57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2310 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2310  hypothetical protein  100 
 
 
262 aa  521  1e-147  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.435195 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2983  hypothetical protein  67.8 
 
 
258 aa  345  4e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0766  hypothetical protein  67.94 
 
 
267 aa  340  2e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2221  hypothetical protein  41.7 
 
 
256 aa  187  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.986001  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22150  hypothetical protein  37.88 
 
 
263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0416254  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0454  hypothetical protein  37.69 
 
 
258 aa  158  1e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0667  hypothetical protein  39.44 
 
 
276 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3159  hypothetical protein  34.07 
 
 
264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0654278 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0975  hypothetical protein  33.47 
 
 
257 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.123603  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0865  hypothetical protein  33.61 
 
 
257 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2330  hypothetical protein  34.21 
 
 
270 aa  131  9e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.965194  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5190  hypothetical protein  32.35 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.391316  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2054  hypothetical protein  33.46 
 
 
267 aa  126  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000089392 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0968  hypothetical protein  31.52 
 
 
263 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2236  hypothetical protein  32.6 
 
 
276 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4900  hypothetical protein  33.83 
 
 
267 aa  123  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3063  hypothetical protein  35.21 
 
 
264 aa  123  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.129455 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4110  hypothetical protein  33.2 
 
 
268 aa  123  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.240561  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0712  hypothetical protein  30.68 
 
 
265 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.0660006 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1506  hypothetical protein  34.72 
 
 
263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.168782 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3464  hypothetical protein  35.25 
 
 
265 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.611516  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3150  hypothetical protein  35.97 
 
 
268 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3200  hypothetical protein  35.57 
 
 
268 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  0.212983 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3138  hypothetical protein  35.57 
 
 
268 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2151  hypothetical protein  33.22 
 
 
276 aa  113  4.0000000000000004e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2000  hypothetical protein  31.07 
 
 
280 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.388809 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2327  hypothetical protein  31.66 
 
 
267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.398792  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15480  hypothetical protein  30.97 
 
 
276 aa  110  3e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00643859  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2017  hypothetical protein  29.26 
 
 
270 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10540  hypothetical protein  28.83 
 
 
288 aa  104  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.11001  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2063  hypothetical protein  29.26 
 
 
270 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2000  hypothetical protein  30.47 
 
 
271 aa  103  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.422215  normal  0.170887 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1720  hypothetical protein  29.02 
 
 
271 aa  103  4e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1998  hypothetical protein  29.92 
 
 
262 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0579  hypothetical protein  29.72 
 
 
270 aa  102  7e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0365953  normal  0.114507 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7017  hypothetical protein  32.44 
 
 
291 aa  102  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320155 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1417  hypothetical protein  31.66 
 
 
254 aa  101  9e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2774  hypothetical protein  35.74 
 
 
269 aa  100  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4344  hypothetical protein  28.93 
 
 
269 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2268  hypothetical protein  30.65 
 
 
256 aa  95.5  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.824369  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2455  hypothetical protein  33.71 
 
 
287 aa  93.6  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1778  hypothetical protein  30.3 
 
 
256 aa  88.2  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00279828  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0062  hypothetical protein  30.86 
 
 
276 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.847776  normal  0.0297452 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0043  hypothetical protein  30.86 
 
 
276 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.257103  normal  0.0357536 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0053  hypothetical protein  30.86 
 
 
276 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0984909  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0060  hypothetical protein  29.55 
 
 
268 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.215016 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0790  hypothetical protein  29.06 
 
 
268 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3143  hypothetical protein  27.24 
 
 
277 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.205531  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2565  hypothetical protein  27.91 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2528  hypothetical protein  26.74 
 
 
270 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2573  hypothetical protein  26.74 
 
 
270 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4087  hypothetical protein  25 
 
 
272 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3942  hypothetical protein  25.58 
 
 
260 aa  53.5  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4413  hypothetical protein  24.62 
 
 
285 aa  51.2  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0436871  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3647  hypothetical protein  23.98 
 
 
265 aa  43.9  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.51576  hitchhiker  0.00000000000126361 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4522  hypothetical protein  25.59 
 
 
284 aa  43.1  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3381  hypothetical protein  26 
 
 
277 aa  42.4  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.981004  normal  0.259462 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>