More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0899 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_0899  OmpA/MotB  100 
 
 
205 aa  419  1e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000025431  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2713  OmpA/MotB  36.14 
 
 
175 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.202213  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3395  peptidoglycan-associated lipoprotein  35.86 
 
 
180 aa  116  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.184385  hitchhiker  0.00984431 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2359  peptidoglycan-associated lipoprotein  44.19 
 
 
170 aa  115  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12328 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1584  peptidoglycan-associated lipoprotein  50 
 
 
199 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.904402  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2195  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.23 
 
 
192 aa  115  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.203407  normal  0.247452 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1347  putative peptidoglycan-associated lipoprotein precursor  44.62 
 
 
179 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2456  peptidoglycan-associated lipoprotein  33.66 
 
 
169 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.37691  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2693  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.17 
 
 
172 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.671246  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2093  OmpA/MotB  43.48 
 
 
177 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.366821  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0768  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.33 
 
 
170 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0396571  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3888  OmpA/MotB family outer membrane protein  34.33 
 
 
170 aa  112  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0316  OmpA/MotB  34.33 
 
 
170 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00135962  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2228  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein-like protein  36.68 
 
 
181 aa  112  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0799  OmpA-like protein  34.33 
 
 
170 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00766515  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0693  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.33 
 
 
169 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.017916  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0676  OmpA/MotB domain-containing protein  33.83 
 
 
169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306493  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0202  OmpA/MotB domain-containing protein  46.49 
 
 
194 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000181939  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4417  OmpA/MotB domain-containing protein  33.17 
 
 
163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157406  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3949  OmpA/MotB  33.17 
 
 
163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.595149  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5888  peptidoglycan-associated lipoprotein  33.17 
 
 
163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.471283  normal  0.347557 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1372  OmpA family outer membrane protein  34.48 
 
 
170 aa  109  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0567  peptidoglycan-associated lipoprotein  50 
 
 
188 aa  108  5e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22731  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0302  peptidoglycan-associated lipoprotein  42.96 
 
 
166 aa  108  5e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.519391  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0277  OmpA/MotB domain-containing protein  42.28 
 
 
167 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000132403  hitchhiker  0.000103139 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3921  OmpA/MotB family outer membrane protein  33.66 
 
 
169 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.315585  hitchhiker  0.00726573 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0758  peptidoglycan-associated lipoprotein  33.66 
 
 
169 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.620729  normal  0.624777 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2593  peptidoglycan-associated lipoprotein  49.51 
 
 
176 aa  107  9.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000155055  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1398  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  38.26 
 
 
168 aa  107  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000375397  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4052  OmpA/MotB  51.49 
 
 
180 aa  107  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2588  peptidoglycan-associated lipoprotein  33.5 
 
 
176 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0024  OmpA domain-containing protein  49.02 
 
 
194 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000404844  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2082  OmpA family outer membrane protein  34 
 
 
170 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0826  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  34 
 
 
170 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3257  OmpA family outer membrane protein  34 
 
 
170 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1950  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  34 
 
 
170 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.931309  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3204  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  34 
 
 
170 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2660  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  34 
 
 
170 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.305676  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3242  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  34 
 
 
170 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.676059  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3633  peptidoglycan-associated lipoprotein, putative  47.57 
 
 
177 aa  106  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000113835  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2955  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  38.26 
 
 
168 aa  105  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000883314  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2867  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  38.26 
 
 
168 aa  105  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.859200000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4309  peptidoglycan-associated lipoprotein  45.54 
 
 
163 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0691285  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1698  OmpA/MotB domain-containing protein  40.29 
 
 
189 aa  106  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000544254  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0241  OmpA/MotB domain-containing protein  33.99 
 
 
184 aa  106  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3849  OmpA/MotB domain-containing protein  45.54 
 
 
163 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1157  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  48.48 
 
 
168 aa  105  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2901  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  48.48 
 
 
168 aa  105  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000125837  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1153  OmpA/MotB  47.06 
 
 
181 aa  105  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3541  OmpA/MotB  36.91 
 
 
193 aa  104  9e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.09094e-16  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2305  peptidoglycan-associated lipoprotein  41.96 
 
 
187 aa  103  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1943  peptidoglycan-associated lipoprotein  48.54 
 
