More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3579 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3579  thioredoxin  100 
 
 		 107 aa  220  4.9999999999999996e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.248424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9377  thioredoxin  82.24 
 
 		 107 aa  187  5.999999999999999e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  66.99 
 
 		 107 aa  159  9e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9043  thioredoxin  67.96 
 
 		 108 aa  154  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.566731 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  66.36 
 
 		 108 aa  151  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  64.42 
 
 		 108 aa  150  4e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4688  thioredoxin  63.55 
 
 		 108 aa  149  8e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376387  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  61.68 
 
 		 107 aa  149  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  60.38 
 
 		 108 aa  144  6e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  57.94 
 
 		 107 aa  143  7.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4084  thioredoxin  67.96 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  61.76 
 
 		 108 aa  141  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4537  thioredoxin  61.17 
 
 		 108 aa  140  5e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  59.81 
 
 		 107 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4213  thioredoxin  57.01 
 
 		 109 aa  139  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2548  thioredoxin  54.21 
 
 		 109 aa  135  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.543523  normal  0.158534 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4854  thioredoxin  54.63 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3369  thioredoxin  60.4 
 
 		 106 aa  134  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  58.25 
 
 		 109 aa  135  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  57.84 
 
 		 108 aa  134  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  53.77 
 
 		 108 aa  134  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  59.41 
 
 		 106 aa  133  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  55.66 
 
 		 116 aa  133  8e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  56.73 
 
 		 104 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  54.9 
 
 		 108 aa  131  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  54.9 
 
 		 108 aa  131  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  54.9 
 
 		 108 aa  131  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26950  thioredoxin  56.73 
 
 		 108 aa  131  3.9999999999999996e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.766392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  54.9 
 
 		 108 aa  130  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  54.9 
 
 		 108 aa  130  5e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  54.9 
 
 		 108 aa  130  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  54.9 
 
 		 108 aa  130  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  54.9 
 
 		 108 aa  130  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  54.9 
 
 		 108 aa  130  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  58.95 
 
 		 107 aa  130  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  55.45 
 
 		 146 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  54.9 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  53.85 
 
 		 107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  53.92 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  51.89 
 
 		 106 aa  129  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  53.92 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  53.92 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  53.92 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  53.92 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  53.92 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  53.92 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  60.78 
 
 		 109 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  54.46 
 
 		 146 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  54.9 
 
 		 108 aa  128  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  53.47 
 
 		 109 aa  127  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  57.73 
 
 		 108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  54.46 
 
 		 110 aa  127  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5243  thioredoxin  56.73 
 
 		 109 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  57.45 
 
 		 106 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  58.16 
 
 		 106 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37950  thioredoxin  52.94 
 
 		 113 aa  127  5.0000000000000004e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  53.33 
 
 		 107 aa  127  6e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  58.76 
 
 		 108 aa  127  6e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  54.46 
 
 		 108 aa  127  7.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  51.92 
 
 		 107 aa  126  9.000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2296  thioredoxin  53.92 
 
 		 103 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  56.38 
 
 		 107 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  51.89 
 
 		 109 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  51.89 
 
 		 109 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  51.89 
 
 		 109 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  51.92 
 
 		 107 aa  124  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  53.06 
 
 		 106 aa  124  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  51.92 
 
 		 107 aa  124  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  55.45 
 
 		 107 aa  124  3e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  56.44 
 
 		 108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  55.32 
 
 		 107 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  53.47 
 
 		 108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  50 
 
 		 107 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4233  thioredoxin  54.17 
 
 		 111 aa  124  4.0000000000000003e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  53.47 
 
 		 106 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  51.92 
 
 		 107 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  53.47 
 
 		 108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  59.6 
 
 		 108 aa  124  5e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655412  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5038  thioredoxin  55.88 
 
 		 109 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1283  thioredoxin 1  51.96 
 
 		 109 aa  124  6e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149215  normal  0.0874847 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  51.49 
 
 		 125 aa  124  6e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2950  thioredoxin  60.22 
 
 		 106 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184197  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2583  thioredoxin  60.22 
 
 		 110 aa  123  8.000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  51.43 
 
 		 106 aa  123  9e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  53.47 
 
 		 110 aa  123  9e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5215  thioredoxin  54.9 
 
 		 109 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  54.46 
 
 		 115 aa  122  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0179  thioredoxin  60.22 
 
 		 106 aa  123  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.292519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1529  thioredoxin  60.22 
 
 		 106 aa  123  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.643867  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  50 
 
 		 107 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  53.54 
 
 		 124 aa  122  1e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1545  thioredoxin  52 
 
 		 110 aa  122  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24811  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  55.1 
 
 		 123 aa  122  1e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0156  thioredoxin  52.43 
 
 		 106 aa  122  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5124  thioredoxin  54.9 
 
 		 109 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0368  thioredoxin  58.16 
 
 		 108 aa  123  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27502 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  49.04 
 
 		 107 aa  122  1e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  48.08 
 
 		 107 aa  122  2e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  50 
 
 		 109 aa  122  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5457  thioredoxin  54.81 
 
 		 109 aa  122  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0195643 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>