-like protein  22.11 
 
 
305 aa  86.3  7e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0057  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.08 
 
 
322 aa  83.2  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1999  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.21 
 
 
324 aa  79.3  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.403451  normal  0.552456 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2713  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.18 
 
 
367 aa  77.4  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2224  magnesium and cobalt transport protein CorA  21.33 
 
 
291 aa  77.4  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000656607  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0696  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.64 
 
 
355 aa  77.4  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181573  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3478  Mg2 transporter protein CorA family protein  26.32 
 
 
323 aa  76.6  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.119189 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4550  Mg2 transporter protein CorA family protein  26.32 
 
 
323 aa  76.6  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1294  magnesium and cobalt transport protein CorA  21.9 
 
 
322 aa  75.5  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2408  magnesium and cobalt transport protein CorA  20.95 
 
 
339 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518253  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0476  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.36 
 
 
316 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1091  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.67 
 
 
322 aa  73.9  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2486  Mg2 transporter protein CorA family protein  24.84 
 
 
321 aa  73.9  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0125813  normal  0.0747701 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0360  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.36 
 
 
316 aa  73.6  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.126315  hitchhiker  0.00222475 
 
 
-
 
NC_002936  DET0582  magnesium and cobalt transport protein CorA  21.62 
 
 
354 aa  73.2  0.000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000747796  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3070  magnesium and cobalt transport protein CorA  20.75 
 
 
339 aa  73.2  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0113  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.15 
 
 
378 aa  72.4  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0453825  normal  0.258099 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1657  Mg2+ transporter protein, CorA-like  28.11 
 
 
344 aa  72.4  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.180392 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1559  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.36 
 
 
316 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0271  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.01 
 
 
370 aa  72  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01784  magnesium/cobalt transporter CorA  25.33 
 
 
323 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0787  magnesium and cobalt transport protein CorA  24 
 
 
341 aa  71.2  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00324534  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2182  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.37 
 
 
327 aa  71.2  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.709225  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1482  Mg2 transporter protein CorA family protein  21.52 
 
 
325 aa  70.5  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0136304  normal  0.215972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0387  putative metal ion transporter  21.33 
 
 
372 aa  70.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0414  Mg2 transporter protein CorA family protein  21.67 
 
 
322 aa  70.1  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0984247  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1811  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.9 
 
 
333 aa  70.1  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2855  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.23 
 
 
331 aa  69.3  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.233284  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28210  Mg2+/Co2+ transporter  21.94 
 
 
371 aa  69.3  0.00000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0065  Mg2+ transporter protein, CorA-like  23.33 
 
 
323 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0376  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.33 
 
 
351 aa  68.6  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00229946  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4111  Mg2 transporter protein CorA family protein  24.09 
 
 
417 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2960  Mg2 transporter protein CorA family protein  25.58 
 
 
315 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0634853 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10618  Magnesium and cobalt transport protein  19.94 
 
 
363 aa  67.8  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0556  magnesium and cobalt transport protein CorA  21.28 
 
 
354 aa  68.6  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0359  magnesium and cobalt transport protein CorA  21.7 
 
 
351 aa  67.4  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000101398  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  20.4 
 
 
316 aa  67.8  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0646  magnesium and cobalt transport protein CorA  21.18 
 
 
353 aa  65.9  0.0000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3204  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.94 
 
 
379 aa  65.5  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.648086  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0436  magnesium and cobalt transport protein CorA  20.86 
 
 
354 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1740  magnesium and cobalt transport protein CorA  20.33 
 
 
354 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1248  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.42 
 
 
380 aa  65.5  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.713487  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0899  magnesium and cobalt transport protein CorA  20.52 
 
 
368 aa  64.3  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0795  magnesium/cobalt transporter CorA  20.85 
 
 
380 aa  64.3  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0783  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.59 
 
 
316 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1071  Mg2+ and Co2+ transporter  25 
 
 
301 aa  64.7  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2525  Mg2+ transporter protein, CorA-like  24.01 
 
 
309 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0224722  normal  0.599163 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>