215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2427 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2427  peptidase S16, lon domain-containing protein  100 
 
 
190 aa  379  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.350159  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0602  peptidase S16, lon domain-containing protein  57.61 
 
 
196 aa  184  7e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.607878  hitchhiker  0.0000000000989941 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0361  peptidase S16 lon domain protein  51.79 
 
 
202 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.18902 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0066  peptidase S16, lon N-terminal  47.85 
 
 
210 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.394074  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2009  peptidase S16, lon domain-containing protein  49.46 
 
 
191 aa  168  4e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0966504  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0444  peptidase S16 lon domain protein  49.47 
 
 
200 aa  168  5e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0525  peptidase S16  45.6 
 
 
194 aa  161  6e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198265  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2421  peptidase S16, lon domain-containing protein  41.9 
 
 
193 aa  147  6e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0638  peptidase S16, lon N-terminal  44.44 
 
 
196 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00383335  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1097  hypothetical protein  43.98 
 
 
197 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000805098  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08320  Peptidase S16, lon N-terminal  45.95 
 
 
196 aa  137  7.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0737  ATP-dependent protease La domain protein  43.33 
 
 
196 aa  136  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.825638  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4979  peptidase S16, lon-like  45 
 
 
196 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.043652  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11940  hypothetical protein  42.41 
 
 
197 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000538  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02586  ATP-dependent protease La (LON) domain subfamily  42.86 
 
 
194 aa  134  7.000000000000001e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4127  hypothetical protein  41.21 
 
 
210 aa  134  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0591  peptidase S16 lon domain protein  41.21 
 
 
211 aa  134  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555706  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0519  peptidase S16 lon domain-containing protein  40.89 
 
 
211 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3807  peptidase S16, lon domain-containing protein  44.44 
 
 
194 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3300  peptidase S16 lon domain protein  42.31 
 
 
192 aa  132  3.9999999999999996e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3113  ATP-dependent protease La  41.29 
 
 
210 aa  131  6e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0760  ATP-dependent protease La  41.29 
 
 
210 aa  131  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2714  peptidase S16 lon domain-containing protein  40.89 
 
 
211 aa  131  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.17765 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2856  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.89 
 
 
211 aa  131  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0081  ATP-dependent protease La  41.29 
 
 
210 aa  131  6e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1509  ATP-dependent protease La  41.29 
 
 
210 aa  131  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0576  ATP-dependent protease La  41.29 
 
 
210 aa  131  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0592  ATP-dependent protease La  41.29 
 
 
210 aa  131  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2937  ATP-dependent protease La  41.29 
 
 
210 aa  131  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0302  peptidase S16 lon domain protein  45.93 
 
 
196 aa  131  6e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2807  peptidase S16 lon domain-containing protein  40.39 
 
 
211 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.885555 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2182  peptidase S16, lon-like  40.39 
 
 
211 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0235961  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2796  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.39 
 
 
211 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.549382  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6126  peptidase S16, lon-like  39.9 
 
 
211 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0230092  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0481  ATP-dependent protease La  39.8 
 
 
210 aa  129  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0296  peptidase S16, lon-like protein  43.22 
 
 
217 aa  129  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1828  peptidase S16, lon-like  39.11 
 
 
230 aa  128  6e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1650  peptidase S16, lon domain-containing protein  36.79 
 
 
214 aa  128  6e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3243  peptidase S16, lon domain-containing protein  41.58 
 
 
215 aa  127  7.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0321  peptidase S16 lon domain-containing protein  41.92 
 
 
211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4867  peptidase S16 lon domain-containing protein  45.11 
 
 
196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.39375  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2596  peptidase S16 lon domain protein  41.09 
 
 
215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4864  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.72 
 
 
209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1411  peptidase S16 lon domain protein  38.42 
 
 
223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5247  peptidase S16 lon domain-containing protein  38.78 
 
 
224 aa  124  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.469364  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0349  peptidase S16, lon N-terminal  39.59 
 
 
220 aa  123  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1211  peptidase S16, lon domain-containing protein  39.8 
 
 
222 aa  122  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0186807 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0607  peptidase S16 lon domain-containing protein  43.89 
 
 
196 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03286  hypothetical protein  40.43 
 
 
198 aa  122  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0284  peptidase S16 lon domain protein  40.53 
 
