106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0424 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0558  photosystem II reaction centre protein PsbA/D1  86.15 
 
 		 360 aa  648    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0735  photosystem II reaction centre protein PsbA/D1  86.15 
 
 		 360 aa  648    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.166966  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1592  photosystem II reaction centre protein PsbA/D1  86.15 
 
 		 360 aa  648    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.466002  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1597  photosystem II reaction centre protein PsbA/D1  87.22 
 
 		 360 aa  676    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000196706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2138  photosystem II reaction centre protein PsbA/D1  88.61 
 
 		 360 aa  682    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2460  photosystem II reaction centre protein PsbA/D1  87.22 
 
 		 360 aa  676    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3553  photosystem II reaction centre protein PsbA/D1  87.22 
 
 		 360 aa  676    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0943  photosystem II reaction centre protein PsbA/D1  89.11 
 
 		 358 aa  669    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1814  photosystem II reaction centre protein PsbA/D1  87.15 
 
 		 359 aa  640    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1817  photosystem II reaction centre protein PsbA/D1  87.15 
 
 		 359 aa  640    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2036  photosystem II reaction centre protein PsbA/D1  87.15 
 
 		 359 aa  640    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0307  photosystem q(b) protein  87.15 
 
 		 359 aa  639    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0519  photosystem q(b) protein  87.15 
 
 		 359 aa  639    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.528098  normal  0.681573 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1042  photosystem q(b) protein  89.94 
 
 		 358 aa  673    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0225  photosystem q(b) protein  86.15 
 
 		 360 aa  648    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1144  photosystem q(b) protein  86.15 
 
 		 360 aa  648    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0424  photosystem q(b) protein  100 
 
 		 360 aa  740    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0893  photosystem q(b) protein  93.06 
 
 		 360 aa  698    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000000000240892  decreased coverage  0.000169599 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1389  photosystem q(b) protein  93.06 
 
 		 360 aa  698    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.00000000000163699  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0830  photosystem q(b) protein  87.22 
 
 		 360 aa  676    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00028698  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0182  photosystem q(b) protein  88.33 
 
 		 353 aa  666    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.0000857268  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0183  photosystem q(b) protein  88.33 
 
 		 353 aa  666    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00000980824  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4763  photosystem q(b) protein  88.61 
 
 		 353 aa  667    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0578222 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1652  photosystem q(b) protein  87.78 
 
 		 360 aa  678    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.390921  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02441  photosystem II PsbA protein (D1)  86.43 
 
 		 360 aa  649    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.729491  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12521  hypothetical protein  86.43 
 
 		 360 aa  649    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02531  photosystem II PsbA protein (D1)  86.43 
 
 		 360 aa  649    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02551  hypothetical protein  86.43 
 
 		 360 aa  649    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03031  hypothetical protein  86.15 
 
 		 360 aa  648    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.235365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13251  hypothetical protein  86.15 
 
 		 360 aa  648    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.561783  normal  0.197158 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15721  hypothetical protein  86.15 
 
 		 360 aa  648    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.131507 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04091  photosystem II PsbA protein (D1)  87.71 
 
 		 358 aa  661    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18681  hypothetical protein  87.71 
 
 		 358 aa  661    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.228862 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02451  photosystem II PsbA protein (D1)  86.43 
 
 		 360 aa  649    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02461  photosystem II PsbA protein (D1)  86.39 
 
 		 360 aa  644    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1237  photosystem q(b) protein  88.06 
 
 		 356 aa  664    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2016  photosystem q(b) protein  88.06 
 
 		 356 aa  664    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3216  photosystem q(b) protein  89.52 
 
 		 354 aa  667    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0169  photosystem q(b) protein  88.06 
 
 		 356 aa  667    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0452427 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1049  photosystem q(b) protein  88.61 
 
 		 356 aa  667    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0115915 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2293  photosystem q(b) protein  88.61 
 
 		 356 aa  667    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1059  photosystem q(b) protein  88.06 
 
 		 360 aa  677    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000514626 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1498  photosystem q(b) protein  88.89 
 
 		 360 aa  684    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000298258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1267  photosystem q(b) protein  88.06 
 
 		 356 aa  664    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000399793  hitchhiker  0.00458282 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2041  photosystem q(b) protein  88.06 
 
 		 356 aa  664    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000221141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2904  photosystem q(b) protein  89.52 
 
 		 354 aa  667    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2987  photosystem q(b) protein  74.93 
 
 		 360 aa  589  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.863091 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1706  photosystem q(b) protein  78.15 
 
 		 362 aa  581  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000313247 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1583  photosystem II reaction centre protein PsbA/D1  80.4 
 
 		 360 aa  576  1.0000000000000001e-163  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000169219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3899  photosystem q(b) protein  67.42 
 
 		 356 aa  519  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0661393  normal  0.162734 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3850  photosystem q(b) protein  68.26 
 
 		 356 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4121  photosystem II reaction centre protein PsbA/D1  66.29 
 
 		 356 aa  505  9.999999999999999e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0216201 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1564  photosystem q(b) protein  70.4 
 
