More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_3108 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  100 
 
 		 310 aa  635    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  81.17 
 
 		 319 aa  533  1e-150  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  79.67 
 
 		 310 aa  512  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  75.49 
 
 		 310 aa  497  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  78.96 
 
 		 309 aa  488  1e-137  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  73.18 
 
 		 348 aa  464  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4536  thioredoxin reductase  75.25 
 
 		 348 aa  457  1e-127  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  67.54 
 
 		 346 aa  437  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  68.52 
 
 		 340 aa  436  1e-121  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4687  thioredoxin reductase  71.66 
 
 		 329 aa  437  1e-121  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.323134  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  67.43 
 
 		 330 aa  431  1e-120  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9042  thioredoxin reductase  70 
 
 		 317 aa  434  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  69.28 
 
 		 336 aa  427  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  67.21 
 
 		 359 aa  430  1e-119  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  65.68 
 
 		 333 aa  428  1e-119  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  69.74 
 
 		 331 aa  430  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  66.23 
 
 		 310 aa  427  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2547  thioredoxin reductase  67.53 
 
 		 313 aa  426  1e-118  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.788713  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  66.77 
 
 		 332 aa  424  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2148  thioredoxin reductase  68.52 
 
 		 327 aa  422  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37940  thioredoxin-disulfide reductase  67.1 
 
 		 333 aa  419  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  64.5 
 
 		 353 aa  417  9.999999999999999e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  66.56 
 
 		 330 aa  416  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  67.32 
 
 		 333 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  67.32 
 
 		 333 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  63.84 
 
 		 318 aa  413  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  67.32 
 
 		 333 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5084  thioredoxin reductase  69.87 
 
 		 325 aa  407  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4579  thioredoxin reductase  67.73 
 
 		 317 aa  409  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.777909  hitchhiker  0.00491977 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  61.56 
 
 		 318 aa  410  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7086  thioredoxin reductase  64.72 
 
 		 331 aa  406  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4212  thioredoxin reductase  67.21 
 
 		 344 aa  407  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5097  thioredoxin reductase  67.41 
 
 		 362 aa  404  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121367  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  63.28 
 
 		 330 aa  399  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3024  thioredoxin reductase  67.11 
 
 		 325 aa  396  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.352085 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0214  thioredoxin reductase  68.11 
 
 		 329 aa  396  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  64.82 
 
 		 335 aa  390  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  64.61 
 
 		 325 aa  389  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  62.17 
 
 		 318 aa  386  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  63.16 
 
 		 334 aa  384  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  60.52 
 
 		 313 aa  375  1e-103  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3650  thioredoxin reductase  67.33 
 
 		 327 aa  377  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5401  thioredoxin reductase  61.89 
 
 		 361 aa  374  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0030  thioredoxin reductase  60.76 
 
 		 320 aa  369  1e-101  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  59.28 
 
 		 332 aa  369  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  59.61 
 
 		 319 aa  364  1e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  56.25 
 
 		 334 aa  363  2e-99  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0923  thioredoxin reductase  58.82 
 
 		 311 aa  359  3e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  56.96 
 
 		 314 aa  357  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  56.96 
 
 		 314 aa  357  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4637  thioredoxin reductase  56.27 
 
 		 456 aa  356  2.9999999999999997e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000231293  normal  0.140967 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  58.22 
 
 		 311 aa  355  7.999999999999999e-97  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0375  thioredoxin reductase  55.31 
 
 		 312 aa  353  2e-96  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  57.52 
 
 		 311 aa  353  2e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3988  thioredoxin reductase  57.76 
 
 		 325 aa  352  2.9999999999999997e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.717161 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3654  thioredoxin reductase  56.63 
 
 		 458 aa  348  5e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1444  thioredoxin reductase  52.1 
 
 		 339 aa  348  7e-95  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  57.57 
 
 		 320 aa  348  7e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  55.41 
 
 		 311 aa  345  7e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4061  thioredoxin reductase  54.84 
 
 		 453 aa  344  1e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3812  thioredoxin reductase  54.37 
 
 		 460 aa  343  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2394  thioredoxin reductase  54.49 
 
 		 461 aa  343  2e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2343  thioredoxin reductase  54.49 
 
 		 461 aa  343  2e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  55.41 
 
 		 311 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3951  thioredoxin reductase  55.99 
 
 		 314 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  54.75 
 
 		 311 aa  336  2.9999999999999997e-91  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0473  thioredoxin reductase  58.12 
 
 		 314 aa  335  5.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.499551 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1914  thioredoxin reductase  54.55 
 
 		 325 aa  333  3e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6236  thioredoxin reductase  51.97 
 
 		 314 aa  332  4e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.215918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  52.3 
 
 		 311 aa  331  8e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0680  thioredoxin reductase  57.24 
 
 		 320 aa  330  2e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359349  normal  0.0127651 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03581  Thioredoxin reductase (EC 1.8.1.9) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q08GE2]  53.14 
 
 		 339 aa  327  1.0000000000000001e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.813979  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11253  putative thioredoxin reductase  51.97 
 
 		 326 aa  327  1.0000000000000001e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1613  thioredoxin reductase  54.67 
 
 		 322 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2685  thioredoxin reductase  56.39 
 
 		 318 aa  327  1.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0623  thioredoxin reductase  54.98 
 
 		 459 aa  327  2.0000000000000001e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.66148  normal  0.453769 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0086  thioredoxin reductase  52.77 
 
 		 320 aa  326  2.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1354  thioredoxin reductase  52.26 
 
 		 313 aa  326  3e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2343  thioredoxin reductase  52.63 
 
 		 322 aa  325  8.000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  51.95 
 
 		 345 aa  324  1e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2721  thioredoxin reductase  53.07 
 
 		 324 aa  323  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.137171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0614  thioredoxin reductase  53.5 
 
 		 313 aa  322  4e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2943  thioredoxin reductase  54.1 
 
 		 333 aa  322  6e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1344  thioredoxin-disulfide reductase  51.46 
 
 		 320 aa  322  7e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1283  thioredoxin reductase  51.46 
 
 		 320 aa  322  7e-87  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28227  predicted protein  52.4 
 
 		 547 aa  322  7e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0120159 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1692  thioredoxin reductase 1  50.79 
 
 		 314 aa  320  9.999999999999999e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.160177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3225  thioredoxin reductase  50.48 
 
 		 319 aa  320  1.9999999999999998e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00279715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2982  thioredoxin reductase  52.75 
 
 		 324 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0371232 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4165  thioredoxin reductase  53.38 
 
 		 314 aa  320  1.9999999999999998e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.571587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2112  thioredoxin reductase  53.07 
 
 		 324 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1778  thioredoxin-disulfide reductase  50.99 
 
 		 315 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246241  decreased coverage  0.00675935 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  53.95 
 
 		 316 aa  320  1.9999999999999998e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2145  thioredoxin reductase  54.78 
 
 		 314 aa  320  1.9999999999999998e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.610006 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  54.43 
 
 		 321 aa  319  5e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1248  thioredoxin reductase  52.27 
 
 		 324 aa  318  7e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.335568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1780  thioredoxin reductase  50 
 
 		 323 aa  318  7e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.720835 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0375  thioredoxin-disulfide reductase  49.53 
 
 		 323 aa  318  7.999999999999999e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0545  thioredoxin reductase  49.53 
 
 		 323 aa  318  7.999999999999999e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.192083  hitchhiker  0.00000399991 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1360  thioredoxin reductase  51.12 
 
 		 332 aa  317  2e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>