More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0058 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0058  hypothetical protein  100 
 
 		 393 aa  820    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.296925  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1237  FeS assembly protein SufD  28.53 
 
 		 433 aa  114  3e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2024  FeS assembly protein SufD  27.13 
 
 		 444 aa  97.1  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.554026  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0537  FeS assembly protein SufD  28.1 
 
 		 445 aa  93.6  5e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0242  hypothetical protein  27.54 
 
 		 439 aa  93.2  6e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04460  FeS assembly protein SufD  23.99 
 
 		 437 aa  92.4  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0976  iron-regulated ABC transporter, membrane-spanning permease  25.46 
 
 		 425 aa  91.3  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.307053  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0174  FeS assembly protein SufD  25.15 
 
 		 441 aa  90.5  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000908978 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3038  FeS assembly protein SufD  27.22 
 
 		 436 aa  89.7  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0292386 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1180  FeS assembly protein SufD  25.52 
 
 		 438 aa  89.4  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5846  FeS assembly protein SufD  28.11 
 
 		 439 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00798373  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0654  hypothetical protein  25.89 
 
 		 428 aa  88.6  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3443  FeS assembly protein SufD  27.32 
 
 		 451 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.656128  hitchhiker  0.0000000788125 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5779  FeS assembly protein SufD  26.87 
 
 		 439 aa  87.8  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1446  SufD  27.04 
 
 		 426 aa  87.8  3e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1513  FeS assembly protein SufD  26.73 
 
 		 426 aa  87  4e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0259  hypothetical protein  25.35 
 
 		 447 aa  86.7  6e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1235  FeS assembly protein SufD  27.51 
 
 		 445 aa  86.7  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.722398  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3311  FeS assembly protein SufD  28.13 
 
 		 430 aa  85.1  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0698  FeS assembly protein SufD  25.07 
 
 		 440 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3353  FeS assembly protein SufD  26.3 
 
 		 439 aa  85.1  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.315462 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0638  hypothetical protein  25.89 
 
 		 428 aa  84.7  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2270  FeS assembly protein SufD  41.44 
 
 		 399 aa  84.3  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.197633  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0426  FeS assembly protein SufD  26.72 
 
 		 454 aa  82.4  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2838  FeS assembly protein SufD  27.19 
 
 		 459 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0458271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2744  FeS assembly protein SufD  25.86 
 
 		 437 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1850  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  28.89 
 
 		 441 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0513191  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2447  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  26.15 
 
 		 448 aa  82  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0918237  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3153  FeS assembly protein SufD  27.08 
 
 		 428 aa  81.6  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2391  FeS assembly protein SufD  24.65 
 
 		 455 aa  80.5  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2749  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  27.86 
 
 		 448 aa  80.5  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0636938  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2991  FeS assembly protein SufD  26.36 
 
 		 437 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.109505 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5107  FeS assembly protein SufD  26.21 
 
 		 439 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0193182 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1194  FeS assembly protein SufD  38.28 
 
 		 426 aa  79.7  0.00000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0412715  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0905  FeS assembly protein SufD  25.9 
 
 		 437 aa  79.7  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.915641 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2458  FeS assembly protein SufD  27.35 
 
 		 437 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.833793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2331  FeS assembly protein SufB  28.62 
 
 		 467 aa  78.6  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.291789  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1897  FeS assembly protein SufD  25.8 
 
 		 454 aa  78.6  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2591  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  28.57 
 
 		 441 aa  78.6  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3968  sufD, needed for fhuF Fe-S center production/stability  26.69 
 
 		 440 aa  77.8  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.287239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4467  FeS assembly protein SufD  27.59 
 
 		 446 aa  77.4  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0428  FeS assembly protein SufD  23.73 
 
 		 455 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0417  FeS assembly protein SufD  23.73 
 
 		 455 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1662  FeS assembly protein SufD  37.72 
 
 		 440 aa  76.3  0.0000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.1269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2326  FeS assembly protein SufD  32.48 
 
 		 441 aa  76.3  0.0000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254342  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1744  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  29.84 
 
 		 441 aa  75.5  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000189062  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2438  transport system  32.26 
 
 		 424 aa  76.3  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.629208  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0895  FeS assembly protein SufD  28 
 
 		 437 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1897  FeS assembly protein SufD  26.13 
 
 		 424 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363376 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0891  FeS assembly protein SufD  28 
 
 		 439 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4170  FeS assembly protein SufD  24.42 
 
