More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0212 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4314  cysteinyl-tRNA synthetase  75.32 
 
 		 467 aa  731    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.951692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0212  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 466 aa  955    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0970  Cysteine--tRNA ligase  71.79 
 
 		 465 aa  667    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0506  cysteinyl-tRNA synthetase  69.59 
 
 		 464 aa  646    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.630345 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0711  cysteinyl-tRNA synthetase  65.74 
 
 		 465 aa  622  1e-177  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.848323  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0654  cysteinyl-tRNA synthetase  61.91 
 
 		 467 aa  578  1e-164  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0512859  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35130  cysteinyl-tRNA synthetase  60.78 
 
 		 459 aa  580  1e-164  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.782995 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0082  cysteinyl-tRNA synthetase  61.57 
 
 		 469 aa  561  1.0000000000000001e-159  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0973  cysteinyl-tRNA synthetase  60.43 
 
 		 463 aa  559  1e-158  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.110281  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8151  cysteinyl-tRNA synthetase  59.2 
 
 		 470 aa  553  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5123  cysteinyl-tRNA synthetase  60.61 
 
 		 481 aa  552  1e-156  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642853  normal  0.372364 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4737  cysteinyl-tRNA synthetase  60.39 
 
 		 481 aa  551  1e-156  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.343923  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4823  cysteinyl-tRNA synthetase  60.39 
 
 		 481 aa  551  1e-156  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0360  cysteinyl-tRNA synthetase  58.33 
 
 		 464 aa  550  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13613  cysteinyl-tRNA synthetase  60.39 
 
 		 469 aa  548  1e-155  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.324359 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4021  cysteinyl-tRNA synthetase  57.54 
 
 		 471 aa  547  1e-154  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163649  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4659  cysteinyl-tRNA synthetase  58.76 
 
 		 471 aa  543  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4222  cysteinyl-tRNA synthetase  59.57 
 
 		 471 aa  530  1e-149  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.926894 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0911  cysteinyl-tRNA synthetase  58.81 
 
 		 471 aa  528  1e-148  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.741601  normal  0.0529443 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0354  cysteinyl-tRNA synthetase  56.9 
 
 		 480 aa  528  1e-148  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0780  cysteinyl-tRNA synthetase  56.63 
 
 		 474 aa  525  1e-148  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.934407  normal  0.176113 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5338  cysteinyl-tRNA synthetase  58.87 
 
 		 463 aa  526  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1446  cysteinyl-tRNA synthetase  59.18 
 
 		 467 aa  519  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.5503  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03760  cysteinyl-tRNA synthetase  57.11 
 
 		 500 aa  520  1e-146  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0729069 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4925  cysteinyl-tRNA synthetase  56.75 
 
 		 473 aa  514  1.0000000000000001e-145  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0605  cysteinyl-tRNA synthetase  57.23 
 
 		 465 aa  516  1.0000000000000001e-145  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03790  cysteinyl-tRNA synthetase  56.4 
 
 		 485 aa  514  1.0000000000000001e-145  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.100441  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31750  cysteinyl-tRNA synthetase  56.57 
 
 		 477 aa  507  9.999999999999999e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.443609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0730  cysteinyl-tRNA synthetase  54.6 
 
 		 487 aa  489  1e-137  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.236803  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0671  cysteinyl-tRNA synthetase  58.17 
 
 		 481 aa  486  1e-136  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.590475  hitchhiker  0.000900008 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0855  cysteinyl-tRNA synthetase  52.95 
 
 		 488 aa  486  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  55.43 
 
 		 451 aa  488  1e-136  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2953  cysteinyl-tRNA synthetase  54.68 
 
 		 480 aa  483  1e-135  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2068  cysteinyl-tRNA synthetase  52.97 
 
 		 469 aa  478  1e-133  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.742832 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0366  cysteinyl-tRNA synthetase  50.19 
 
 		 506 aa  473  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0158714  hitchhiker  0.00296969 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4251  cysteinyl-tRNA synthetase  48.02 
 
 		 524 aa  460  9.999999999999999e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1048  cysteinyl-tRNA synthetase  47.22 
 
 		 549 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0329  cysteine--tRNA ligase  44.51 
 
 		 588 aa  437  1e-121  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.608913 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12690  cysteinyl-tRNA synthetase  48.76 
 
 		 481 aa  411  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  49.78 
 
 		 485 aa  409  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  46.07 
 
 		 481 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  44.2 
 
 		 487 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  44.83 
 
 		 460 aa  395  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19450  cysteinyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 		 498 aa  394  1e-108  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000839474 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 		 486 aa  395  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  44.88 
 
 		 485 aa  393  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 468 aa  391  1e-107  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 		 487 aa  390  1e-107  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  44.61 
 
 		 460 aa  390  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 		 465 aa  385  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 		 468 aa  387  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  46.44 
 
 		 474 aa  388  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 		 465 aa  386  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 493 aa  388  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 		 485 aa  383  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  44.02 
 
 		 459 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  44.02 
 
 		 459 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 		 461 aa  383  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 		 461 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 		 459 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 		 459 aa  384  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 		 463 aa  382  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 461 aa  379  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  44.18 
 
 		 459 aa  379  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 		 459 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1166  cysteinyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 		 461 aa  381  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193068  normal  0.0129624 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 		 481 aa  379  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 		 459 aa  379  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 461 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 459 aa  380  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  42.67 
 
 		 459 aa  381  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  46.87 
 
 		 455 aa  379  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  42.67 
 
 		 459 aa  380  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13190  cysteinyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 499 aa  379  1e-104  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.633789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 		 485 aa  379  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  46.35 
 
 		 461 aa  380  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1940  cysteinyl-tRNA synthetase  43.13 
 
 		 462 aa  380  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  43.53 
 
 		 461 aa  378  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 461 aa  378  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  43.49 
 
 		 494 aa  377  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 		 466 aa  377  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  43.04 
 
 		 460 aa  376  1e-103  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  43.32 
 
 		 459 aa  377  1e-103  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2599  cysteinyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 		 460 aa  378  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00582653  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  41.02 
 
 		 484 aa  378  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 493 aa  378  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 		 461 aa  377  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  42.67 
 
 		 459 aa  376  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  43.53 
 
 		 461 aa  378  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3087  cysteinyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 		 461 aa  375  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869328  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2905  cysteinyl-tRNA synthetase  44.54 
 
 		 460 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.242748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0627  cysteinyl-tRNA synthetase  44.56 
 
 		 461 aa  374  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0130875  normal  0.589324 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0590  cysteinyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 		 461 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00144184  normal  0.0627987 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 		 459 aa  372  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 		 461 aa  375  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2484  cysteinyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 476 aa  374  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000672423  normal  0.0231509 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2878  cysteinyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 		 460 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.846571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0645  cysteinyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 		 461 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.108038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2184  cysteinyl-tRNA synthetase  43.53 
 
 		 461 aa  375  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3096  cysteinyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 		 461 aa  375  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0232678  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>