 
217 aa  120  8e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0257  peptidase S16 lon domain protein  40.53 
 
 
217 aa  120  9e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575451  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4689  peptidase S16, lon domain-containing protein  43.89 
 
 
196 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4814  ATP-dependent protease La  43.89 
 
 
197 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344958  normal  0.796434 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0402  hypothetical protein  41.58 
 
 
216 aa  119  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3619  peptidase S16, lon-like  35.78 
 
 
229 aa  117  7.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3049  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.89 
 
 
234 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1750  peptidase S16 lon domain protein  36.41 
 
 
183 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.588781  hitchhiker  0.0015757 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2710  peptidase S16 lon domain-containing protein  36.41 
 
 
183 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.586726  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2596  peptidase S16, lon domain-containing protein  36.41 
 
 
183 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139162  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2635  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.87 
 
 
183 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.963975  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002698  hypothetical protein  35.68 
 
 
198 aa  111  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.268731  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1331  peptidase S16, lon-like  35.96 
 
 
188 aa  108  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.178729  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2274  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.83 
 
 
183 aa  108  6e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1639  peptidase S16, lon-like protein  48.18 
 
 
111 aa  107  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.194614  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3337  hypothetical protein  36.17 
 
 
207 aa  107  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0458166  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3491  peptidase S16 lon domain-containing protein  34.02 
 
 
209 aa  106  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000806385 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2321  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.1 
 
 
183 aa  105  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.504487  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2464  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.59 
 
 
185 aa  105  6e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2346  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.59 
 
 
185 aa  104  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.824022  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1892  hypothetical protein  37.23 
 
 
193 aa  99.8  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1987  ATP-dependent protease La  33.16 
 
 
183 aa  99  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1414  peptidase S16 lon domain protein  45.31 
 
 
213 aa  98.6  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3703  peptidase S16 lon domain-containing protein  38.86 
 
 
213 aa  98.2  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.597101  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2345  ATP-dependent protease La domain protein  39.2 
 
 
185 aa  98.2  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1979  peptidase S16 lon domain protein  39.2 
 
 
185 aa  98.2  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.537677  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2317  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.14 
 
 
196 aa  92.8  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2956  peptidase S16 lon domain protein  34.03 
 
 
200 aa  89  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.087431  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2035  ATP-dependent protease La  34.78 
 
 
184 aa  88.2  7e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00326778  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3046  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.86 
 
 
221 aa  85.9  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307779  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4088  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.66 
 
 
233 aa  84  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.211402 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0885  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.32 
 
 
232 aa  82.4  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.465483  hitchhiker  0.0012634 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2321  peptidase S16 lon domain protein  37.57 
 
 
222 aa  81.6  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5731  peptidase S16 lon domain protein  36.36 
 
 
221 aa  79.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01436  hypothetical protein  32.91 
 
 
171 aa  79.7  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5732  peptidase S16 lon domain protein  41.22 
 
 
226 aa  77.4  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1793  peptidase S16 lon domain protein  41.23 
 
 
213 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3340  peptidase S16 lon domain protein  35.33 
 
 
225 aa  75.5  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000299764  hitchhiker  0.0073566 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5080  peptidase S16 lon domain-containing protein  34.21 
 
 
224 aa  74.7  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207681  hitchhiker  0.00573263 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0478  peptidase S16, lon-like  37.7 
 
 
212 aa  74.3  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.06422  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2898  peptidase S16 lon domain protein  37.3 
 
 
220 aa  71.6  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000438482  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0575  peptidase S16, lon-like protein  33.51 
 
 
203 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.739506  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3423  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.35 
 
 
233 aa  70.1  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.327413  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0587  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.51 
 
 
203 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00769973 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0565  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.51 
 
 
203 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.544319 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1072  ATP-dependent protease La (LON) domain  31.79 
 
 
220 aa  68.9  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.281275  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19471  ATP-dependent protease La  31.79 
 
 
220 aa  68.6  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0959  peptidase S16 lon domain protein  43.3 
 
 
206 aa  68.2  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.61655  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1149  peptidase S16, lon N-terminal  32.98 
 
 
225 aa  67.8  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2024  peptidase S16, lon-like  29.35 
 
 
217 aa  67  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835929  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1097  peptidase S16 lon domain protein  33.16 
 
 
212 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.629243 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>