More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0614 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0614  precorrin-4 C11-methyltransferase  100 
 
 		 249 aa  513  1e-144  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00328163  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1430  precorrin-4 C11-methyltransferase  65.46 
 
 		 251 aa  333  1e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0323621  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1236  precorrin-4 C11-methyltransferase  65.46 
 
 		 251 aa  333  1e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1013  precorrin-4 C11-methyltransferase  62.9 
 
 		 253 aa  311  4.999999999999999e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0313  precorrin-4 C11-methyltransferase  59.2 
 
 		 251 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1092  precorrin-4 C11-methyltransferase  58.23 
 
 		 254 aa  303  2.0000000000000002e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1272  precorrin-4 C11-methyltransferase  58.17 
 
 		 251 aa  303  2.0000000000000002e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1298  precorrin-4 C11-methyltransferase  59.27 
 
 		 261 aa  286  1e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1342  precorrin-4 C11-methyltransferase  57.37 
 
 		 254 aa  280  2e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0039  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.76 
 
 		 258 aa  280  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1376  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.8 
 
 		 252 aa  277  1e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2205  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.82 
 
 		 257 aa  274  8e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1716  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.19 
 
 		 253 aa  274  1.0000000000000001e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2364  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.42 
 
 		 257 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2994  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.78 
 
 		 264 aa  273  3e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2198  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.42 
 
 		 257 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.333099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2151  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.42 
 
 		 257 aa  272  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0163963  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0483  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.38 
 
 		 258 aa  271  6e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2251  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.42 
 
 		 257 aa  271  9e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.476505  normal  0.353064 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  56.1 
 
 		 254 aa  270  2e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.23833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2711  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.6 
 
 		 248 aa  269  2.9999999999999997e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1011  precorrin-4 C11-methyltransferase  56.1 
 
 		 254 aa  268  8e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.04114  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0962  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.92 
 
 		 254 aa  267  1e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.6045  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1747  precorrin-4 C11-methyltransferase  55.28 
 
 		 254 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.129763  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1294  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.42 
 
 		 248 aa  263  2e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.04031 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3541  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.59 
 
 		 261 aa  258  5.0000000000000005e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3231  precorrin-4 C11-methyltransferase  52 
 
 		 258 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00900029  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.8 
 
 		 250 aa  256  2e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3607  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.79 
 
 		 261 aa  256  3e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0933  precorrin-4 C11-methyltransferase  49 
 
 		 260 aa  255  4e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00452437 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2129  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.2 
 
 		 259 aa  251  5.000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738255 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.21 
 
 		 867 aa  250  2e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0059  precorrin-4 C11-methyltransferase  49 
 
 		 256 aa  249  3e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4477  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.2 
 
 		 610 aa  248  8e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00717843  normal  0.120162 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0473  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.4 
 
 		 252 aa  246  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0702  precorrin-4 C11-methyltransferase  50 
 
 		 244 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1288  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.8 
 
 		 626 aa  240  2e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2087  precorrin-3 methylase  49 
 
 		 257 aa  238  9e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1265  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.46 
 
 		 267 aa  237  1e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0571  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.26 
 
 		 272 aa  235  4e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.505536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3650  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.19 
 
 		 252 aa  235  6e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.796321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0638  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.86 
 
 		 271 aa  232  5e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0640  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.38 
 
 		 257 aa  229  2e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.194872  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1014  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.99 
 
 		 626 aa  228  9e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2300  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.27 
 
 		 273 aa  227  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.366203  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1853  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.42 
 
 		 247 aa  227  2e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0211  cobalamin biosynthesis protein CbiG/precorrin-4 C11-methyltransferase  46.5 
 
 		 614 aa  224  8e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1968  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.55 
 
 		 261 aa  221  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3737  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.06 
 
 		 275 aa  218  7e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3020  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.97 
 
 		 249 aa  217  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.157987 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1557  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.49 
 
 		 256 aa  217  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0050  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.94 
 
 		 255 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3154  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.75 
 
 		 249 aa  215  4e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.134288  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1521  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.61 
 
 		 261 aa  216  4e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000101409 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3103  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.59 
 
 		 248 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2446  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.55 
 
 		 261 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.130726  normal  0.124304 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0627  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-4 C11-methyltransferase  48.12 
 
 		 242 aa  211  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1229  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.72 
 
 		 264 aa  210  1e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0594011 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25920  precorrin-3 methylase  44 
 
 		 250 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0297541  normal  0.071417 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1249  precorrin-4 C11-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  46.22 
 
 		 241 aa  209  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.230063  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2501  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.64 
 
 		 251 aa  209  3e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.218572 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2609  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.1 
 
 		 257 aa  209  3e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1887  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.32 
 
 		 262 aa  209  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0177135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2530  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.82 
 
 		 250 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00855327 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3136  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.09 
 
 		 272 aa  208  7e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749873 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1375  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.84 
 
 		 257 aa  207  9e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286247 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3384  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.02 
 
 		 253 aa  207  9e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215023  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5365  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.8 
 
 		 241 aa  207  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.973627 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3139  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.54 
 
 		 243 aa  207  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2357  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.14 
 
 		 259 aa  207  1e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.342045  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2213  precorrin-3 methylase  43.2 
 
 		 250 aa  206  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04601  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.73 
 
 		 250 aa  207  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.909229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2635  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.06 
 
 		 263 aa  206  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.231618  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6035  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.06 
 
 		 275 aa  206  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3410  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.03 
 
 		 250 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.231837 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1693  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.67 
 
 		 269 aa  206  4e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0620  precorrin-4 C11-methyltransferase protein  44.27 
 
 		 271 aa  205  6e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.263132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2352  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.03 
 
 		 250 aa  205  7e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0905  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.4 
 
 		 269 aa  204  9e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0114  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.9 
 
 		 262 aa  204  1e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177043  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2117  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.12 
 
 		 241 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.105353  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1972  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.12 
 
 		 241 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3152  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.34 
 
 		 253 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.422575  normal  0.404272 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1955  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.12 
 
 		 241 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132176  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0806  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  41.37 
 
 		 273 aa  202  3e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2358  precorrin-4 C11-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  46.69 
 
 		 243 aa  202  3e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1980  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.82 
 
 		 287 aa  202  4e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7180  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.73 
 
 		 252 aa  202  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.987588  normal  0.0970048 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1198  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.54 
 
 		 242 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1651  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.54 
 
 		 242 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1678  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.54 
 
 		 242 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0635313  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1718  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.4 
 
 		 598 aa  202  4e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.956767  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4589  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.32 
 
 		 251 aa  202  5e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1596  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.54 
 
 		 242 aa  201  7e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.727098  normal  0.416998 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1578  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.12 
 
 		 242 aa  201  8e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00147705  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2779  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.95 
 
 		 250 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0901  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.28 
 
 		 241 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.324814  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1157  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.28 
 
 		 241 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917528  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1598  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.28 
 
 		 241 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00151458  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0259  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.28 
 
 		 241 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>