111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1230 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_1242  photosystem II reaction centre protein PsbD/D2  89.49 
 
 		 351 aa  646    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.30805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2512  photosystem II reaction centre protein PsbD/D2  89.49 
 
 		 351 aa  646    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000139889  normal  0.112901 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0317  photosystem II reaction centre protein PsbD/D2  87.78 
 
 		 351 aa  643    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.404544  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0668  photosystem II reaction centre protein PsbD/D2  87.78 
 
 		 370 aa  642    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.704102  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1992  photosystem II D2 protein (photosystem q(a) protein)  88.64 
 
 		 351 aa  645    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0481037  normal  0.145245 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2375  photosystem II D2 protein (photosystem q(a) protein)  88.64 
 
 		 351 aa  645    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.116163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0655  photosystem II D2 protein (photosystem q(a) protein)  87.22 
 
 		 352 aa  642    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1637  photosystem II D2 protein (photosystem q(a) protein)  87.22 
 
 		 352 aa  642    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.719245  normal  0.411385 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1230  photosystem II D2 protein (photosystem q(a) protein)  100 
 
 		 352 aa  717    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.0000000683761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1987  photosystem II D2 protein (photosystem q(a) protein)  89.77 
 
 		 352 aa  655    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000347488  normal  0.0187293 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0056  photosystem II D2 protein (photosystem q(a) protein)  89.77 
 
 		 352 aa  655    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1960  photosystem II D2 protein (photosystem q(a) protein)  89.77 
 
 		 352 aa  655    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0579  photosystem II D2 protein (photosystem q(a) protein)  88.35 
 
 		 352 aa  653    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2974  photosystem II D2 protein (photosystem q(a) protein)  88.35 
 
 		 352 aa  653    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0054  photosystem II D2 protein (photosystem q(a) protein)  89.77 
 
 		 352 aa  655    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000310792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0218  photosystem II D2 protein (photosystem q(a) protein)  87.22 
 
 		 352 aa  645    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00749598  normal  0.140739 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5031  photosystem II D2 protein (photosystem q(a) protein)  87.22 
 
 		 352 aa  645    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3778  photosystem II D2 protein  87.78 
 
 		 351 aa  632  1e-180  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000016634  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1059  photosystem II D2 protein  87.78 
 
 		 351 aa  632  1e-180  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00303262  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08431  photosystem II PsbD protein (D2)  82.95 
 
 		 361 aa  615  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1256  photosystem II D2 protein (photosystem q(a) protein)  79.11 
 
 		 358 aa  588  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.525439  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13341  photosystem II PsbD protein (D2)  79.11 
 
 		 358 aa  588  1e-167  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13241  photosystem II PsbD protein (D2)  79.11 
 
 		 358 aa  588  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0553037  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13491  photosystem II PsbD protein (D2)  79.11 
 
 		 358 aa  588  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0767  photosystem II reaction centre protein PsbD/D2  79.39 
 
 		 358 aa  585  1e-166  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16071  photosystem II PsbD protein (D2)  78.83 
 
 		 358 aa  585  1e-166  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0432746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12331  photosystem II PsbD protein (D2)  78.55 
 
 		 358 aa  578  1e-164  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.153207 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02461  photosystem II PsbA protein (D1)  32.31 
 
 		 360 aa  156  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0943  photosystem II reaction centre protein PsbA/D1  32.79 
 
 		 358 aa  154  2.9999999999999998e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0424  photosystem q(b) protein  30.94 
 
 		 360 aa  153  4e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2987  photosystem q(b) protein  30.1 
 
 		 360 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.863091 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1042  photosystem q(b) protein  32.38 
 
 		 358 aa  152  1e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0830  photosystem q(b) protein  31.33 
 
 		 360 aa  152  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00028698  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0225  photosystem q(b) protein  31.71 
 
 		 360 aa  151  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1144  photosystem q(b) protein  31.71 
 
 		 360 aa  151  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0893  photosystem q(b) protein  31.37 
 
 		 360 aa  151  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000000000240892  decreased coverage  0.000169599 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1389  photosystem q(b) protein  31.37 
 
 		 360 aa  151  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.00000000000163699  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1652  photosystem q(b) protein  31.44 
 
 		 360 aa  151  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.390921  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02441  photosystem II PsbA protein (D1)  31.71 
 
 		 360 aa  151  2e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.729491  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12521  hypothetical protein  31.71 
 
 		 360 aa  151  2e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02531  photosystem II PsbA protein (D1)  31.71 
 
 		 360 aa  151  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02551  hypothetical protein  31.71 
 
 		 360 aa  151  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02451  photosystem II PsbA protein (D1)  31.71 
 
 		 360 aa  151  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0558  photosystem II reaction centre protein PsbA/D1  31.36 
 
 		 360 aa  148  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0735  photosystem II reaction centre protein PsbA/D1  31.36 
 
 		 360 aa  148  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.166966  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1592  photosystem II reaction centre protein PsbA/D1  31.36 
 
 		 360 aa  148  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.466002  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03031  hypothetical protein  31.36 
 
