More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0683 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0683  potassium channel protein  100 
 
 		 341 aa  679    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  56.53 
 
 		 354 aa  398  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  58.44 
 
 		 338 aa  389  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  57.88 
 
 		 355 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  56.21 
 
 		 362 aa  371  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  55.63 
 
 		 356 aa  355  5.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  55.63 
 
 		 356 aa  354  1e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  43.11 
 
 		 350 aa  279  4e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  43.11 
 
 		 350 aa  278  1e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  41.09 
 
 		 351 aa  268  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  42.51 
 
 		 351 aa  266  5e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  42.51 
 
 		 351 aa  266  5e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  42.51 
 
 		 351 aa  265  8e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  40.66 
 
 		 351 aa  260  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  40.84 
 
 		 351 aa  258  8e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  45.64 
 
 		 352 aa  257  2e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  39.88 
 
 		 350 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  44.76 
 
 		 352 aa  252  5.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  40.49 
 
 		 337 aa  250  3e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  41.16 
 
 		 332 aa  249  4e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  40.18 
 
 		 350 aa  249  6e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  44.27 
 
 		 359 aa  245  8e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  45.03 
 
 		 351 aa  245  9e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  37.13 
 
 		 347 aa  237  2e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  37.79 
 
 		 335 aa  235  6e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  37.11 
 
 		 331 aa  231  2e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  36.56 
 
 		 332 aa  228  2e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  39.24 
 
 		 350 aa  227  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  36.25 
 
 		 332 aa  226  4e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  36.36 
 
 		 336 aa  225  8e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  33.74 
 
 		 333 aa  220  3e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  35.37 
 
 		 335 aa  220  3e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  35.37 
 
 		 335 aa  219  6e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  41.05 
 
 		 346 aa  217  2e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  35.67 
 
 		 335 aa  217  2e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  40.74 
 
 		 346 aa  216  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  35.31 
 
 		 346 aa  215  9e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  34.04 
 
 		 341 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  33.85 
 
 		 325 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  32.56 
 
 		 346 aa  210  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  36.25 
 
 		 371 aa  208  9e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  32.52 
 
 		 330 aa  207  3e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  32.64 
 
 		 337 aa  205  8e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  32.93 
 
 		 330 aa  204  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  33.84 
 
 		 335 aa  202  5e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  32.63 
 
 		 334 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  36.7 
 
 		 350 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  32.63 
 
 		 334 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  37.42 
 
 		 384 aa  201  1.9999999999999998e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  32.63 
 
 		 330 aa  200  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  32.93 
 
 		 330 aa  200  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  32.93 
 
 		 330 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  30.82 
 
 		 346 aa  198  9e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  34.67 
 
 		 345 aa  194  3e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  36.79 
 
 		 341 aa  194  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  34.6 
 
 		 368 aa  189  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  36 
 
 		 337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  34.23 
 
 		 352 aa  180  4e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  30.53 
 
 		 339 aa  177  2e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  33.13 
 
 		 357 aa  169  7e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1346  TrkA domain-containing protein  31.33 
 
 		 376 aa  166  5.9999999999999996e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.538374  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  29.52 
 
 		 355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0721  hypothetical protein  30.57 
 
 		 335 aa  160  4e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  30.64 
 
 		 509 aa  159  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0972  hypothetical protein  29.66 
 
 		 376 aa  158  2e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.625398  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  32.78 
 
 		 366 aa  151  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1601  hypothetical protein  28.04 
 
 		 378 aa  150  4e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2680  TrkA domain-containing protein  30.49 
 
 		 397 aa  147  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000721375  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0771  hypothetical protein  28.44 
 
 		 376 aa  145  1e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.94547  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2212  TrkA domain-containing protein  31.38 
 
 		 347 aa  138  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217414  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  29.97 
 
 		 346 aa  137  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1030  conserved hypothetical protein (TrkA domain protein)  25.87 
 
 		 375 aa  133  3e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.583921  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  24 
 
 		 324 aa  124  2e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  35.87 
 
 		 388 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4906  TrkA-N domain protein  27.36 
 
 		 368 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0415092 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1138  TrkA-N domain protein  31.8 
 
 		 366 aa  115  8.999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.576747  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1804  TrkA domain-containing protein  35.27 
 
 		 359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.008758  normal  0.0737173 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3499  TrkA-N domain protein  31.7 
 
 		 356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133106  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13223  transmembrane cation transporter  31.99 
 
 		 355 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1256  TrkA-N domain protein  31.88 
 
 		 350 aa  114  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430368  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4663  TrkA domain-containing protein  32.4 
 
 		 359 aa  114  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  31.84 
 
 		 395 aa  112  9e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1743  TrkA-N domain protein  31.25 
 
 		 256 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.589845 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  25.63 
 
 		 531 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  34.48 
 
 		 395 aa  110  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5245  potassium channel protein, C-terminus  35.23 
 
 		 182 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.835427  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1162  TrkA-like protein  24.65 
 
 		 386 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.30388 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3113  potassium channel protein  29.53 
 
 		 347 aa  107  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.144823  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2358  TrkA domain-containing protein  30.77 
 
 		 564 aa  107  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4030  TrkA domain-containing protein  25.65 
 
 		 364 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.702941  normal  0.742816 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1993  TrkA-N domain protein  31.33 
 
 		 399 aa  103  6e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0873902 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1460  TrkA domain-containing protein  29.55 
 
 		 359 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0703342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3710  TrkA-N  24.78 
 
 		 364 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360814  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4658  TrkA domain-containing protein  24.78 
 
 		 364 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.677832  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2398  TrkA-N domain protein  26.4 
 
 		 417 aa  102  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06820  K+ transport system, NAD-binding component  31.82 
 
 		 370 aa  102  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.074637  normal  0.0591627 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2377  voltage-gated potassium channel  26.4 
 
 		 417 aa  102  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.408742  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1398  voltage-gated potassium channel  26.4 
 
 		 417 aa  102  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.488594  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1359  voltage-gated potassium channel  26.4 
 
 		 417 aa  102  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000079785  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1890  voltage-gated potassium channel  26.4 
 
 		 402 aa  102  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0139159 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>