292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1730 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1730  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  100 
 
 		 326 aa  666    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.645559  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1863  family 2 glycosyl transferase  61.66 
 
 		 330 aa  353  2e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15820  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  54.92 
 
 		 343 aa  337  9.999999999999999e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0138111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2961  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  55.27 
 
 		 334 aa  335  7.999999999999999e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.720485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1732  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  55.8 
 
 		 321 aa  335  9e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.14375  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2488  glycosyl transferase family 2  55.76 
 
 		 335 aa  333  2e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000468454  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3452  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  61.74 
 
 		 318 aa  333  3e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.383504  normal  0.0411609 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8126  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  50.62 
 
 		 342 aa  308  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0337  glycosyl transferase family 2  57.5 
 
 		 320 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.435336  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0167  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  51.45 
 
 		 315 aa  272  7e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.33874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0338  glycosyl transferase family 2  54.27 
 
 		 324 aa  271  9e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4157  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  52.94 
 
 		 299 aa  247  2e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000365831  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06330  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  48.87 
 
 		 312 aa  241  1e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5332  glycosyl transferase family 2  44.69 
 
 		 329 aa  241  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1142  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  47.15 
 
 		 325 aa  240  2e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2312  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  38.11 
 
 		 335 aa  236  4e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2860  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  40 
 
 		 325 aa  231  1e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2109  glycosyl transferase family 2  44.01 
 
 		 316 aa  226  4e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3310  glycosyl transferase family 2  42.31 
 
 		 359 aa  226  5.0000000000000005e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4508  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  44.08 
 
 		 319 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2187  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  43.75 
 
 		 319 aa  218  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.442863  normal  0.431936 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11232  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  43.48 
 
 		 324 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.255662  normal  0.13294 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4005  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  42.43 
 
 		 334 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0113294  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4079  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  42.43 
 
 		 334 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4235  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  42.43 
 
 		 334 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.362311 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1165  glycosyl transferase family 2  43.61 
 
 		 302 aa  189  4e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0395  glycosyl transferase family 2  29.24 
 
 		 510 aa  105  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0548319 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0245  hypothetical protein  32.61 
 
 		 395 aa  92  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09131  hypothetical protein  32.61 
 
 		 395 aa  92.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.554848  hitchhiker  0.00082103 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06741  hypothetical protein  33.51 
 
 		 402 aa  88.6  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0870482  normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2607  hypothetical protein  34.52 
 
 		 430 aa  85.5  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.166847  normal  0.278323 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08941  hypothetical protein  27.52 
 
 		 408 aa  84.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0837  hypothetical protein  31.52 
 
 		 408 aa  82.8  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08961  hypothetical protein  31.52 
 
 		 408 aa  82.4  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.359171  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2244  hypothetical protein  33.5 
 
 		 425 aa  81.6  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10451  hypothetical protein  31.52 
 
 		 408 aa  81.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3045  glycosyltransferase-like protein  30.74 
 
 		 363 aa  75.9  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0284255 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1772  cell wall biogenesis glycosyltransferase  23.71 
 
 		 409 aa  74.3  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1090  glycosyl transferase family protein  36 
 
 		 236 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.11948  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1343  glycosyl transferase family protein  36.23 
 
 		 522 aa  73.9  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725214  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1549  glycosyl transferase family protein  30.15 
 
 		 228 aa  71.2  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02160  cell wall biogenesis glycosyltransferase  25.59 
 
 		 407 aa  70.1  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.409645  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2163  cell wall biogenesis glycosyltransferase  25.08 
 
 		 409 aa  68.9  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.407321  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1807  glycosyl transferase family 2  33.79 
 
 		 222 aa  68.2  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1389  glycosyl transferase family 2  35.03 
 
 		 226 aa  67  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0654  hypothetical protein  27.67 
 
 		 391 aa  66.6  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613109  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07780  glycosyl transferase family 2  28.35 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2847  hypothetical protein  27.24 
 
 		 406 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663115  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1287  cell wall biogenesis glycosyltransferase  32.56 
 
 		 373 aa  65.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2601  hypothetical protein  27.55 
 
