42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0062 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0062  hypothetical protein  100 
 
 		 443 aa  914    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1246  hypothetical protein  51.57 
 
 		 449 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000280967 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0190  hypothetical protein  50 
 
 		 448 aa  466  9.999999999999999e-131  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1168  hypothetical protein  53.9 
 
 		 436 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0140  hypothetical protein  54.71 
 
 		 432 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3425  hypothetical protein  53.92 
 
 		 431 aa  462  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.220732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28830  hypothetical protein  53.92 
 
 		 431 aa  464  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000708644  decreased coverage  0.000000000585098 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4430  hypothetical protein  52.98 
 
 		 431 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462016  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0327  hypothetical protein  51.58 
 
 		 445 aa  456  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.24422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5142  hypothetical protein  52.66 
 
 		 434 aa  452  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.164057  normal  0.1076 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5415  hypothetical protein  52.27 
 
 		 441 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.602565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2001  hypothetical protein  50.8 
 
 		 443 aa  442  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0214645  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2542  hypothetical protein  52.05 
 
 		 443 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.15406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0223  hypothetical protein  50.47 
 
 		 423 aa  430  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227803  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4979  hypothetical protein  48.76 
 
 		 434 aa  427  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.941662  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1077  hypothetical protein  45.74 
 
 		 446 aa  379  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.044868  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0963  hypothetical protein  35.86 
 
 		 442 aa  301  2e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2228  hypothetical protein  36.55 
 
 		 437 aa  300  3e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4171  hypothetical protein  36.61 
 
 		 438 aa  300  3e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0130561 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1557  hypothetical protein  35.87 
 
 		 444 aa  296  4e-79  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1524  hypothetical protein  34.68 
 
 		 443 aa  287  2e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000521708 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0391  hypothetical protein  35.58 
 
 		 442 aa  279  5e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.762631  normal  0.486737 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2069  hypothetical protein  35 
 
 		 433 aa  280  5e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2562  hypothetical protein  39.51 
 
 		 406 aa  259  8e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00055451  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1221  hypothetical protein  29.66 
 
 		 441 aa  207  3e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0215115  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2147  putative ATP/GTP binding protein  28.21 
 
 		 435 aa  134  3e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.254333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0075  putative ATP/GTP binding protein  24.57 
 
 		 435 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.858141 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2956  putative ATP/GTP binding protein  25.91 
 
 		 442 aa  114  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0271039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1237  putative ATP/GTP binding protein  25.78 
 
 		 450 aa  103  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0916  adenosylhomocysteinase  24.17 
 
 		 430 aa  103  8e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1205  methyl-accepting chemotaxis protein  23.34 
 
 		 444 aa  100  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  hitchhiker  0.00000283136 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3200  ATP/GTP binding protein  24.5 
 
 		 424 aa  100  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.819514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0603  putative ATP/GTP binding protein  25.54 
 
 		 450 aa  99.8  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0711  putative ATP/GTP binding protein  23.65 
 
 		 441 aa  98.6  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0412472  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1159  putative ATP/GTP binding protein  24.32 
 
 		 441 aa  97.4  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3078  putative ATP/GTP binding protein  24.69 
 
 		 440 aa  94.7  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.112528  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1495  methyl-accepting chemotaxis protein  24.36 
 
 		 441 aa  90.1  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4278  methyl-accepting chemotaxis protein  23.53 
 
 		 436 aa  89.4  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05240  hypothetical protein  26.56 
 
 		 440 aa  84.3  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7837  methyl-accepting chemotaxis protein  23.16 
 
 		 464 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3940  hypothetical protein  24.76 
 
 		 413 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1768  hypothetical protein  23.57 
 
 		 407 aa  44.3  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>