More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0227 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0227  CheW protein  100 
 
 		 148 aa  287  3e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0229  putative CheW protein  99.32 
 
 		 151 aa  286  9e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0932  putative CheW protein  54.29 
 
 		 151 aa  144  3e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.432309  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0691  putative CheW protein  47.26 
 
 		 148 aa  135  1e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1391  CheW protein  44.03 
 
 		 141 aa  113  8.999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0209  CheW protein  38.97 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  35.17 
 
 		 146 aa  87.8  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0211  putative CheW protein  36.76 
 
 		 150 aa  85.1  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  36.76 
 
 		 478 aa  84  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1369  putative CheW protein  33.8 
 
 		 302 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000715462  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1573  response regulator receiver modulated CheW protein  33.81 
 
 		 302 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204601  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1777  chemotaxis protein CheV  33.8 
 
 		 302 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.782238  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1544  chemotaxis protein  33.8 
 
 		 302 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0242489  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1533  chemotaxis protein  33.8 
 
 		 302 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1754  chemotaxis protein CheV  33.8 
 
 		 302 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1832  chemotaxis protein CheV  33.8 
 
 		 302 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3623  chemotaxis protein CheV  33.8 
 
 		 302 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1723  chemotaxis protein CheV  33.8 
 
 		 302 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2817  CheW protein  34.85 
 
 		 141 aa  80.5  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  32.12 
 
 		 139 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  32.43 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2285  CheW protein  34.51 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.126917  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  35.04 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2416  chemotaxis protein CheW  33.1 
 
 		 166 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261623  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0275  putative CheW protein  36.96 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.18524  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4076  chemotaxis protein  32.21 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  32.85 
 
 		 136 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.39 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  34.59 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1572  response regulator receiver modulated CheW protein  32.85 
 
 		 301 aa  75.5  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0280  CheW protein  30.88 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.128089  normal  0.922662 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1600  CheW protein  29.53 
 
 		 171 aa  74.3  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1571  CheW-like domain-containing protein  31.39 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.603726  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1575  CheW protein  28.87 
 
 		 239 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0210476  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  33.33 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0247  CheW protein  34.07 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.136861  normal  0.143746 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  30.66 
 
 		 168 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0822  putative CheW protein  32.87 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  45.26 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2550  CheW protein  31.01 
 
 		 169 aa  71.6  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.234406 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2840  CheW protein  28.97 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.437722  normal  0.122347 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0936  response regulator receiver modulated CheW protein  31.94 
 
 		 301 aa  72  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0911  chemotaxis protein CheW  31.72 
 
 		 179 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4092  chemotaxis protein  30.88 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.410589  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0784  CheW-like protein  30.82 
 
 		 179 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.883745 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0546  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like  33.33 
 
 		 171 aa  70.1  0.000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.32366e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  31.34 
 
 		 165 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  33.78 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  29.05 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3631  CheW protein  29.2 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2121  CheW protein  32.61 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  29.05 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3624  CheW protein  32.86 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0874566 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2609  chemotaxis protein  29.85 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112886  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2892  putative CheW protein  29.2 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.953703 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0776  CheW protein  30.07 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.01614 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  37.62 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1445  CheW protein  30.5 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  30.15 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3920  CheW protein  29.2 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0236  putative CheW protein  25 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0637  CheW protein  31.16 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.424922  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  31.34 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  31.34 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  28.89 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  29.86 
 
 		 163 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0927  CheW protein  28.37 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.176763  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2099  CheW protein  28.36 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.09 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  36.63 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1014  putative purine-binding chemotaxis protein CheW  29.58 
 
 		 520 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1579  putative CheW protein  28.19 
 
 		 170 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.450037  normal  0.31697 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3317  CheW protein  29.61 
 
 		 166 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  30 
 
 		 163 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0090  CheW protein  31.11 
 
 		 176 aa  67.8  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  30.71 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0434  CheW protein  32.41 
 
 		 166 aa  67.4  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  36.63 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  30.6 
 
 		 164 aa  67.4  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0971  CheW protein  32.37 
 
 		 169 aa  67.4  0.00000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0875  CheW protein  34.95 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  28.47 
 
 		 163 aa  67  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  29.29 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0299  CheW protein  28.68 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00727578  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  30.22 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  29.8 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2709  putative CheW protein  29.2 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  30 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  29.29 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0690  purine-binding chemotaxis protein  28.38 
 
 		 466 aa  65.5  0.0000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00466397  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0732  putative CheW protein  31.39 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189251  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  32.14 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  30.07 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  34.81 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  31.43 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  30.41 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  30 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1997  putative CheW protein  30.2 
 
 		 320 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.151796  normal  0.289179 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2175  CheW protein  36.63 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0334  CheW protein  31.47 
 
 		 169 aa  65.1  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>