 		 360 aa  148  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.235365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13251  hypothetical protein  31.36 
 
 		 360 aa  148  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.561783  normal  0.197158 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15721  hypothetical protein  31.36 
 
 		 360 aa  148  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.131507 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1059  photosystem q(b) protein  30.52 
 
 		 360 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000514626 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1583  photosystem II reaction centre protein PsbA/D1  34.3 
 
 		 360 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000169219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0182  photosystem q(b) protein  31.32 
 
 		 353 aa  147  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.0000857268  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0183  photosystem q(b) protein  31.32 
 
 		 353 aa  147  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00000980824  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4763  photosystem q(b) protein  31.32 
 
 		 353 aa  147  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0578222 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04091  photosystem II PsbA protein (D1)  32.66 
 
 		 358 aa  147  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18681  hypothetical protein  32.66 
 
 		 358 aa  147  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.228862 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2138  photosystem II reaction centre protein PsbA/D1  30.77 
 
 		 360 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1498  photosystem q(b) protein  30.19 
 
 		 360 aa  146  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000298258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1597  photosystem II reaction centre protein PsbA/D1  31.13 
 
 		 360 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000196706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2460  photosystem II reaction centre protein PsbA/D1  31.13 
 
 		 360 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3553  photosystem II reaction centre protein PsbA/D1  31.13 
 
 		 360 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1706  photosystem q(b) protein  32 
 
 		 362 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000313247 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0169  photosystem q(b) protein  30.74 
 
 		 356 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0452427 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1049  photosystem q(b) protein  30.74 
 
 		 356 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0115915 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2293  photosystem q(b) protein  30.74 
 
 		 356 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2904  photosystem q(b) protein  31.65 
 
 		 354 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1267  photosystem q(b) protein  30.43 
 
 		 356 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000399793  hitchhiker  0.00458282 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2041  photosystem q(b) protein  30.43 
 
 		 356 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000221141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1237  photosystem q(b) protein  30.43 
 
 		 356 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2016  photosystem q(b) protein  30.43 
 
 		 356 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3216  photosystem q(b) protein  31.65 
 
 		 354 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3899  photosystem q(b) protein  27.14 
 
 		 356 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0661393  normal  0.162734 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4121  photosystem II reaction centre protein PsbA/D1  30.35 
 
 		 356 aa  139  7.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0216201 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3850  photosystem q(b) protein  26.84 
 
 		 356 aa  139  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1814  photosystem II reaction centre protein PsbA/D1  30.66 
 
 		 359 aa  131  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1817  photosystem II reaction centre protein PsbA/D1  30.66 
 
 		 359 aa  131  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2036  photosystem II reaction centre protein PsbA/D1  30.66 
 
 		 359 aa  131  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0307  photosystem q(b) protein  29.67 
 
 		 359 aa  131  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0519  photosystem q(b) protein  29.67 
 
 		 359 aa  131  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.528098  normal  0.681573 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1564  photosystem q(b) protein  28.57 
 
 		 356 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.27544 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1640  photosynthetic reaction center subunit M  26.7 
 
 		 304 aa  61.6  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.761486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3994  photosynthetic reaction center subunit M  29.41 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0754193 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1717  photosynthetic reaction center subunit M  29.35 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1300  photosynthetic reaction center subunit M  25.84 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3749  photosynthetic reaction center subunit M  29.41 
 
 		 307 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.201417  hitchhiker  0.0015702 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3754  bifunctional photosynthetic reaction center subunit L/M  25.14 
 
 		 641 aa  53.1  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0347506  hitchhiker  0.005487 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6430  photosynthetic reaction center subunit M  29.28 
 
 		 308 aa  52.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.864095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1604  photosynthetic reaction center subunit M  24.54 
 
 		 323 aa  51.6  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.16429  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3268  bifunctional photosynthetic reaction center subunit L/M  24.57 
 
 		 643 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0578169 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2975  photosynthetic reaction center subunit L  25 
 
 		 276 aa  49.3  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151561  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3995  photosynthetic reaction center subunit L  25.9 
 
 		 277 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.118346  normal  0.0163614 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3750  photosynthetic reaction center subunit L  25.9 
 
 		 277 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.279579  hitchhiker  0.00154675 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3524  photosynthetic reaction center subunit M  27.16 
 
 		 330 aa  48.5  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.157228  normal  0.60913 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1716  photosynthetic reaction center subunit L  25.69 
 
 		 277 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6431  photosynthetic reaction center subunit L  22.65 
 
 		 281 aa  47.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0256  photosynthetic reaction center subunit M  27.75 
 
 		 308 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.186945  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1299  photosynthetic reaction center subunit L  25.69 
 
 		 277 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1899  photosynthetic reaction center subunit M  27.75 
 
 		 308 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489132  normal  0.475655 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3703  photosynthetic reaction center subunit L  26.43 
 
 		 274 aa  45.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0461593  hitchhiker  0.00115696 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1639  photosynthetic reaction center subunit L  23 
 
 		 311 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>