 		 408 aa  65.9  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.625325  normal  0.0209256 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1651  glycosyl transferase family protein  27.84 
 
 		 206 aa  65.1  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3209  hypothetical protein  27.44 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1456  glycosyltransferase-like protein  26.02 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.443232  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0167  glycosyl transferase family 2  33.06 
 
 		 365 aa  64.3  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00277804  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2567  cell wall biogenesis glycosyltransferase  25.69 
 
 		 407 aa  63.5  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0206766  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2574  cell wall biogenesis glycosyltransferase  25.69 
 
 		 407 aa  63.5  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00191842  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2581  cell wall biogenesis glycosyltransferase  25.69 
 
 		 407 aa  63.5  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000562395  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4062  hypothetical protein  28.63 
 
 		 356 aa  62.4  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1890  hypothetical protein  24.84 
 
 		 409 aa  62.4  0.000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116319  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0737  hypothetical protein  26.78 
 
 		 404 aa  62  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0507  hypothetical protein  26.34 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.551714  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2340  hypothetical protein  24.49 
 
 		 404 aa  61.6  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.122149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2129  hypothetical protein  25 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2044  glycosyl transferase family 2  29.56 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.462866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  38.3 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0453  LmbE-like protein  35.71 
 
 		 693 aa  60.1  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1195  glycosyltransferase-like protein  26.64 
 
 		 365 aa  59.7  0.00000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.809596  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1612  glycosyl transferase family protein  31.19 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0202  histidinol-phosphate phosphatase family protein/glycosyl transferase, group 2 family protein  27.01 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.631531  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2052  hypothetical protein  24.04 
 
 		 405 aa  58.2  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3832  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.84 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.956349  normal  0.0237391 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2502  putative glycosyltransferase  25.93 
 
 		 403 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0127877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2603  hypothetical protein  25 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  28.29 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  25.35 
 
 		 410 aa  57  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0966  glycosyl transferase family protein  31.18 
 
 		 242 aa  57  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0824  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.216941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0335  glycosyl transferase family 2  27.62 
 
 		 346 aa  55.8  0.0000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0337  glycosyl transferase family 2  27.62 
 
 		 349 aa  55.8  0.0000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1452  glycosyl transferase family protein  31.78 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.591361 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2620  glycosyltransferase-like protein  25.81 
 
 		 448 aa  55.5  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1776  glycosyl transferase family 2  36.17 
 
 		 311 aa  55.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1821  hypothetical protein  25.98 
 
 		 416 aa  55.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117561  normal  0.653656 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1041  glycosyl transferase family protein  31.11 
 
 		 222 aa  54.7  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0213116 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  35.79 
 
 		 285 aa  54.7  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2471  glycosyl transferase family 2  35.11 
 
 		 311 aa  54.7  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_190  histidinol-phosphate phosphatase protein/glycosyl transferase  26.56 
 
 		 410 aa  54.3  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00438992  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0773  hypothetical protein  25.33 
 
 		 403 aa  53.1  0.000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4382  glycosyl transferase family 2  28.71 
 
 		 258 aa  53.1  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06620  glycosyl transferase family 2  22.36 
 
 		 221 aa  52.8  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2674  family 2 glycosyl transferase  35.77 
 
 		 285 aa  52.8  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49432  normal  0.387912 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1409  glycosyl transferase family protein  31.31 
 
 		 585 aa  52.8  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0902  GtrA family protein  34.82 
 
 		 428 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258028  normal  0.0796887 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0420  cell wall biogenesis glycosyltransferase  24.04 
 
 		 409 aa  52.4  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.414661  normal  0.295666 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2273  glycosyl transferase family 2  33.66 
 
 		 295 aa  52  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  25.79 
 
 		 694 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2431  glycosyl transferase family 2  36.63 
 
 		 397 aa  51.6  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0527  glycosyl transferase family protein  32.99 
 
 		 374 aa  51.2  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.347971  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4093  glycosyl transferase family 2  31.63 
 
 		 257 aa  51.2  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7655  putative glycosyltransferase  34.15 
 
 		 276 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>