More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2845 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2845  Na+/solute symporter  100 
 
 
474 aa  939    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1525  Na+/solute symporter  34.72 
 
 
479 aa  257  3e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0201  Na+/solute symporter  35.91 
 
 
492 aa  217  2.9999999999999998e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0231312  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1232  Na+/solute symporter  33.89 
 
 
494 aa  206  6e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2133  Na+/solute symporter  33.49 
 
 
494 aa  201  3e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.829597  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3259  Na+/solute symporter  31.74 
 
 
494 aa  194  4e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1541  Na+/solute symporter  30.13 
 
 
524 aa  189  1e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.69558  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2927  Na+/solute symporter  30.47 
 
 
491 aa  187  4e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0238  Na+/solute symporter  28.6 
 
 
489 aa  152  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.758968  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  28.8 
 
 
483 aa  150  4e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  29.02 
 
 
488 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3158  Na+/solute symporter  26.86 
 
 
507 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2608  sodium/proline symporter  28.57 
 
 
483 aa  144  4e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0498264  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2686  sodium/proline symporter  27.95 
 
 
486 aa  144  4e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1432  Na+/solute symporter  26.73 
 
 
495 aa  143  7e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0552  sodium/pantothenate symporter  27.08 
 
 
482 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1379  sodium/panthothenate symporter  27.9 
 
 
492 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0385274  normal  0.372154 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3553  sodium/panthothenate symporter  28.66 
 
 
483 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000280994  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03116  sodium/panthothenate symporter  28.51 
 
 
483 aa  139  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.735141  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0448  sodium/pantothenate symporter  28.51 
 
 
483 aa  139  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.293948  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4575  sodium/panthothenate symporter  28.51 
 
 
483 aa  139  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000690231  normal  0.130163 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0448  sodium/panthothenate symporter  28.51 
 
 
483 aa  139  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.024979  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1714  sodium/panthothenate symporter  28.27 
 
 
483 aa  139  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000601067 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3450  sodium/panthothenate symporter  28.51 
 
 
483 aa  139  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000724112  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03067  hypothetical protein  28.51 
 
 
483 aa  139  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.647307  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3742  sodium/panthothenate symporter  28.51 
 
 
483 aa  139  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150129  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3573  sodium/panthothenate symporter  28.88 
 
 
483 aa  139  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0131777  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3645  sodium/panthothenate symporter  28.88 
 
 
483 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00060524 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3680  sodium/panthothenate symporter  29.07 
 
 
483 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.433126 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3742  sodium/panthothenate symporter  28.88 
 
 
483 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.133198 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3574  sodium/panthothenate symporter  28.88 
 
 
483 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  28.12 
 
 
483 aa  138  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1756  sodium/proline symporter  26.49 
 
 
513 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3641  sodium/panthothenate symporter  28.29 
 
 
483 aa  137  4e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000698464  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3321  sodium/panthothenate symporter  28.26 
 
 
494 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2541  sodium/pantothenate symporter  25.66 
 
 
487 aa  135  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000222476  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1520  Sodium/proline symporter  27.44 
 
 
483 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4420  sodium/panthothenate symporter  28.02 
 
 
481 aa  134  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0607009  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3696  sodium/panthothenate symporter  26.2 
 
 
483 aa  134  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2469  sodium/proline symporter  29.8 
 
 
497 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00121427  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  25.66 
 
 
497 aa  133  5e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2874  sodium/panthothenate symporter  27.27 
 
 
495 aa  133  6e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1398  sodium/proline symporter  29.02 
 
 
483 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0934266  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2177  sodium/proline symporter  27.44 
 
 
482 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000107736  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1326  Sodium/proline symporter  26.54 
 
 
488 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0529188  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1463  sodium/proline symporter  29.02 
 
 
483 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.169082  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1588  sodium/proline symporter  29.02 
 
 
483 aa  131  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000493204  unclonable  0.00000000000453194 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  27.01 
 
 
493 aa  131  3e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2865  sodium/proline symporter  29.02 
 