 		 356 aa  502  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.27544 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12331  photosystem II PsbD protein (D2)  34.08 
 
 		 358 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.153207 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0218  photosystem II D2 protein (photosystem q(a) protein)  33.33 
 
 		 352 aa  162  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00749598  normal  0.140739 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5031  photosystem II D2 protein (photosystem q(a) protein)  33.33 
 
 		 352 aa  162  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1992  photosystem II D2 protein (photosystem q(a) protein)  32.46 
 
 		 351 aa  162  8.000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0481037  normal  0.145245 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2375  photosystem II D2 protein (photosystem q(a) protein)  32.46 
 
 		 351 aa  162  8.000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.116163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0317  photosystem II reaction centre protein PsbD/D2  32.13 
 
 		 351 aa  161  2e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.404544  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0668  photosystem II reaction centre protein PsbD/D2  31.25 
 
 		 370 aa  161  2e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.704102  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3778  photosystem II D2 protein  31.73 
 
 		 351 aa  159  5e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000016634  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1059  photosystem II D2 protein  31.73 
 
 		 351 aa  159  5e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00303262  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0056  photosystem II D2 protein (photosystem q(a) protein)  31.29 
 
 		 352 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1960  photosystem II D2 protein (photosystem q(a) protein)  31.29 
 
 		 352 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0054  photosystem II D2 protein (photosystem q(a) protein)  31.29 
 
 		 352 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000310792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1987  photosystem II D2 protein (photosystem q(a) protein)  31.29 
 
 		 352 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000347488  normal  0.0187293 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16071  photosystem II PsbD protein (D2)  33.67 
 
 		 358 aa  159  9e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0432746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1256  photosystem II D2 protein (photosystem q(a) protein)  33.33 
 
 		 358 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.525439  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0655  photosystem II D2 protein (photosystem q(a) protein)  32.21 
 
 		 352 aa  158  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1637  photosystem II D2 protein (photosystem q(a) protein)  32.21 
 
 		 352 aa  158  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.719245  normal  0.411385 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13341  photosystem II PsbD protein (D2)  33.33 
 
 		 358 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13241  photosystem II PsbD protein (D2)  33.33 
 
 		 358 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0553037  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13491  photosystem II PsbD protein (D2)  33.33 
 
 		 358 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0767  photosystem II reaction centre protein PsbD/D2  33.33 
 
 		 358 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0579  photosystem II D2 protein (photosystem q(a) protein)  32.21 
 
 		 352 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2974  photosystem II D2 protein (photosystem q(a) protein)  32.21 
 
 		 352 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1242  photosystem II reaction centre protein PsbD/D2  32.21 
 
 		 351 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.30805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2512  photosystem II reaction centre protein PsbD/D2  32.21 
 
 		 351 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000139889  normal  0.112901 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08431  photosystem II PsbD protein (D2)  31.56 
 
 		 361 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1230  photosystem II D2 protein (photosystem q(a) protein)  30.94 
 
 		 352 aa  153  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.0000000683761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3754  bifunctional photosynthetic reaction center subunit L/M  27.4 
 
 		 641 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0347506  hitchhiker  0.005487 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3524  photosynthetic reaction center subunit M  27.04 
 
 		 330 aa  55.8  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.157228  normal  0.60913 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1639  photosynthetic reaction center subunit L  25.12 
 
 		 311 aa  55.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1604  photosynthetic reaction center subunit M  27.97 
 
 		 323 aa  55.1  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.16429  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6430  photosynthetic reaction center subunit M  27.1 
 
 		 308 aa  55.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.864095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1300  photosynthetic reaction center subunit M  23.89 
 
 		 306 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3749  photosynthetic reaction center subunit M  29.06 
 
 		 307 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.201417  hitchhiker  0.0015702 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3268  bifunctional photosynthetic reaction center subunit L/M  27.21 
 
 		 643 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0578169 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2059  photosynthetic reaction center subunit M  26.06 
 
 		 321 aa  51.2  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0281162 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0256  photosynthetic reaction center subunit M  28.78 
 
 		 308 aa  50.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.186945  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1899  photosynthetic reaction center subunit M  28.78 
 
 		 308 aa  50.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489132  normal  0.475655 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2029  photosynthetic reaction center subunit M  28.78 
 
 		 308 aa  50.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.995154  normal  0.889355 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3704  photosynthetic reaction center subunit M  28.36 
 
 		 326 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0965867  hitchhiker  0.00123144 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2974  photosynthetic reaction center subunit M  22.78 
 
 		 306 aa  50.4  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0940818  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1717  photosynthetic reaction center subunit M  27.35 
 
 		 307 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2812  photosynthetic reaction center subunit L  25.58 
 
 		 274 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.314844  normal  0.517978 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2737  photosynthetic reaction center subunit M  24.83 
 
 		 325 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2859  photosynthetic reaction center subunit M  24.83 
 
 		 325 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2964  photosynthetic reaction center subunit M  24.83 
 
 		 325 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.459774 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3994  photosynthetic reaction center subunit M  26.5 
 
 		 307 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0754193 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>