 		 445 aa  75.1  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2359  SufBD protein  32.34 
 
 		 427 aa  75.5  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.421889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0727  FeS assembly protein SufD  26.16 
 
 		 441 aa  75.5  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1697  FeS assembly protein SufD  27.22 
 
 		 430 aa  74.7  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.294615  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2488  FeS assembly protein SufD  24.71 
 
 		 446 aa  74.3  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2571  FeS assembly protein SufD  30.18 
 
 		 447 aa  74.7  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.993498  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1416  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  25.8 
 
 		 439 aa  74.7  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.199083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0463  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  27.47 
 
 		 432 aa  74.3  0.000000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.366005  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2104  FeS assembly protein SufD  26.62 
 
 		 424 aa  74.7  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.111297 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4357  FeS assembly protein SufD  23.87 
 
 		 453 aa  74.7  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.352914 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5929  sufD, needed for fhuF Fe-S center production/stability  26.55 
 
 		 441 aa  74.3  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3282  FeS assembly protein SufD  40.52 
 
 		 467 aa  74.3  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534903  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0845  FeS assembly protein SufD  27.71 
 
 		 437 aa  74.3  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.431893  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2091  SufBD protein  31.14 
 
 		 427 aa  73.9  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.781657 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1970  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  25.46 
 
 		 423 aa  73.2  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000806248 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4731  FeS assembly protein SufD  31.06 
 
 		 454 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1504  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  25.46 
 
 		 423 aa  72.8  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.429921  hitchhiker  0.0000000349756 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2919  FeS assembly protein SufB  26.87 
 
 		 465 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1469  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  25.46 
 
 		 423 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.866432  normal  0.0690013 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4459  FeS assembly protein SufD  24.05 
 
 		 440 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.2712 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0697  SufBD protein  25.57 
 
 		 440 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0893866 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49608  FeS assembly protein suf  30.46 
 
 		 690 aa  72  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01650  component of SufBCD complex  37.04 
 
 		 423 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000917299  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1961  FeS assembly protein SufD  27.1 
 
 		 423 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0846147  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1515  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  37.04 
 
 		 423 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.252227  hitchhiker  0.00000429728 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1950  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  37.04 
 
 		 423 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0520002  hitchhiker  0.00000220398 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1862  FeS assembly protein SufD  25.35 
 
 		 442 aa  71.2  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0670  SufBD  33.9 
 
 		 242 aa  71.2  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.351834 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1762  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  37.04 
 
 		 423 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0210181  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1897  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  37.04 
 
 		 423 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00143509  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2395  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  37.04 
 
 		 423 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.087197  hitchhiker  0.000115041 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01640  hypothetical protein  37.04 
 
 		 423 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000779694  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1485  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  25.46 
 
 		 423 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000206713 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1346  FeS assembly protein SufD  35.9 
 
 		 419 aa  70.9  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.641587  hitchhiker  0.00000000191252 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1799  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  25.46 
 
 		 423 aa  70.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.024835  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2358  SufBD  37.19 
 
 		 430 aa  70.9  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.14407 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1779  FeS assembly protein SufD  29.73 
 
 		 422 aa  70.9  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.377637  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0998  FeS assembly protein SufD  27.33 
 
 		 420 aa  70.5  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.364227  normal  0.129171 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3967  SufBD protein  34.55 
 
 		 448 aa  70.5  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.835948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1882  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  37.04 
 
 		 423 aa  70.1  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.077757  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3260  FeS assembly protein SufD  25.08 
 
 		 437 aa  69.7  0.00000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.854773 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2182  FeS assembly protein SufD  27.59 
 
 		 430 aa  69.3  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00372384  hitchhiker  0.000585375 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1466  FeS assembly protein SufD  30.77 
 
 		 425 aa  69.3  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.269271  normal  0.0505489 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0816  ABC transporter membrane protein  43.4 
 
 		 422 aa  68.9  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0798  FeS assembly protein SufD  41.57 
 
 		 448 aa  69.3  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0175  FeS assembly protein SufB  24.33 
 
 		 476 aa  69.3  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0472  FeS assembly protein SufD  27.14 
 
 		 450 aa  69.3  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.337092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00791  ABC transporter, membrane component  39.42 
 
 		 408 aa  68.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.917338 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0990  FeS assembly protein SufD  37.07 
 
 		 434 aa  68.6  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3070  FeS assembly protein SufB  26.12 
 
 		 465 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>