109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2202 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2202  F0F1 ATP synthase subunit B'  100 
 
 
161 aa  307  2.9999999999999997e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.024698  normal  0.231537 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2614  F0F1 ATP synthase subunit B'  67.08 
 
 
163 aa  195  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.434819  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2717  F0F1 ATP synthase subunit B'  63.64 
 
 
143 aa  176  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3386  F0F1 ATP synthase subunit B'  63.64 
 
 
143 aa  176  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000213894  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0333  F0F1 ATP synthase subunit B'  56.13 
 
 
158 aa  142  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.613666  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2622  F0F1 ATP synthase subunit B'  61.54 
 
 
143 aa  134  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1489  F0F1 ATP synthase subunit B'  52.9 
 
 
138 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.212693  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0984  F0F1 ATP synthase subunit B'  38.46 
 
 
153 aa  115  3e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18521  F0F1 ATP synthase subunit B'  38.46 
 
 
153 aa  115  3e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3335  H+transporting two-sector ATPase subunit B/B'  58.74 
 
 
143 aa  109  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.843429  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1547  F0F1 ATP synthase subunit B'  37.32 
 
 
153 aa  107  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16561  F0F1 ATP synthase subunit B'  37.32 
 
 
153 aa  107  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16441  F0F1 ATP synthase subunit B'  37.32 
 
 
153 aa  106  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2191  F0F1 ATP synthase subunit B'  38.82 
 
 
154 aa  105  2e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16331  F0F1 ATP synthase subunit B'  37.32 
 
 
153 aa  105  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.320116  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15731  F0F1 ATP synthase subunit B'  39.44 
 
 
153 aa  104  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.723597  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0485  F0F1 ATP synthase subunit B'  37.5 
 
 
154 aa  100  8e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.383188  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04801  F0F1 ATP synthase subunit B'  35.97 
 
 
151 aa  90.5  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1873  F0F1-type ATP synthase, subunit b  36.88 
 
 
167 aa  67  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13609  F-ATPase family transporter: protons (mitochondrial)  30.07 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0172  ATP synthase F0, B subunit  31.82 
 
 
238 aa  65.1  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173699  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  34.04 
 
 
164 aa  64.7  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  33.61 
 
 
161 aa  61.6  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  31.94 
 
 
164 aa  61.2  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5434  F0F1 ATP synthase subunit B  35.42 
 
 
168 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  33.09 
 
 
168 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5107  F0F1 ATP synthase subunit B  34.72 
 
 
168 aa  59.7  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.164846  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5487  F0F1 ATP synthase subunit B  35.42 
 
 
168 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115712  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5431  F0F1 ATP synthase subunit B  35.42 
 
 
168 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5159  F0F1 ATP synthase subunit B  35.42 
 
 
168 aa  58.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4992  F0F1 ATP synthase subunit B  35.42 
 
 
168 aa  58.5  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.416511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5009  F0F1 ATP synthase subunit B  35.42 
 
 
168 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5551  F0F1 ATP synthase subunit B  35.42 
 
 
168 aa  58.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0100473  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5520  F0F1 ATP synthase subunit B  34.72 
 
 
168 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000205849  hitchhiker  2.15653e-17 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5400  F0F1 ATP synthase subunit B  35.42 
 
 
168 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.95382e-52 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 
178 aa  56.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  30.95 
 
 
166 aa  56.2  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4169  ATP synthase F0, B subunit  34.88 
 
 
165 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0813106  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  30.43 
 
 
164 aa  55.1  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  30.43 
 
 
164 aa  55.1  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  31.25 
 
 
164 aa  55.1  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  28.06 
 
 
162 aa  54.3  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  28.24 
 
 
181 aa  54.3  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0079  ATP synthase F0, B subunit  32.56 
 
 
162 aa  52  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2141  ATP synthase F0, B subunit  31.25 
 
 
163 aa  52  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  31.88 
 
 
168 aa  51.6  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0463  ATP synthase F0, B subunit  27.21 
 
 
172 aa  50.1  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.018727  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2701  ATP synthase F1, delta subunit, putative  30.56 
 
 
253 aa  49.7  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0093  F0F1 ATP synthase subunit B  32.86 
 
 
156 aa  48.5  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0481406  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  32.86 
 
 
156 aa  48.5  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0367309  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  32.31 
 
