218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0575 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0575  RimK domain protein ATP-grasp  100 
 
 		 490 aa  1012    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0103875  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2232  RimK domain protein ATP-grasp  65.44 
 
 		 494 aa  675    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.360505 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2617  hypothetical protein  52.33 
 
 		 524 aa  549  1e-155  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39390  ribosomal protein S6 modification enzyme  54.16 
 
 		 495 aa  549  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3347  hypothetical protein  54.36 
 
 		 495 aa  550  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2526  glutathione synthase/ribosomal protein S6 modification glutaminyl transferase  53.28 
 
 		 528 aa  528  1e-149  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000161005  normal  0.270973 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46880  glutathione synthase  51.94 
 
 		 529 aa  530  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000272025 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4039  hypothetical protein  51.94 
 
 		 515 aa  529  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0756389  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2956  ribosomal protein S6 modification protein-related protein  53.09 
 
 		 526 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0238931 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2716  RimK domain-containing protein ATP-grasp  53.09 
 
 		 526 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2089  RimK domain protein ATP-grasp  48.09 
 
 		 518 aa  484  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2466  hypothetical protein  48.09 
 
 		 518 aa  484  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1035  RimK domain-containing protein ATP-grasp  48.3 
 
 		 499 aa  476  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.494403  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1841  RimK domain-containing protein ATP-grasp  46.64 
 
 		 492 aa  458  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0608327 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1157  glutathione synthase  43.18 
 
 		 483 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2526  hypothetical protein  48.28 
 
 		 496 aa  448  1e-125  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5784  RimK domain protein ATP-grasp  43.44 
 
 		 486 aa  437  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1291  RimK domain-containing protein ATP-grasp  42.74 
 
 		 483 aa  433  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.696817  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0776  RimK domain-containing protein ATP-grasp  46.33 
 
 		 486 aa  429  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121233  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1912  hypothetical protein  43.58 
 
 		 483 aa  431  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2764  hypothetical protein  46.81 
 
 		 489 aa  419  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.338805  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0957  RimK-like ATP-grasp  44.56 
 
 		 486 aa  419  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1892  RimK domain-containing protein ATP-grasp  43.66 
 
 		 502 aa  421  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356939 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1453  glutathione synthase/ribosomal protein S6 modification enzyme (glutaminyl transferase)  43 
 
 		 490 aa  409  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.16454 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1458  RimK domain-containing protein ATP-grasp  44.2 
 
 		 502 aa  405  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0341602  normal  0.0124544 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0446  hypothetical protein  43.34 
 
 		 484 aa  400  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0422  hypothetical protein  43.55 
 
 		 484 aa  401  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1722  glutathione synthase/ribosomal protein S6 modification enzyme (glutaminyl transferase)  42.91 
 
 		 499 aa  395  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02216  glutathione synthase  40.83 
 
 		 495 aa  387  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000592479  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2915  glutathione synthase  40.92 
 
 		 486 aa  366  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.525295 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4158  RimK-like ATP-grasp  39.71 
 
 		 488 aa  360  4e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.530195  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1695  RimK domain-containing protein ATP-grasp  37.87 
 
 		 335 aa  174  5e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.803385  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1626  RimK domain-containing protein ATP-grasp  34.18 
 
 		 290 aa  163  6e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0205048 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1433  RimK domain-containing protein ATP-grasp  34.02 
 
 		 316 aa  163  7e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.133242 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0475  RimK domain-containing protein ATP-grasp  33.68 
 
 		 316 aa  162  9e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.60167  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1201  RimK domain-containing protein ATP-grasp  37.56 
 
 		 255 aa  151  3e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1421  RimK domain-containing protein ATP-grasp  32.23 
 
 		 316 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3666  alpha-L-glutamate ligase  29.14 
 
 		 301 aa  79  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000125802  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1137  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.68 
 
 		 283 aa  74.3  0.000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0237722  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0769  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.08 
 
 		 471 aa  73.6  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.974202  normal  0.327706 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06734  glutathione synthase  26.22 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1361  alpha-L-glutamate ligase  25.37 
 
 		 301 aa  73.2  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.934336  hitchhiker  0.0000103664 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3664  alpha-L-glutamate ligase  28.03 
 
 		 301 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00716  ribosomal protein S6 modification protein  26.47 
 