 
483 aa  131  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.468907 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2790  sodium/proline symporter  29.02 
 
 
483 aa  131  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276408  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1854  sodium/proline permease  27.13 
 
 
489 aa  131  3e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.794377  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2770  sodium/proline symporter  29.02 
 
 
483 aa  131  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000703765  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1675  sodium/proline permease  27.44 
 
 
489 aa  130  4.0000000000000003e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1248  Sodium/proline symporter  25.94 
 
 
496 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.126391  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1451  sodium/proline symporter  29.02 
 
 
483 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0423407  unclonable  0.000000000084673 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1494  sodium/proline permease  27.31 
 
 
489 aa  130  7.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.858456  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1677  sodium/panthothenate symporter  27.37 
 
 
479 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.874122  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  26.76 
 
 
518 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1250  sodium/proline symporter  25.37 
 
 
496 aa  127  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0457  sodium/proline symporter  25.11 
 
 
492 aa  128  3e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4995  sodium/proline symporter  26.74 
 
 
492 aa  126  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7582  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0389  sodium/panthothenate symporter  27.35 
 
 
484 aa  126  8.000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00229851  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0455  sodium/panthothenate symporter  27.35 
 
 
484 aa  126  8.000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1209  sodium/panthothenate symporter  27.35 
 
 
484 aa  126  8.000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00169799  normal  0.818802 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1860  sodium/proline symporter  24.73 
 
 
496 aa  126  8.000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0914218  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  25.8 
 
 
493 aa  124  5e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0522  sodium/proline symporter  27.43 
 
 
492 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550728  normal  0.0854838 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1542  sodium/proline symporter  25.83 
 
 
502 aa  122  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.13082 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02712  proline/sodium symporter  25.68 
 
 
493 aa  122  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.076903  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4210  sodium/proline symporter  26.71 
 
 
494 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1415  SSS family Na(+)/proline symporter  25.6 
 
 
499 aa  121  3e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.631202 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4018  sodium/proline symporter  27.01 
 
 
494 aa  120  6e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4818  sodium/proline symporter  26.64 
 
 
492 aa  120  6e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.88778  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5942  sodium/proline symporter  26.65 
 
 
500 aa  120  7e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4946  sodium/proline symporter  26.27 
 
 
492 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2877  sodium/panthothenate symporter  26.83 
 
 
481 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510653 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4736  sodium/proline symporter PutP  27.77 
 
 
506 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3567  sodium/panthothenate symporter  27.04 
 
 
477 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1242  sodium/proline symporter  27.69 
 
 
491 aa  118  1.9999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  27.29 
 
 
492 aa  118  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  27.29 
 
 
492 aa  118  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  27.29 
 
 
492 aa  118  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3686  sodium/panthothenate symporter  26.74 
 
 
483 aa  118  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.925299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  27.29 
 
 
492 aa  117  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  27.29 
 
 
492 aa  118  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3844  sodium/panthothenate symporter  25.49 
 
 
483 aa  117  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325661  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  27.29 
 
 
492 aa  118  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  27.07 
 
 
492 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0148  sodium/proline symporter  25.21 
 
 
499 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.720955  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  26.79 
 
 
492 aa  117  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1081  sodium/proline symporter  28.57 
 
 
498 aa  117  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000772394  unclonable  0.00000000000701401 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  26.79 
 
 
492 aa  117  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3346  sodium/panthothenate symporter  27.34 
 
 
479 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000197319  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3607  sodium/panthothenate symporter  27.34 
 
 
479 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.258245  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54150  sodium/proline symporter PutP  28.18 
 
 
506 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1229  sodium/proline symporter  25.55 
 
 
504 aa  116  6.9999999999999995e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3311  sodium/panthothenate symporter  26.81 
 
 
479 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3261  sodium/panthothenate symporter  26.81 
 
 
479 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0182263  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3560  sodium/panthothenate symporter  26.81 
 
 
479 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000874922 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  25.69 
 
 
492 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>