238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1716 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1716  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  411  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4048  hypothetical protein  64.56 
 
 		 209 aa  261  6e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  decreased coverage  0.000882934 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3242  protein of unknown function UPF0029  50.24 
 
 		 213 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5318  conserved hypothetical protein TIGR00257  44.93 
 
 		 211 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2757  hypothetical protein  55.5 
 
 		 213 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4876  hypothetical protein  44.93 
 
 		 211 aa  196  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4891  hypothetical protein  44.93 
 
 		 211 aa  196  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5287  conserved hypothetical protein TIGR00257  44.93 
 
 		 211 aa  196  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000948336 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5641  hypothetical protein TIGR00257  44.93 
 
 		 211 aa  194  7e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.989891  hitchhiker  0.000000000000266179 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5305  hypothetical protein  44.44 
 
 		 211 aa  194  9e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4991  hypothetical protein  45.41 
 
 		 211 aa  193  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  44.93 
 
 		 212 aa  193  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5363  conserved hypothetical protein TIGR00257  44.44 
 
 		 211 aa  192  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5046  hypothetical protein  44.44 
 
 		 211 aa  192  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5431  hypothetical protein  44.44 
 
 		 211 aa  192  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3045  protein of unknown function UPF0029  45.89 
 
 		 211 aa  192  4e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019281  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5502  protein of unknown function UPF0029  55.5 
 
 		 209 aa  187  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0084  protein of unknown function UPF0029  50 
 
 		 212 aa  179  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  43.54 
 
 		 213 aa  171  1e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06100  conserved hypothetical protein TIGR00257  48.29 
 
 		 210 aa  169  2e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17110  hypothetical protein  45.07 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.46381 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  37.68 
 
 		 207 aa  155  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  37.95 
 
 		 211 aa  142  5e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3185  hypothetical protein  52.76 
 
 		 199 aa  139  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0320756  hitchhiker  0.00000000052125 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  38.68 
 
 		 214 aa  136  2e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0361  hypothetical protein  37.81 
 
 		 210 aa  135  5e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0789  hypothetical protein  42.21 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0502356  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0772  hypothetical protein  42.21 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.540579  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18640  hypothetical protein  47.94 
 
 		 231 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.685754  normal  0.475195 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  36.71 
 
 		 208 aa  132  3e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0246  hypothetical protein  38.02 
 
 		 211 aa  132  5e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11160  conserved hypothetical protein TIGR00257  46.89 
 
 		 233 aa  130  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.9655  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1444  hypothetical protein  40.29 
 
 		 216 aa  128  7.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  43.21 
 
 		 204 aa  124  8.000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2078  hypothetical protein  35.92 
 
 		 219 aa  124  8.000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1335  hypothetical protein  33.85 
 
 		 221 aa  124  1e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000275512  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0054  protein of unknown function UPF0029  52.94 
 
 		 206 aa  122  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00609862 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2068  hypothetical protein  46.08 
 
 		 232 aa  121  8e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0096752  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0899  protein of unknown function UPF0029  41.18 
 
 		 211 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000186376  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0944  hypothetical protein  42.08 
 
 		 242 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.404461 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1793  protein of unknown function UPF0029  52.35 
 
 		 215 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.128113  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0111  protein of unknown function UPF0029  35.51 
 
 		 216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4229  hypothetical protein  40.56 
 
 		 204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000219511  normal  0.021598 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1310  hypothetical protein  40.82 
 
 		 205 aa  119  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00619746  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1280  protein of unknown function UPF0029  43.64 
 
 		 214 aa  119  3.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.313223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  36.61 
 
 		 205 aa  119  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1379  hypothetical protein  40 
 
 		 199 aa  118  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.262935  normal  0.051322 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  35.45 
 
 		 198 aa  117  7.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000164661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3745  hypothetical protein  42.59 
 
 		 204 aa  117  7.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00302159  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0876  protein of unknown function UPF0029  40.78 
 
 		 203 aa  117  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.196068 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2434  hypothetical protein  37.23 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  36.46 
 
 		 198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2975  hypothetical protein  40.22 
 
 		 204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1725  protein of unknown function UPF0029  37.5 
 
 		 204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1558  protein of unknown function UPF0029  39.06 
 
 		 203 aa  115  5e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.17892  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0499  hypothetical protein  37.07 
 
 		 218 aa  114  7.999999999999999e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000766856  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0180  protein of unknown function UPF0029  36.41 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.190284  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0960  hypothetical protein  44.44 
 
 		 219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.239073  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2192  hypothetical protein  36.17 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1183  hypothetical protein  39.26 
 
 		 200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1806  protein of unknown function UPF0029  47.9 
 
 		 233 aa  113  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000629698 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001987  hypothetical protein  47.41 
 
 		 207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3126  hypothetical protein  34.87 
 
 		 209 aa  112  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1076  protein of unknown function UPF0029  31.87 
 
 		 192 aa  111  6e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0813  protein of unknown function UPF0029  29 
 
 		 206 aa  111  8.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0467204  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24840  hypothetical protein  44.22 
 
 		 225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.070142  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  35.98 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3899  hypothetical protein  40.12 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00283954  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  33.86 
 
 		 198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12020  conserved hypothetical protein TIGR00257  34.03 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00461  hypothetical protein  45.93 
 
 		 207 aa  109  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3042  hypothetical protein  35.29 
 
 		 200 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2481  hypothetical protein  36.68 
 
 		 219 aa  109  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1241  hypothetical protein  32.42 
 
 		 197 aa  108  5e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3475  protein of unknown function UPF0029  40.96 
 
 		 194 aa  108  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3148  protein of unknown function UPF0029  40.96 
 
 		 194 aa  108  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2225  protein of unknown function UPF0029  40.88 
 
 		 195 aa  108  6e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3947  hypothetical protein  42.49 
 
 		 204 aa  107  8.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.037804  decreased coverage  0.00180988 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3277  hypothetical protein  41.57 
 
 		 195 aa  107  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.78794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3817  hypothetical protein  39.41 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  0.106539 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0518  protein of unknown function UPF0029  40.24 
 
 		 197 aa  106  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4042  hypothetical protein  40.12 
 
 		 203 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0955788  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0268  protein of unknown function UPF0029  37.11 
 
 		 225 aa  106  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4011  hypothetical protein  35.64 
 
 		 218 aa  106  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798676 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0004  protein of unknown function UPF0029  35.44 
 
 		 210 aa  107  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.528127 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3177  protein of unknown function UPF0029  44.85 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1914  hypothetical protein  39.51 
 
 		 203 aa  106  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00064118  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3931  hypothetical protein  39.51 
 
 		 203 aa  106  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457043  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0285  hypothetical protein  39.51 
 
 		 203 aa  106  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000001725  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02100  hypothetical protein  41.04 
 
 		 196 aa  105  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.482389 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0314  hypothetical protein  31.77 
 
 		 205 aa  105  5e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.55405 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0674  hypothetical protein  46.46 
 
 		 197 aa  105  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5286  protein of unknown function UPF0029  39.38 
 
 		 196 aa  105  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0196  elongation factor  35.16 
 
 		 207 aa  105  6e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4570  hypothetical protein  37.06 
 
 		 194 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000582787  normal  0.0106541 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  37.88 
 
 		 213 aa  104  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2244  hypothetical protein  37.95 
 
 		 222 aa  104  8e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1923  hypothetical protein  34.3 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1318  hypothetical protein  29.1 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0492765  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0638  hypothetical protein  42.86 
 
 		 194 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134379 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>