More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0061 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0061  CDP-glucose 4,6-dehydratase  100 
 
 
368 aa  758  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0769235  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01401  CDP-glucose 4,6-dehydratase  56.25 
 
 
365 aa  400  1e-110  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2783  CDP-glucose 4,6-dehydratase  55.62 
 
 
386 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.824232 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3334  CDP-glucose 4,6-dehydratase  55.91 
 
 
386 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07611  CDP-glucose 4,6-dehydratase  43.48 
 
 
360 aa  355  8e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3658  CDP-glucose 4,6-dehydratase  50 
 
 
363 aa  345  8e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.758357  normal  0.169877 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4735  CDP-glucose 4,6-dehydratase  50 
 
 
363 aa  345  8e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  0.159125 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0771  CDP-glucose 4,6-dehydratase  48.27 
 
 
372 aa  322  6e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0223168 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1424  hypothetical protein  44.63 
 
 
361 aa  321  1e-86  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0353322  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0856  CDP-glucose 4,6-dehydratase  46.32 
 
 
367 aa  317  2e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3050  CDP-glucose 4,6-dehydratase  43.6 
 
 
391 aa  316  5e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1480  CDP-glucose 4,6-dehydratase  48.41 
 
 
353 aa  315  6e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.988255 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3190  CDP-glucose 4,6-dehydratase  43.6 
 
 
357 aa  315  6e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.170575  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0783  CDP-glucose 4,6-dehydratase  45.33 
 
 
357 aa  315  6e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0592  CDP-glucose 4,6-dehydratase  52.77 
 
 
358 aa  315  8e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1689  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.72 
 
 
357 aa  313  2e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3401  CDP-glucose 4,6-dehydratase  45.68 
 
 
372 aa  312  5e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1880  CDP-glucose 4,6-dehydratase  47.09 
 
 
358 aa  312  6e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.457819 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3718  CDP-glucose 4,6-dehydratase  49.28 
 
 
360 aa  312  6e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.316077  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3789  CDP-glucose 4,6-dehydratase  44.74 
 
 
361 aa  310  2e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0332  CDP-glucose 4,6-dehydratase  44.83 
 
 
364 aa  310  2e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.106161  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4602  CDP-glucose 4,6-dehydratase  45.32 
 
 
359 aa  309  4e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0921242  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1960  CDP-glucose 4,6-dehydratase  45.6 
 
 
362 aa  309  4e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0774  CDP-glucose 4,6-dehydratase  43.48 
 
 
362 aa  309  5e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0920711 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1603  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.25 
 
 
371 aa  308  7e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3349  CDP-glucose 4,6-dehydratase  46.35 
 
 
358 aa  308  1e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2291  CDP-glucose 4,6-dehydratase  46.13 
 
 
361 aa  307  2e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.966324  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2324  CDP-glucose 4,6-dehydratase  43.39 
 
 
359 aa  307  2e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00566999 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2273  CDP-glucose 4,6-dehydratase  43.39 
 
 
359 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  1.24958e-05 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2216  CDP-glucose 4,6-dehydratase  43.39 
 
 
359 aa  306  4e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.776521  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2431  CDP-glucose 4,6-dehydratase  43.39 
 
 
359 aa  306  4e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.310419  hitchhiker  6.78484e-05 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0569  CDP-glucose 4,6-dehydratase  45.92 
 
 
361 aa  306  5e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.76383  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0663  CDP-glucose 4,6-dehydratase  45.92 
 
 
361 aa  306  5e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1962  CDP-glucose 4,6-dehydratase  45.92 
 
 
357 aa  305  7e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.41 
 
 
360 aa  305  8e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3062  CDP-glucose 4,6-dehydratase  44.69 
 
 
352 aa  305  9e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2317  CDP-glucose 4,6-dehydratase  43.1 
 
 
359 aa  305  1e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0156634 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0627  CDP-glucose 4,6-dehydratase  45.8 
 
 
366 aa  303  3e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2191  CDP-glucose 4,6-dehydratase  43.65 
 
 
365 aa  302  5e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00831743  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12911  CDP-glucose 4,6-dehydratase  43.13 
 
 
366 aa  302  6e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.253167  hitchhiker  0.00798919 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3529  CDP-glucose 4,6-dehydratase  41.46 
 
 
362 aa  302  8e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1983  CDP-glucose 4,6-dehydratase (O-antigen-related)  47.69 
 
 
357 aa  301  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0806  CDP-glucose 4,6-dehydratase  47.69 
 
 
364 aa  301  1e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0841534  normal  0.289555 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0709  CDP-glucose 4,6-dehydratase  41.69 
 
 
356 aa  300  2e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1702  CDP-glucose 4,6-dehydratase  41.19 
 
