108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0893 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0558  photosystem II reaction centre protein PsbA/D1  86.07 
 
 
360 aa  645    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0735  photosystem II reaction centre protein PsbA/D1  86.07 
 
 
360 aa  645    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.166966  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1592  photosystem II reaction centre protein PsbA/D1  86.07 
 
 
360 aa  645    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.466002  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1597  photosystem II reaction centre protein PsbA/D1  91.39 
 
 
360 aa  698    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000196706  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2138  photosystem II reaction centre protein PsbA/D1  90.56 
 
 
360 aa  694    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2460  photosystem II reaction centre protein PsbA/D1  91.39 
 
 
360 aa  698    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3553  photosystem II reaction centre protein PsbA/D1  91.39 
 
 
360 aa  698    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0943  photosystem II reaction centre protein PsbA/D1  87.71 
 
 
358 aa  656    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1814  photosystem II reaction centre protein PsbA/D1  91.06 
 
 
359 aa  661    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1817  photosystem II reaction centre protein PsbA/D1  91.06 
 
 
359 aa  661    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2036  photosystem II reaction centre protein PsbA/D1  91.06 
 
 
359 aa  661    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0307  photosystem q(b) protein  91.06 
 
 
359 aa  660    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0519  photosystem q(b) protein  91.06 
 
 
359 aa  660    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.528098  normal  0.681573 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1042  photosystem q(b) protein  88.83 
 
 
358 aa  663    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0225  photosystem q(b) protein  86.07 
 
 
360 aa  645    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1144  photosystem q(b) protein  86.07 
 
 
360 aa  645    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0424  photosystem q(b) protein  93.06 
 
 
360 aa  698    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0893  photosystem q(b) protein  100 
 
 
360 aa  738    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000000000240892  decreased coverage  0.000169599 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1389  photosystem q(b) protein  100 
 
 
360 aa  738    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.00000000000163699  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0830  photosystem q(b) protein  90 
 
 
360 aa  689    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00028698  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2041  photosystem q(b) protein  91.11 
 
 
356 aa  684    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000221141  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2904  photosystem q(b) protein  90.96 
 
 
354 aa  681    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0182  photosystem q(b) protein  92.02 
 
 
353 aa  682    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.0000857268  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0183  photosystem q(b) protein  92.02 
 
 
353 aa  682    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00000980824  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4763  photosystem q(b) protein  91.74 
 
 
353 aa  681    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0578222 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1652  photosystem q(b) protein  90.28 
 
 
360 aa  690    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.390921  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02441  photosystem II PsbA protein (D1)  86.35 
 
 
360 aa  647    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.729491  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12521  hypothetical protein  86.35 
 
 
360 aa  647    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02531  photosystem II PsbA protein (D1)  86.35 
 
 
360 aa  647    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02551  hypothetical protein  86.35 
 
 
360 aa  647    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03031  hypothetical protein  86.07 
 
 
360 aa  645    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.235365  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13251  hypothetical protein  86.07 
 
 
360 aa  645    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.561783  normal  0.197158 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15721  hypothetical protein  86.07 
 
 
360 aa  645    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.131507 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04091  photosystem II PsbA protein (D1)  87.71 
 
 
358 aa  658    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18681  hypothetical protein  87.71 
 
 
358 aa  658    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.228862 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02451  photosystem II PsbA protein (D1)  86.35 
 
 
360 aa  647    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02461  photosystem II PsbA protein (D1)  86.07 
 
 
360 aa  643    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1237  photosystem q(b) protein  91.11 
 
 
356 aa  684    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2016  photosystem q(b) protein  91.11 
 
 
356 aa  684    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3216  photosystem q(b) protein  90.96 
 
 
354 aa  681    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0169  photosystem q(b) protein  91.11 
 
 
356 aa  688    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0452427 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1049  photosystem q(b) protein  91.67 
 
 
356 aa  687    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0115915 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2293  photosystem q(b) protein  91.67 
 
 
356 aa  687    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1059  photosystem q(b) protein  87.78 
 
 
360 aa  674    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000514626 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1498  photosystem q(b) protein  89.72 
 
 
360 aa  688    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000298258  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1267  photosystem q(b) protein  91.11 
 
 
356 aa  684    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000399793  hitchhiker  0.00458282 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2987  photosystem q(b) protein  76.88 
 
 
360 aa  600  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.863091 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1706  photosystem q(b) protein  80.74 
 
 
362 aa  594  1e-169  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000313247 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1583  photosystem II reaction centre protein PsbA/D1  82.71 
 
 
360 aa  590  1e-167  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000169219  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3850  photosystem q(b) protein  69.38 
 
 
356 aa  525  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3899  photosystem q(b) protein  68.54 
 
 
356 aa  523  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0661393  normal  0.162734 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4121  photosystem II reaction centre protein PsbA/D1  66.57 
 
 
356 aa  510  1e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0216201 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1564  photosystem q(b) protein  71.23 
 
