293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2140 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2140  ribosomal protein L35  100 
 
 		 71 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205764  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2041  50S ribosomal protein L35  76.56 
 
 		 64 aa  98.6  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0828155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3327  50S ribosomal protein L35  74.19 
 
 		 64 aa  92  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797164  normal  0.341501 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1317  ribosomal protein L35  75 
 
 		 64 aa  91.3  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.660104  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1104  ribosomal protein L35  70.31 
 
 		 64 aa  89.7  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.124943  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22420  LSU ribosomal protein L35P  70.31 
 
 		 64 aa  89.4  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1625  ribosomal protein L35  72.58 
 
 		 64 aa  89  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.516266 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1268  50S ribosomal protein L35  69.35 
 
 		 64 aa  88.2  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.35125 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11659  50S ribosomal protein L35  69.35 
 
 		 64 aa  87  9e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2065  50S ribosomal protein L35P  66.13 
 
 		 63 aa  86.3  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.100679  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3070  ribosomal protein L35  65.62 
 
 		 64 aa  85.9  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1478  50S ribosomal protein L35  67.74 
 
 		 64 aa  84.3  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0232172  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1481  50S ribosomal protein L35  67.74 
 
 		 64 aa  84.3  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000160361 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3168  ribosomal protein L35  70.97 
 
 		 64 aa  84  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.422818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2980  50S ribosomal protein L35  64.52 
 
 		 64 aa  84  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.415069  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2995  50S ribosomal protein L35  64.52 
 
 		 64 aa  84  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138749  normal  0.047682 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3024  50S ribosomal protein L35  64.52 
 
 		 64 aa  84  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.584231 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3541  50S ribosomal protein L35  66.13 
 
 		 64 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.47075  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2847  ribosomal protein L35  64.52 
 
 		 64 aa  82.4  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161293  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1729  50S ribosomal protein L35  62.9 
 
 		 64 aa  80.1  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00486125  hitchhiker  0.0014444 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14580  50S ribosomal protein L35  61.29 
 
 		 64 aa  79  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3181  50S ribosomal protein L35  62.9 
 
 		 64 aa  78.2  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340502  normal  0.163577 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2417  ribosomal protein L35  62.5 
 
 		 64 aa  77.4  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3053  50S ribosomal protein L35  62.9 
 
 		 64 aa  77.4  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6086  50S ribosomal protein L35P  68.52 
 
 		 64 aa  74.3  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21900  LSU ribosomal protein L35P  62.9 
 
 		 64 aa  73.2  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404594  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3038  ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 64 aa  68.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.153889  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5482  ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 64 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.424037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2460  50S ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 64 aa  69.3  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12260  LSU ribosomal protein L35P  58.06 
 
 		 64 aa  67.8  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.162562  normal  0.135462 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5472  50S ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 64 aa  67.4  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25680  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 64 aa  67.4  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1876  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 64 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.322523 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0561  hypothetical protein  53.97 
 
 		 64 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0100298 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  53.23 
 
 		 65 aa  65.5  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1883  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 64 aa  62.8  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0659918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17871  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.262265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0725  ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00316856  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1477  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.570064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4143  ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 64 aa  61.6  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000359181  hitchhiker  0.000240129 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3620  ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 66 aa  62  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18214  normal  0.947144 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1908  ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 66 aa  61.6  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3755  ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241542 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1644a  50S ribosomal protein L35  50.79 
 
 		 64 aa  60.8  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00277503  normal  0.0564408 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2053  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471288  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1302  50S ribosomal protein L35P  53.23 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.357951  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02483  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  60.1  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00760288  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4310  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0058  50S ribosomal protein L35  55.17 
 
 		 65 aa  60.1  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1278  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 66 aa  60.1  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.503383 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3499  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 67 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.145508  normal  0.184731 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3521  50S ribosomal protein L35P  45.16 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0090517  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2607  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 67 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3447  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0055  50S ribosomal protein L35  53.45 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.487079  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4254  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 67 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00601  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1476  50S ribosomal protein L35  50.79 
 
 		 64 aa  58.2  0.00000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000416006  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 68 aa  58.2  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1413  50S ribosomal protein L35  50.79 
 
 		 64 aa  58.2  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000182997  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1205  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000004157  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2384  ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 64 aa  57.8  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176561  normal  0.265482 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21301  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0330895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1259  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1713  50S ribosomal protein L35  47.62 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.971881  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0174  50S ribosomal protein L35  49.21 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.116747  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1223  ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00194553  hitchhiker  0.00674467 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0154  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  57  0.00000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.893795  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0990  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2119  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 66 aa  56.6  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0517001  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2217  ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  57  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0577163 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0026  50S ribosomal protein L35  50.79 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1091  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  56.6  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000360763  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2034  hypothetical protein  46.15 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0535  ribosomal protein L35  50.79 
 
 		 66 aa  55.5  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000240133  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0801  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 66 aa  56.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05730  LSU ribosomal protein L35P  46.77 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000571086  normal  0.0115615 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0165  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.442287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  48.39 
 
 		 79 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2155  50S ribosomal protein L35  46.03 
 
 		 66 aa  55.5  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000190573  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0914  ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1753  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1234  ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000264492  normal  0.0861149 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18511  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.752965  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1822  LSU ribosomal protein L35P  52.38 
 
 		 64 aa  55.1  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000209842  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4705  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804213  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4470  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000641004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4305  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4316  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000453199  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4818  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129882  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0555  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000323504  hitchhiker  9.12848e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4689  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.93198e-62 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  46.77 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4405  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000318772  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2503  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 64 aa  55.1  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>