 
196 aa  104  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.53224 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1724  TonB box domain-containing protein  33.5 
 
 
180 aa  103  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.036293 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2925  OmpA/MotB  43.59 
 
 
175 aa  103  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.407293  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0589  peptidoglycan-associated lipoprotein  46.6 
 
 
179 aa  103  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000303526  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3405  OmpA domain-containing protein  39.71 
 
 
181 aa  104  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.725588 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1980  peptidoglycan-associated lipoprotein  33.5 
 
 
180 aa  103  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0327  OmpA/MotB  50 
 
 
170 aa  103  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.927231  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4203  peptidoglycan-associated lipoprotein  45.54 
 
 
163 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.381253  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1545  OmpA/MotB family outer membrane protein  32.18 
 
 
163 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.342429  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0274  OmpA/MotB domain-containing protein  45.71 
 
 
167 aa  102  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00497769  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3086  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  47.47 
 
 
169 aa  102  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000103923  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2974  peptidoglycan-associated lipoprotein  41.78 
 
 
190 aa  102  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.113547  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1813  peptidoglycan-associated lipoprotein  46.08 
 
 
185 aa  102  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.987869  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1250  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  47.47 
 
 
169 aa  102  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000441417  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0146  OmpA/MotB  34.47 
 
 
187 aa  102  6e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00701  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  45.45 
 
 
173 aa  101  7e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000036029  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2894  peptidoglycan-associated lipoprotein  45.45 
 
 
173 aa  101  7e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.67676e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0795  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  45.45 
 
 
173 aa  101  7e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.12965e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0812  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  46.46 
 
 
174 aa  101  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.059882  normal  0.756228 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0764  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  45.45 
 
 
173 aa  101  7e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000105937  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0876  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  46.46 
 
 
174 aa  101  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.0023901  normal  0.278188 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0785  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  46.46 
 
 
174 aa  101  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000639422  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0770  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  45.45 
 
 
173 aa  101  7e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000156204  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2914  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  45.45 
 
 
173 aa  101  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000121586  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0845  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  46.46 
 
 
174 aa  101  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00372041  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00690  hypothetical protein  45.45 
 
 
173 aa  101  7e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000599147  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0908  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  46.46 
 
 
174 aa  101  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00670429  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0663  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  45.45 
 
 
173 aa  101  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000160388  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0100  peptidoglycan-associated lipoprotein precursor  47.47 
 
 
211 aa  101  7e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.949654  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0844  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  45.45 
 
 
173 aa  101  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000018572  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1230  OmpA family protein  44.35 
 
 
215 aa  101  8e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.337438  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0796  OmpA/MotB  47.52 
 
 
170 aa  101  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53166  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1985  OmpA/MotB  33.17 
 
 
180 aa  101  8e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.188603  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1509  OmpA/MotB  41.67 
 
 
172 aa  101  8e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.152591  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0908  OmpA/MotB family outer membrane protein  42.59 
 
 
172 aa  101  9e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.975322  normal  0.906995 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1012  OmpA domain-containing protein  33.67 
 
 
182 aa  101  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3831  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.14 
 
 
182 aa  100  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.38752 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2674  OmpA/MotB  37.93 
 
 
169 aa  100  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0267041  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0728  OmpA domain-containing protein  42.86 
 
 
195 aa  99.8  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0826309  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1395  OmpA/MotB  31.34 
 
 
178 aa  100  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000229219  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1280  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  45.45 
 
 
171 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000137851  hitchhiker  0.0000238774 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003912  OmpA precursor  45.45 
 
 
174 aa  99.8  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0204489  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0857  peptidoglycan-associated lipoprotein  40.54 
 
 
155 aa  100  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000523751  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1428  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.5 
 
 
172 aa  100  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01611  hypothetical protein  45.45 
 
 
173 aa  99.4  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1239  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  44.44 
 
 
173 aa  99.4  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000216334  normal  0.113587 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1486  OmpA/MotB  49.02 
 
 
187 aa  99.4  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00178508  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3322  OmpA/MotB domain-containing protein  41.23 
 
 
180 aa  99.8  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000618006  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51710  peptidoglycan associated lipoprotein OprL precursor  45.63 
 
 
168 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000147686  hitchhiker  0.00068918 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>