 
165 aa  48.1  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0661  F0F1-type ATP synthase, subunit b  24.62 
 
 
176 aa  48.1  0.00006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.300947  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  32.14 
 
 
156 aa  47.4  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000584216  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0323  F0F1 ATP synthase subunit B  32.87 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  0.601696 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2953  F0F1 ATP synthase subunit B  32.14 
 
 
156 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043981  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  32.14 
 
 
156 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776663  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0294  ATP synthase F0, B subunit  28.46 
 
 
161 aa  47  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1975  ATP synthase F0, B subunit  27.68 
 
 
166 aa  47  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0171213  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0416  F0F1 ATP synthase subunit B  38.2 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.489173  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0118  F0F1 ATP synthase subunit B  32.14 
 
 
156 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100936  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3284  F0F1 ATP synthase subunit B  31.43 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294476  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0110  F0F1 ATP synthase subunit B  31.47 
 
 
156 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000261662  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2826  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30 
 
 
138 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2217  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  28.99 
 
 
140 aa  46.6  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.268099  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3361  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  27.01 
 
 
140 aa  45.8  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.153256  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0368  F0F1 ATP synthase subunit B  33.72 
 
 
156 aa  45.1  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.685642  normal  0.393865 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4485  ATP synthase F0, B subunit  31.06 
 
 
175 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.594987  normal  0.141672 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5023  ATP synthase F0, B subunit  30.99 
 
 
151 aa  44.7  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.203888  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3898  F0F1 ATP synthase subunit B  31.43 
 
 
156 aa  44.7  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1312  ATP synthase F0 subunit B  25.17 
 
 
181 aa  44.7  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2953  F0F1 ATP synthase subunit B  31.43 
 
 
156 aa  44.3  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193165  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0183  F0F1 ATP synthase subunit B  31.43 
 
 
156 aa  44.3  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2169  F0F1 ATP synthase subunit B  29.08 
 
 
156 aa  44.3  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000388738  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3312  F0F1 ATP synthase subunit B  31.43 
 
 
156 aa  44.3  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0288951  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3359  F0F1 ATP synthase subunit B  31.43 
 
 
156 aa  44.3  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1591  F0F1 ATP synthase subunit B  31.43 
 
 
156 aa  44.3  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000339431  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3972  F0F1 ATP synthase subunit B  31.43 
 
 
156 aa  44.3  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.993966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4046  F0F1 ATP synthase subunit B  31.43 
 
 
156 aa  44.3  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3011  F0F1 ATP synthase subunit B  31.43 
 
 
156 aa  44.3  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209415  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3307  F0F1 ATP synthase subunit B  33.61 
 
 
179 aa  44.3  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000544388  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0036  F0F1 ATP synthase subunit B  30.71 
 
 
156 aa  43.9  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00144365  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  26.43 
 
 
175 aa  43.9  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1937  F0F1 ATP synthase subunit B  27.56 
 
 
168 aa  43.9  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.385177  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0022  ATP synthase F0, B subunit  32.62 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0311887  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf043  ATP synthase B chain  27.27 
 
 
176 aa  43.5  0.001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  30.61 
 
 
175 aa  43.5  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  31.88 
 
 
179 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3191  F0F1 ATP synthase subunit B  30.71 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0476  F0F1 ATP synthase subunit B  32.58 
 
 
156 aa  43.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.219933  normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3154  ATP synthase F0, B subunit  28.89 
 
 
189 aa  43.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0803  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  27.78 
 
 
152 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2329  ATP synthase F0, B subunit  26.76 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000028913  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12090  ATP synthase, F0 subunit b  26.39 
 
 
199 aa  42.7  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  25.18 
 
 
167 aa  42.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0199  ATP synthase F0, B subunit  24.48 
 
 
164 aa  42.4  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3516  F0F1 ATP synthase subunit B  30 
 
 
156 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.346164  hitchhiker  0.000127019 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1716  ATP synthase F0, B subunit  31.36 
 
 
163 aa  42.4  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000198199  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4110  ATP synthase F0, subunit B  31.91 
 
 
156 aa  41.6  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000255147  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  25.71 
 
 
173 aa  42  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3309  F0F1 ATP synthase subunit B  29.37 
 
 
156 aa  42  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.384998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>