45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0161 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0161  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  346  8e-95  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00228251  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1422  hypothetical protein  34.62 
 
 		 155 aa  99.8  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.501791  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0147  Thioredoxin domain  33.82 
 
 		 321 aa  85.9  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0166  hypothetical protein  38.39 
 
 		 350 aa  80.9  0.000000000000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0134966  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1598  hypothetical protein  33.61 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.82539 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3686  restriction endonuclease  36.9 
 
 		 421 aa  68.2  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1841  Thioredoxin domain  33.91 
 
 		 314 aa  67  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.928879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5766  hypothetical protein  30 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1875  hypothetical protein  31.63 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0842968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3757  hypothetical protein  33.33 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.639836  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1484  hypothetical protein  36.9 
 
 		 339 aa  60.8  0.000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.243406 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4466  hypothetical protein  30.3 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08091  hypothetical protein  30.08 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2057  hypothetical protein  29.66 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0426  hypothetical protein  27.88 
 
 		 174 aa  53.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0272126  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0806  protein of unknown function DUF255  25.4 
 
 		 274 aa  52.8  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.862822  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2613  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  26.92 
 
 		 421 aa  50.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0486  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  21.24 
 
 		 176 aa  48.9  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2885  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.39 
 
 		 449 aa  49.3  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.326316 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2780  thioredoxin-related protein-like protein  28.44 
 
 		 391 aa  48.5  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0175859  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0427  hypothetical protein  26.42 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00405131  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2821  hypothetical protein  31.68 
 
 		 569 aa  46.2  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.642839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1423  hypothetical protein  23.48 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.492323  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7116  thioredoxin domain protein  23.38 
 
 		 161 aa  45.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1413  hypothetical protein  27.88 
 
 		 236 aa  45.1  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2038  Thioredoxin domain protein  29.29 
 
 		 357 aa  44.7  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.571694  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1855  protein of unknown function DUF255  24.37 
 
 		 172 aa  44.3  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0979  protein of unknown function DUF255  30.88 
 
 		 536 aa  44.3  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.571094  normal  0.95271 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2461  hypothetical protein  22.06 
 
 		 435 aa  43.5  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.321455  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0364  thioredoxin  27.27 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0805  Thioredoxin domain protein  22.55 
 
 		 270 aa  42.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0588  hypothetical protein  24.78 
 
 		 692 aa  42.7  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.155052  normal  0.0633893 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1456  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  26.45 
 
 		 406 aa  42.4  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4103  protein of unknown function DUF255  27.84 
 
 		 185 aa  42.4  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.57841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0523  hypothetical protein  26 
 
 		 168 aa  42.4  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.419067  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1424  hypothetical protein  23.4 
 
 		 149 aa  42  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.585273  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04810  hypothetical protein  24.79 
 
 		 179 aa  42  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.543485  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0376  Thioredoxin-related protein-like protein  22.58 
 
 		 193 aa  42  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.341694  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0822  Highly conserved protein containing a thioredoxin domain  22.45 
 
 		 590 aa  42  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0928635  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04029  disulphide-isomerase  23.73 
 
 		 529 aa  42  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3249  Thiol:disulfide interchange protein-like protein  27.52 
 
 		 179 aa  42  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0805805  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0131  thioredoxin domain-containing protein  27.27 
 
 		 149 aa  41.2  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000222115  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0111  hypothetical protein  23.48 
 
 		 178 aa  41.2  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0277  protein of unknown function DUF255  25.44 
 
 		 531 aa  40.8  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.137816  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0636  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.55 
 
 		 466 aa  40.8  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.619274 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>