 
362 aa  299  6e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.412551  hitchhiker  1.17345e-13 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1257  NAD-dependent epimerase/dehydratase:polysaccharide biosynthesis protein CapD  46.67 
 
 
365 aa  297  2e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0876  CDP-glucose 4,6-dehydratase  46.29 
 
 
371 aa  296  4e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4010  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.78 
 
 
358 aa  295  7e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  0.168772 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2768  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.74 
 
 
357 aa  293  2e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.24 
 
 
367 aa  294  2e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.295037  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2876  CDP-glucose 4,6-dehydratase  47.13 
 
 
355 aa  293  3e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27770  CDP-glucose 4,6-dehydratase  46.51 
 
 
358 aa  291  8e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0847  CDP-glucose 4,6-dehydratase  47.4 
 
 
368 aa  291  2e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.307113  normal  0.210188 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2715  CDP-glucose 4,6-dehydratase  45.11 
 
 
366 aa  286  6e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.525402  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2888  CDP-glucose 4,6-dehydratase  44.44 
 
 
368 aa  284  1e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1909  CDP-glucose 4,6-dehydratase  43.89 
 
 
369 aa  283  2e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0777  CDP-glucose 4,6-dehydratase  41.85 
 
 
358 aa  282  7e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3401  CDP-glucose 4,6-dehydratase  40.93 
 
 
366 aa  281  1e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  7.73514e-06 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0130  CDP-glucose 4,6-dehydratase  40.63 
 
 
353 aa  281  1e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.837916  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3695  CDP-glucose-4,6-dehydratase, putative  45.4 
 
 
368 aa  276  5e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3374  CDP-glucose 4,6-dehydratase  41.5 
 
 
351 aa  274  2e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.69 
 
 
366 aa  273  4e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1131  CDP-glucose 4,6-dehydratase  43.25 
 
 
367 aa  271  1e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1258  CDP-glucose 4,6-dehydratase  46.84 
 
 
364 aa  269  4e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3396  CDP-glucose 4,6-dehydratase  41.21 
 
 
351 aa  270  4e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3070  CDP-glucose 4,6-dehydratase  41.62 
 
 
351 aa  268  1e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4419  CDP-glucose 4,6-dehydratase  45.73 
 
 
361 aa  267  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.67049 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3400  CDP-glucose 4,6-dehydratase  41.5 
 
 
351 aa  267  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2561  CDP-glucose 4,6-dehydratase  38.9 
 
 
379 aa  262  6e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4218  CDP-glucose 4,6-dehydratase  43.06 
 
 
354 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.527744  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0387  CDP-glucose 4,6-dehydratase  43.64 
 
 
367 aa  256  3e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3352  CDP-glucose 4,6-dehydratase  42.21 
 
 
362 aa  256  4e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.45248 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4510  CDP-glucose 4,6-dehydratase  41.93 
 
 
354 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0220164  normal  0.0184859 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10410  CDP-glucose 4,6-dehydratase  40.7 
 
 
395 aa  249  6e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1872  CDP-glucose 4,6-dehydratase  41.71 
 
 
357 aa  211  1e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.986998  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2838  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.97 
 
 
324 aa  157  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.904735  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1896  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.63 
 
 
331 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3176  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.14 
 
 
331 aa  133  4e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.759181  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.75 
 
 
406 aa  132  8e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.24 
 
 
413 aa  96.3  8e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.245536  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.88 
 
 
411 aa  94.4  3e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  6.39635e-06 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3176  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.57 
 
 
329 aa  93.2  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2035  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.56 
 
 
378 aa  89.4  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0884  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.72 
 
 
328 aa  89  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4072  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  22.54 
 
 
323 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.416009  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.49 
 
 
336 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0634  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.61 
 
 
375 aa  87  4e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.75247  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3167  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.54 
 
 
343 aa  86.7  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01521  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  22.6 
 
 
357 aa  86.3  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2858  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.54 
 
 
417 aa  85.9  9e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0350628  normal  0.478432 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0939  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.58 
 
 
348 aa  85.5  1e-15  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26862  nad-dependent epimerase/dehydratase  25.48 
 
 
408 aa  85.9  1e-15  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.095088  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2404  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.5 
 
 
323 aa  85.5  1e-15  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.672695  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1399  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.89 
 
 
339 aa  85.9  1e-15  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0294946 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0107  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.26 
 
 
367 aa  85.1  2e-15  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1269  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.3 
 
 
323 aa  85.1  2e-15  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.281724  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0050  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.87 
 
 
351 aa  84  4e-15  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1375  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.17 
 
 
322 aa  83.6  5e-15  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3306  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25 
 
 
356 aa  82.4  1e-14  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.310142  normal  0.339449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4320  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.96 
 
 
327 aa  82.4  1e-14  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>