 
356 aa  505  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.27544 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12331  photosystem II PsbD protein (D2)  34.41 
 
 
358 aa  169  5e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.153207 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0218  photosystem II D2 protein (photosystem q(a) protein)  33.11 
 
 
352 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00749598  normal  0.140739 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5031  photosystem II D2 protein (photosystem q(a) protein)  33.11 
 
 
352 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1992  photosystem II D2 protein (photosystem q(a) protein)  32.79 
 
 
351 aa  166  8e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0481037  normal  0.145245 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2375  photosystem II D2 protein (photosystem q(a) protein)  32.79 
 
 
351 aa  166  8e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.116163  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3778  photosystem II D2 protein  32.79 
 
 
351 aa  165  1.0000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000016634  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1059  photosystem II D2 protein  32.79 
 
 
351 aa  165  1.0000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00303262  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0317  photosystem II reaction centre protein PsbD/D2  32.46 
 
 
351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.404544  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0668  photosystem II reaction centre protein PsbD/D2  32.46 
 
 
370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.704102  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0056  photosystem II D2 protein (photosystem q(a) protein)  31.73 
 
 
352 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1960  photosystem II D2 protein (photosystem q(a) protein)  31.73 
 
 
352 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0054  photosystem II D2 protein (photosystem q(a) protein)  31.73 
 
 
352 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000310792  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1987  photosystem II D2 protein (photosystem q(a) protein)  31.73 
 
 
352 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000347488  normal  0.0187293 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0655  photosystem II D2 protein (photosystem q(a) protein)  31.73 
 
 
352 aa  162  8.000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1637  photosystem II D2 protein (photosystem q(a) protein)  31.73 
 
 
352 aa  162  8.000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.719245  normal  0.411385 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16071  photosystem II PsbD protein (D2)  33.12 
 
 
358 aa  162  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0432746  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1256  photosystem II D2 protein (photosystem q(a) protein)  32.8 
 
 
358 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.525439  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13341  photosystem II PsbD protein (D2)  32.8 
 
 
358 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13241  photosystem II PsbD protein (D2)  32.8 
 
 
358 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0553037  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13491  photosystem II PsbD protein (D2)  32.8 
 
 
358 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0767  photosystem II reaction centre protein PsbD/D2  32.8 
 
 
358 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1242  photosystem II reaction centre protein PsbD/D2  32.05 
 
 
351 aa  161  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.30805  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2512  photosystem II reaction centre protein PsbD/D2  32.05 
 
 
351 aa  161  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000139889  normal  0.112901 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0579  photosystem II D2 protein (photosystem q(a) protein)  31.73 
 
 
352 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2974  photosystem II D2 protein (photosystem q(a) protein)  31.73 
 
 
352 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08431  photosystem II PsbD protein (D2)  33.11 
 
 
361 aa  157  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1230  photosystem II D2 protein (photosystem q(a) protein)  31.37 
 
 
352 aa  151  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.0000000683761  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1639  photosynthetic reaction center subunit L  26.05 
 
 
311 aa  61.6  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3524  photosynthetic reaction center subunit M  25.57 
 
 
330 aa  59.3  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.157228  normal  0.60913 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6430  photosynthetic reaction center subunit M  26.45 
 
 
308 aa  55.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.864095  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1604  photosynthetic reaction center subunit M  26.27 
 
 
323 aa  54.3  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.16429  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3754  bifunctional photosynthetic reaction center subunit L/M  27.4 
 
 
641 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0347506  hitchhiker  0.005487 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0256  photosynthetic reaction center subunit M  29.5 
 
 
308 aa  53.5  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.186945  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1899  photosynthetic reaction center subunit M  29.5 
 
 
308 aa  53.5  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489132  normal  0.475655 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2029  photosynthetic reaction center subunit M  29.5 
 
 
308 aa  53.1  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.995154  normal  0.889355 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3268  bifunctional photosynthetic reaction center subunit L/M  26.77 
 
 
643 aa  53.5  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0578169 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3704  photosynthetic reaction center subunit M  28.36 
 
 
326 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0965867  hitchhiker  0.00123144 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1300  photosynthetic reaction center subunit M  22.8 
 
 
306 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3749  photosynthetic reaction center subunit M  26.92 
 
 
307 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.201417  hitchhiker  0.0015702 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2059  photosynthetic reaction center subunit M  24.65 
 
 
321 aa  50.4  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0281162 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1640  photosynthetic reaction center subunit M  23.74 
 
 
304 aa  50.4  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.761486  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2974  photosynthetic reaction center subunit M  22.22 
 
 
306 aa  50.1  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0940818  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1717  photosynthetic reaction center subunit M  26.5 
 
 
307 aa  49.3  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3994  photosynthetic reaction center subunit M  25.38 
 
 
307 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0754193 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2737  photosynthetic reaction center subunit M  24.14 
 
 
325 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2859  photosynthetic reaction center subunit M  24.14 
 
 
325 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2964  photosynthetic reaction center subunit M  24.14 
 
 
325 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.459774 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>