 		 301 aa  73.2  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2398  S6 modification enzyme RimK  29.18 
 
 		 307 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0760  ribosomal protein S6 modification protein  27.64 
 
 		 301 aa  72  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00088888  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2032  SSU ribosomal protein S6P modification protein  26.89 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000147156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2779  alpha-L-glutamate ligase  29.81 
 
 		 302 aa  71.6  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000513891  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000825  ribosomal protein S6 glutaminyl transferase  25.52 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000778733  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2828  alpha-L-glutamate ligases, ribosomal protein S6 modification protein of RimK family protein  27.27 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2353  alpha-L-glutamate ligase  26.84 
 
 		 301 aa  69.7  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000863949  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1766  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.42 
 
 		 301 aa  69.7  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.918853 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1549  S6 modification enzyme RimK  27.06 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2310  ribosomal protein S6 modification protein  24.9 
 
 		 301 aa  68.9  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2061  S6 modification enzyme RimK  29.13 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000579629  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2418  alpha-L-glutamate ligases, RimK family protein  27.12 
 
 		 298 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1871  ribosomal protein S6 modification protein  26.41 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0449  S6 modification enzyme RimK  28.14 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2380  alpha-L-glutamate ligase  26.88 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000191941  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1967  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.88 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000256532  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1745  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.27 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000225359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1825  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.27 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000123784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2496  alpha-L-glutamate ligase  26.88 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000126065  normal  0.0109329 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2274  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.27 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000086692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23180  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.89 
 
 		 411 aa  66.6  0.0000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2391  alpha-L-glutamate ligase  26.88 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000134298  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02460  ribosomal protein S6 modification protein  24.5 
 
 		 290 aa  66.6  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.76969  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2143  alpha-L-glutamate ligase  26.61 
 
 		 301 aa  66.2  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000119851  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0438  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.28 
 
 		 281 aa  65.9  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00025755 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0481  hypothetical protein  29.55 
 
 		 302 aa  65.5  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0457  hypothetical protein  29.55 
 
 		 302 aa  65.5  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1240  SSU ribosomal protein S6P modification protein  26.32 
 
 		 302 aa  65.9  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272934  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2270  ribosomal protein S6 modification protein  26.48 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1299  ribosomal protein S6 modification protein  26.09 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.186898  normal  0.0117357 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0244  alpha-L-glutamate ligase  26.92 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.12128  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1761  lysine biosynthesis enzyme LysX  29.19 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0363  SSU ribosomal protein S6P modification protein  25.11 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3966  alpha-L-glutamate ligase  23.81 
 
 		 456 aa  63.9  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000098482  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1379  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  29.82 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4122  alpha-L-glutamate ligase  24.03 
 
 		 459 aa  63.9  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000650409  hitchhiker  0.00401578 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2266  SSU ribosomal protein S6P modification protein  26.27 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0318  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.72 
 
 		 288 aa  62.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1212  alpha-L-glutamate ligases, RimK family protein  25.59 
 
 		 301 aa  63.2  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0387338  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0444  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.64 
 
 		 272 aa  62.8  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0001654  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2640  S6 modification enzyme RimK  25.59 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.363149  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0686  SSU ribosomal protein S6P modification protein  26.18 
 
 		 301 aa  62  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000259145  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2098  SSU ribosomal protein S6P modification protein  26.12 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.247188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0259  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.79 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.661273 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0291  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.7 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.42871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5941  ribosomal protein S6 modification protein  24.68 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68660  ribosomal protein S6 modification protein  24.68 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05140  ribosomal protein S6 modification enzyme RimK  25 
 
 		 301 aa  60.1  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0234  ribosomal protein S6 modification protein  24.68 
 
 		 301 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0173  S6 modification enzyme RimK  24.68 
 
 		 301 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1687  S6 modification enzyme RimK  29.44 
 
 		 310 aa  60.1  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0316  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.81 
 
 		 282 aa  59.7  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3306  lysine biosynthesis enzyme LysX  26.13 
 
 		 287 aa  59.7  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2289  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.16 
 
 		 300 aa  59.7  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3597  lysine biosynthesis enzyme LysX  25.54 
 
 		 283 aa  59.7  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.109467 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2582  alpha-L-glutamate ligase  27.71 
 
 		 455 aa  59.3  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.151882  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>