More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2486 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_2486  Mg2 transporter protein CorA family protein  100 
 
 
321 aa  657    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0125813  normal  0.0747701 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2459  putative magnesium/cobalt transport protein  52.62 
 
 
325 aa  333  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1168  Mg2+ transporter protein, CorA-like  51.23 
 
 
326 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0762  Mg2+ transporter protein, CorA-like  51.07 
 
 
326 aa  319  3.9999999999999996e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0819576  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4931  Mg2 transporter protein CorA family protein  50.61 
 
 
326 aa  318  5e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4290  Mg2+ transporter protein, CorA-like  50.92 
 
 
326 aa  315  5e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0188618 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1270  Mg2+ transporter protein, CorA-like  50.61 
 
 
326 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.932061  normal  0.448053 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2476  Mg2 transporter protein CorA family protein  47.08 
 
 
324 aa  300  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.245937  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0245  Mg2 transporter protein CorA family protein  50.17 
 
 
319 aa  291  1e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0279376  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1883  magnesium/cobalt transporter CorA  46.81 
 
 
331 aa  286  2e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0550  Mg2 transporter protein CorA family protein  44.31 
 
 
325 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.361398  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0507  Mg2 transporter protein CorA family protein  44.31 
 
 
330 aa  278  8e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6010  magnesium/cobalt transport protein  41.72 
 
 
326 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4292  Mg2 transporter protein CorA family protein  46.13 
 
 
334 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3613  magnesium and cobalt transport protein CorA  46.45 
 
 
334 aa  265  8e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3905  magnesium and cobalt transport protein CorA  46.45 
 
 
334 aa  265  8e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47640  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.08 
 
 
324 aa  264  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.505114  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69570  magnesium/cobalt transport protein  41.1 
 
 
326 aa  261  8e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0054645  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0443  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.16 
 
 
325 aa  259  3e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0358301 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0560  CorA family protein  40.61 
 
 
353 aa  252  6e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.856188  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2374  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.61 
 
 
331 aa  251  9.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.150786  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2837  magnesium and cobalt transport protein CorA  44.12 
 
 
331 aa  251  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129191  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2704  Mg2 transporter protein CorA family protein  40.18 
 
 
330 aa  250  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.418617  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0926  magnesium/cobalt transport protein  44.63 
 
 
313 aa  250  3e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.449871  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0559  CorA family protein  40.91 
 
 
330 aa  249  6e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.780327  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3823  Mg2 transporter protein CorA family protein  43.55 
 
 
334 aa  248  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.452482  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0855  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.52 
 
 
330 aa  242  7e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.764984  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1204  Mg2 transporter protein CorA family protein  41.53 
 
 
330 aa  233  3e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.787899  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2608  Mg2+/Co2+ transporter  39.94 
 
 
331 aa  233  3e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.301217  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1266  Fis family transcriptional regulator  39.94 
 
 
331 aa  233  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.336858 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1967  Mg2 transporter protein CorA family protein  37.61 
 
 
324 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0310  Mg2 transporter protein CorA family protein  36.27 
 
 
328 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116579 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3423  Mg2 transporter protein CorA family protein  34.65 
 
 
328 aa  211  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.707435  normal  0.494677 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3978  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  35.2 
 
 
316 aa  201  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000688166  normal  0.660189 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03692  magnesium/nickel/cobalt transporter  34.58 
 
 
316 aa  199  5e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4163  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.58 
 
 
316 aa  199  5e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4041  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  34.58 
 
 
316 aa  199  5e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4335  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  34.58 
 
 
316 aa  199  5e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4192  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  34.58 
 
 
316 aa  199  5e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.846317 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03641  hypothetical protein  34.58 
 
 
316 aa  199  5e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5256  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  34.58 
 
 
316 aa  199  5e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4183  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  34.58 
 
 
316 aa  199  5e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0150126 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4281  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  34.58 
 
 
316 aa  199  5e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4280  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  34.58 
 
 
316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4181  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  34.58 
 
 
316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4339  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  34.58 
 
 
316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4232  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  34.58 
 
 
316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4162  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  34.58 
 
 
316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1722  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.51 
 
 
315 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.992211  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3969  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  34.58 
 
 
316 aa  195  8.000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4159  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  34.27 
 
 
316 aa  193  3e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0973579  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4002  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  33.64 
 
 
316 aa  193  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0214  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  33.64 
 
 
316 aa  193  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0551  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  33.64 
 
 
316 aa  193  3e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0188  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  34.58 
 
 
316 aa  192  6e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.318562  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4090  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.69 
 
 
317 aa  191  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.332986 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2490  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.96 
 
 
315 aa  191  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.823404  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0237  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  34.27 
 
 
316 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3322  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.64 
 
 
317 aa  188  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0188  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  33.64 
 
 
316 aa  188  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0017  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.95 
 
 
317 aa  187  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.636656  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5327  Mg2 transporter protein CorA family protein  33.53 
 
 
334 aa  187  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779888  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1720  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.96 
 
 
315 aa  187  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.387047  normal  0.185516 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1537  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.64 
 
 
315 aa  187  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.34242  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0016  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.95 
 
 
317 aa  187  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1769  Mg2 transporter protein CorA family protein  35.33 
 
 
325 aa  186  6e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156146  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2809  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.33 
 
 
315 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.825748  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5251  Mg2 transporter protein CorA family protein  33.23 
 
 
334 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.415947  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4784  Mg2 transporter protein CorA family protein  33.23 
 
 
334 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.162984  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1645  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.33 
 
 
315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000211085  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2259  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.02 
 
 
315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1941  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.33 
 
 
315 aa  183  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2080  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.15 
 
 
315 aa  183  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1720  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.33 
 
 
315 aa  183  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00013854  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1589  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.33 
 
 
320 aa  183  3e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1846  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.64 
 
 
315 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0143236  hitchhiker  0.00262704 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2618  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.64 
 
 
315 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.240345  normal  0.0331163 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2353  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.33 
 
 
315 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2498  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.64 
 
 
315 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0365277  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2505  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.64 
 
 
315 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0104168  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1786  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.64 
 
 
315 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.228949  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1659  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  35.2 
 
 
316 aa  182  5.0000000000000004e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000570011  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2334  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.71 
 
 
315 aa  181  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0224869  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2853  magnesium/cobalt transporter CorA  35.59 
 
 
320 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0675  Mg2 transporter protein CorA family protein  35.97 
 
 
324 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0134  magnesium/cobalt transporter CorA  32.72 
 
 
317 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000744017  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0128  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  32.71 
 
 
316 aa  176  4e-43  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.273225  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3052  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.58 
 
 
320 aa  176  6e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0536  Mg2 transporter protein CorA family protein  36.14 
 
 
328 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.642383  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0017  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.79 
 
 
317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.692068  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0973  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.42 
 
 
328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3019  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.01 
 
 
320 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.657438  normal  0.513335 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2550  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.72 
 
 
328 aa  172  9e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.965988  normal  0.247179 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2774  magnesium/cobalt transporter CorA  33.33 
 
 
320 aa  171  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.227712 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3948  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.97 
 
 
328 aa  171  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.643158  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3297  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.97 
 
 
328 aa  171  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3795  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.43 
 
 
336 aa  171  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.760461  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2609  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.33 
 
 
320 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4615  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.1 
 
 
328 aa  169  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0470  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.81 
 
 
320 aa  169  6e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>