168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0024 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0024  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  100 
 
 
157 aa  310  4e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.375225  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0024  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  100 
 
 
157 aa  310  4e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  1.54554e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0382  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  73.25 
 
 
159 aa  226  7e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1432  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  62.03 
 
 
160 aa  200  7e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2385  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  45.64 
 
 
166 aa  140  6e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1741  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  48.03 
 
 
171 aa  139  1e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2022  CheD, stimulates methylation of MCP protein  49.66 
 
 
166 aa  139  2e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1308  CheD  44.08 
 
 
163 aa  138  4e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.950792  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0712  CheD  43.33 
 
 
157 aa  136  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4129  CheD  44.44 
 
 
160 aa  135  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  6.70022e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0800  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  44.67 
 
 
167 aa  135  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0621769  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0877  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  43.75 
 
 
161 aa  134  5e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.312761  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1665  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  44.37 
 
 
162 aa  134  6e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00633684  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0111  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  47.65 
 
 
166 aa  132  2e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290541  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2146  CheD  44.08 
 
 
160 aa  129  2e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00139115  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1854  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  47.02 
 
 
164 aa  127  5e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0493  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  43.14 
 
 
161 aa  126  1e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1137  CheD  46.41 
 
 
166 aa  125  2e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0176263  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2687  hypothetical protein  45.64 
 
 
161 aa  124  4e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3146  CheD  41.14 
 
 
173 aa  124  6e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2024  CheD  41.51 
 
 
162 aa  124  7e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3209  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  43.98 
 
 
162 aa  123  8e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  2.00637e-12 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0955  CheD, stimulates methylation of MCP protein  43.45 
 
 
173 aa  123  9e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0941  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  43.92 
 
 
163 aa  122  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.326065  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2029  CheD, stimulates methylation of MCP protein  47.2 
 
 
165 aa  120  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0982  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  40.28 
 
 
151 aa  120  7e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3201  chemotaxis protein CheD, putative  44.97 
 
 
162 aa  120  9e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.945605  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1334  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  45.93 
 
 
137 aa  119  2e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.104931  normal  0.313636 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0221  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  45.14 
 
 
154 aa  119  2e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0450541  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0175  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  43.06 
 
 
154 aa  119  2e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.155132  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07640  chemotaxis protein CheD  38.26 
 
 
158 aa  118  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.35078e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1727  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  43.06 
 
 
154 aa  117  5e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0735  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  43.66 
 
 
154 aa  117  8e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.466982  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0235  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  40 
 
 
172 aa  115  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.367659  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1417  CheD  45 
 
 
145 aa  113  1e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0653716  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1421  CheD  40.4 
 
 
160 aa  111  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.216006  normal  0.348077 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0955  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  42.86 
 
 
171 aa  109  2e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.301241  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1616  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  41.67 
 
 
202 aa  107  4e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0524891 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0284  hypothetical protein  40.43 
 
 
188 aa  107  8e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1201  CheD-like chemotaxis protein  42.95 
 
 
162 aa  104  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5611  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  45.93 
 
 
217 aa  104  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.414458  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3692  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  42.76 
 
 
220 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000909958  normal  0.0208475 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3178  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  39.16 
 
 
234 aa  102  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0335  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  39.73 
 
 
184 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.254495 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0731  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  42.66 
 
 
201 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.154797  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0169  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  40.3 
 
 
273 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.413087 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1931  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  39.31 
 
 
203 aa  102  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0303  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  38.36 
 
 
184 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00198735  normal  0.717495 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1844  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.88 
 
 
198 aa  101  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.494723 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2173  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  39.87 
 
 
242 aa  100  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0902871  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00056  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.37 
 
 
194 aa  100  7e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00180609  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3430  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  38.46 
 
 
234 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2855  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  38.46 
 
 
234 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1688  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  38.46 
 
 
234 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.332002  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3851  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  38.46 
 
 
234 aa  100  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315458  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3120  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  38.46 
 
 
234 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.806479  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0072  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  38.46 
 
 
234 aa  100  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3932  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  38.46 
 
 
234 aa  100  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329787  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0061  CheD, stimulates methylation of MCP protein  40.52 
 
 
173 aa  100  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4071  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  39.33 
 
 
184 aa  100  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.130637  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1372  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  38.96 
 
 
159 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.239439  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1791  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.33 
 
 
199 aa  99  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2563  CheD  38 
 
 
175 aa  98.6  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.236478  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3810  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  39.16 
 
 
271 aa  98.6  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0123  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  39.16 
 
 
250 aa  98.6  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2439  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  38.81 
 
 
199 aa  98.2  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.310288  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2485  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  39.46 
 
 
159 aa  98.2  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.380035  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0658  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  37.84 
 
 
245 aa  98.2  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0343248 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0363  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  38.82 
 
 
220 aa  97.8  5e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.3362  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2970  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  38.89 
 
 
263 aa  97.4  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00077588 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2581  CheD  39.46 
 
 
159 aa  97.1  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1103  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  38.06 
 
 
199 aa  96.7  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.766752  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0638  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  39.01 
 
 
171 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0242  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  40.15 
 
 
247 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137526  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0254  hypothetical protein  38.03 
 
 
200 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2889  catalytic domain of components of various dehydrogenase complexes  35.81 
 
 
205 aa  95.1  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3061  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  38.3 
 
 
204 aa  95.5  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.583013  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2847  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  40.15 
 
 
247 aa  95.5  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169491  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4375  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  39.01 
 
 
253 aa  95.5  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.893396  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0260  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  40.15 
 
 
247 aa  95.5  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00168623  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2630  chemotaxis protein  40.29 
 
 
185 aa  94.7  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100021  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3362  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  38.36 
 
 
241 aa  94.4  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0117903  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0629  CheD  38.3 
 
 
171 aa  94.4  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3787  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  38.3 
 
 
245 aa  94.4  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.54993  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3303  hypothetical protein  36.36 
 
 
206 aa  93.2  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4153  CheD, stimulates methylation of MCP protein  41.67 
 
 
217 aa  93.2  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.340514  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2243  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  39.58 
 
 
206 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.030336  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0240  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  37.5 
 
 
183 aa  92.8  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.497247 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1986  CheD family protein  36.73 
 
 
156 aa  92.8  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0103025  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0604  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  38.3 
 
 
171 aa  92  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3103  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  36.91 
 
 
218 aa  91.7  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02190  hypothetical protein  38.03 
 
 
200 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.727435  normal  0.427786 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0662  CheD, stimulates methylation of MCP protein  33.77 
 
 
163 aa  91.7  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.436046  normal  0.296152 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0186  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  39.16 
 
 
253 aa  91.7  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0439  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  33.54 
 
 
210 aa  91.3  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00596403  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2102  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  38.89 
 
 
206 aa  90.5  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.28508  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2360  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  38.89 
 
 
206 aa  90.5  8e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.24573  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0173  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  38.46 
 
 
253 aa  90.5  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521655  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22580  chemotaxis protein CheD  33.76 
 
 
168 aa  90.1  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1885  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  38.19 
 
 
206 aa  90.1  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.182663 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>