70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13911 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13911  proline and alanine rich protein  100 
 
 
666 aa  1303    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000165263  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0080  hypothetical protein  67.24 
 
 
455 aa  437  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.123859  normal  0.0231651 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0765  hypothetical protein  67.24 
 
 
463 aa  432  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0072  hypothetical protein  69.28 
 
 
475 aa  428  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0062  hypothetical protein  69.66 
 
 
475 aa  428  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0081  hypothetical protein  69.28 
 
 
475 aa  428  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0649479  hitchhiker  0.00792141 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6711  chromosome partitioning ATPase  40.97 
 
 
495 aa  229  8e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5456  hypothetical protein  37.17 
 
 
425 aa  227  4e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3652  chromosome partitioning ATPase  39.22 
 
 
478 aa  213  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114949  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0689  hypothetical protein  39.39 
 
 
388 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.211622  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0709  hypothetical protein  39.39 
 
 
388 aa  209  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0696  hypothetical protein  39.39 
 
 
388 aa  209  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3653  chromosome partitioning ATPase  39.08 
 
 
418 aa  206  9e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0511335  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5275  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  40.21 
 
 
698 aa  205  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0077  chromosome partitioning-like ATPase  40.42 
 
 
639 aa  204  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.989213  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0073  chromosome partitioning ATPase  40.91 
 
 
619 aa  204  4e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02980  chromosome partitioning ATPase  38.85 
 
 
343 aa  202  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0128  chromosome partitioning ATPase  38.11 
 
 
665 aa  196  9e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0147  chromosome partitioning ATPase  37.06 
 
 
899 aa  195  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10541  hypothetical protein  39.44 
 
 
405 aa  193  9e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.06811e-17  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0163  hypothetical protein  38.89 
 
 
771 aa  192  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0048  hypothetical protein  38.36 
 
 
364 aa  189  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.352611 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0870  hypothetical protein  37.67 
 
 
362 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.20126  normal  0.386296 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9252  chromosome partitioning ATPase  38.87 
 
 
330 aa  163  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.589568  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2288  hypothetical protein  36.39 
 
 
346 aa  162  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4873  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  36.43 
 
 
412 aa  152  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5779  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  31.76 
 
 
532 aa  150  6e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.374626  normal  0.249782 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3172  hypothetical protein  32.19 
 
 
453 aa  145  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.209106  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2936  hypothetical protein  30.62 
 
 
416 aa  137  8e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0061  hypothetical protein  35.09 
 
 
319 aa  134  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0070  hypothetical protein  35.09 
 
 
319 aa  134  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.216114  normal  0.0962693 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0051  hypothetical protein  35.09 
 
 
319 aa  134  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00417598 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13896  hypothetical protein  31.6 
 
 
390 aa  134  7.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0175743  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5565  hypothetical protein  29.82 
 
 
414 aa  132  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114758  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0476  chromosome partitioning ATPase  32.49 
 
 
1160 aa  126  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0069  hypothetical protein  33.68 
 
 
390 aa  125  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0331  hypothetical protein  33.56 
 
 
579 aa  124  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13923  hypothetical protein  30.77 
 
 
341 aa  121  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.979459  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12800  hypothetical protein  30.89 
 
 
587 aa  120  6e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0623  chromosome partitioning ATPase  36.61 
 
 
544 aa  118  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0137  hypothetical protein  30.72 
 
 
1519 aa  117  8.999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3058  chromosome partitioning-like ATPase  32.99 
 
 
926 aa  115  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8473  chromosome partitioning ATPase  31.13 
 
 
968 aa  107  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1098  chromosome partitioning ATPase  28.22 
 
 
1132 aa  107  7e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5968  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  27.8 
 
 
552 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4616  chromosome partitioning ATPase  26.85 
 
 
811 aa  101  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5977  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  26.86 
 
 
542 aa  100  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.718927 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0137  chromosome partitioning ATPase  26.69 
 
 
586 aa  96.3  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.458231  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0132  chromosome partitioning ATPase  25.4 
 
 
533 aa  89.7  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422439  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  32.79 
 
 
2449 aa  77  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03240  chromosome partitioning ATPase  23.4 
 
 
617 aa  74.7  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.334592  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0587  ATPase involved in chromosome partitioning  25.38 
 
 
534 aa  68.2  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.068267  normal  0.016158 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2421  putative signal peptide  25.26 
 
 
439 aa  67.4  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3425  hypothetical protein  26.79 
 
 
474 aa  66.2  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.945444  normal  0.0252513 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  32.5 
 
 
2179 aa  64.3  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0776  hypothetical protein  26.79 
 
 
380 aa  64.3  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.727496  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  26.5 
 
 
3409 aa  62  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  24.69 
 
 
3521 aa  60.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3199  hypothetical protein  26.27 
 
 
487 aa  58.9  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0874  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.13 
 
 
258 aa  52  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3184  chromosome partitioning ATPase protein-like  27.17 
 
 
659 aa  52  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0666386  normal  0.217306 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3978  hypothetical protein  31.29 
 
 
544 aa  51.2  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.461559 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4553  hypothetical protein  25.37 
 
 
497 aa  50.8  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387687 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4508  hypothetical protein  25.27 
 
 
478 aa  50.8  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42849  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7293  hypothetical protein  32.48 
 
 
1095 aa  49.3  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.35344 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1550  septum site-determining protein MinD  29.7 
 
 
267 aa  49.3  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.300295  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3999  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  26.29 
 
 
334 aa  46.2  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.354735  normal 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4185  hypothetical protein  25.54 
 
 
485 aa  46.6  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0949  septum site-determining protein MinD  29.19 
 
 
271 aa  45.1  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.790787  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0927  septum site-determining protein MinD  29.19 
 
 
274 aa  45.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>