299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2350 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2350  ribosome-binding factor A  100 
 
 		 140 aa  275  1e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.840269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0341  ribosome-binding factor A  83.46 
 
 		 134 aa  223  6e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26151  ribosome-binding factor A  73.38 
 
 		 142 aa  200  4e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01271  ribosome-binding factor A  68.22 
 
 		 130 aa  185  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1480  ribosome-binding factor A  61.16 
 
 		 123 aa  166  9e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.243092  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01851  ribosome-binding factor A  61.16 
 
 		 123 aa  166  9e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.30308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0838  ribosome-binding factor A  54.48 
 
 		 134 aa  157  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.102995 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2665  ribosome-binding factor A  55.38 
 
 		 133 aa  154  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0640591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2895  ribosome-binding factor A  55.83 
 
 		 137 aa  151  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.437558  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4927  ribosome-binding factor A  57.63 
 
 		 132 aa  149  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1869  ribosome-binding factor A  53.85 
 
 		 131 aa  143  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0355  ribosome-binding factor A  56.14 
 
 		 137 aa  142  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.417644  normal  0.687785 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1217  ribosome-binding factor A  51.72 
 
 		 128 aa  133  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1247  ribosome-binding factor A  51.72 
 
 		 128 aa  133  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0254008 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0990  ribosome-binding factor A  42.15 
 
 		 123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.645083  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01301  ribosome-binding factor A  35.25 
 
 		 130 aa  107  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.665223  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0115  ribosome-binding factor A  34.43 
 
 		 130 aa  107  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01291  ribosome-binding factor A  35.25 
 
 		 130 aa  106  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.774457  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1644  ribosome-binding factor A  38.14 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1956  ribosome-binding factor A  43.86 
 
 		 120 aa  103  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01261  ribosome-binding factor A  33.59 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0310075  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1210  ribosome-binding factor A  44.35 
 
 		 127 aa  100  5e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00755575  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07850  ribosome-binding factor A  39.09 
 
 		 122 aa  99.8  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3187  ribosome-binding factor A  46.3 
 
 		 119 aa  99.8  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.332882 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1436  ribosome-binding factor A  45.05 
 
 		 118 aa  99  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.349731  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1051  ribosome-binding factor A  39.47 
 
 		 122 aa  97.8  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000570949  hitchhiker  0.000000154001 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1557  ribosome-binding factor A  39.82 
 
 		 119 aa  97.4  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000452845  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1445  ribosome-binding factor A  38.74 
 
 		 131 aa  94.4  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000145103  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0458  ribosome-binding factor A  38.39 
 
 		 117 aa  93.6  8e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1939  ribosome-binding factor A  36.94 
 
 		 116 aa  93.2  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1657  ribosome-binding factor A  36.94 
 
 		 116 aa  93.2  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0909  ribosome-binding factor A  39.34 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3675  ribosome-binding factor A  37.39 
 
 		 125 aa  92.8  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1157  ribosome-binding factor A  36.7 
 
 		 126 aa  92  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000826248  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2049  ribosome-binding factor A  35.78 
 
 		 127 aa  92.4  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3858  ribosome-binding factor A  37.5 
 
 		 118 aa  90.5  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1335  ribosome-binding factor A  36.7 
 
 		 118 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0231832  hitchhiker  0.00144693 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3909  ribosome-binding factor A  36.7 
 
 		 118 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.391027  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0927  ribosome-binding factor A  43.4 
 
 		 119 aa  89.7  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100451  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3633  ribosome-binding factor A  36.7 
 
 		 118 aa  90.1  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0539851  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1661  ribosome-binding factor A  39.29 
 
 		 121 aa  89.4  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.661527  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3822  ribosome-binding factor A  36.61 
 
 		 118 aa  88.6  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.3299500000000005e-63 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3849  ribosome-binding factor A  36.61 
 
 		 118 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3552  ribosome-binding factor A  35.71 
 
 		 118 aa  88.2  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3570  ribosome-binding factor A  35.71 
 
 		 118 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1052  ribosome-binding factor A  34.51 
 
 		 132 aa  88.2  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164371  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2463  ribosome-binding factor A  36.61 
 
 		 118 aa  88.6  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0350107  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0610  ribosome-binding factor A  35.45 
 
 		 128 aa  87.8  5e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0012936  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1004  ribosome-binding factor A  42.02 
 
 		 129 aa  87.8  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.439697  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3725  ribosome-binding factor A  42.06 
 
 		 123 aa  87  7e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4179  ribosome-binding factor A  35.82 
 
 		 138 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308306  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0837  ribosome-binding factor A  35.29 
 
 		 116 aa  85.1  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4489  ribosome-binding factor A  35.07 
 
 		 138 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0856583  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3662  ribosome-binding factor A  35.71 
 
 		 118 aa  85.1  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118279  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1587  ribosome-binding factor A  36.28 
 
 		 118 aa  84.7  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00540002  normal  0.129345 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3948  ribosome-binding factor A  35.71 
 
 		 118 aa  85.1  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0901  hypothetical protein  33.63 
 
 		 122 aa  84.7  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0696  ribosome-binding factor A  41.51 
 
 		 124 aa  84.3  5e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146266  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1693  ribosome-binding factor A  35.11 
 
 		 141 aa  84  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0101873  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1589  ribosome-binding factor A  37.17 
 
 		 118 aa  84  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00426148  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1902  ribosome-binding factor A  32.76 
 
 		 122 aa  83.6  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0066847  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1947  ribosome-binding factor A  39.2 
 
 		 130 aa  83.6  8e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0382472 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3851  ribosome-binding factor A  46.53 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.258524  normal  0.192536 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2773  ribosome-binding factor A  34.88 
 
 		 136 aa  82  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0477  ribosome-binding factor A  38.17 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00670849  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1356  ribosome-binding factor A  34.31 
 
 		 116 aa  81.6  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.348543  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0068  ribosome-binding factor A  34.33 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00108757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1230  ribosome-binding factor A  38.6 
 
 		 117 aa  81.6  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.644207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1330  ribosome-binding factor A  34.31 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.285304  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1105  ribosome-binding factor A  38.74 
 
 		 132 aa  80.9  0.000000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.657587  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1232  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 139 aa  80.1  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1304  ribosome-binding factor A  33.64 
 
 		 119 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0293197  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2980  ribosome-binding factor A  33.64 
 
 		 119 aa  79.3  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.06185e-26 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4711  ribosome-binding factor A  38.18 
 
 		 132 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165962  hitchhiker  0.00698134 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4576  ribosome-binding factor A  38.18 
 
 		 132 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.63413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1104  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 138 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0588249  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0722  ribosome-binding factor A  38.18 
 
 		 132 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.041956 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4711  ribosome-binding factor A  38.18 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.31631 
 
 
-
 
NC_002936  DET0982  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 118 aa  78.6  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.385895  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0726  ribosome-binding factor A  37.04 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.237747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0700  ribosome-binding factor A  38.18 
 
 		 119 aa  78.6  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00262073  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1466  ribosome-binding factor A  35.71 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0780  ribosome-binding factor A  36.75 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000489115  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2451  ribosome-binding factor A  37.39 
 
 		 123 aa  77.8  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0315755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1354  ribosome-binding factor A  36.44 
 
 		 117 aa  77.8  0.00000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1164  ribosome-binding factor A  32.61 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.338865  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42810  ribosome-binding factor A  36.04 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3223  ribosome-binding factor A  34.95 
 
 		 121 aa  77.4  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0873  ribosome-binding factor A  31.53 
 
 		 118 aa  76.3  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000231797  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1670  ribosome-binding factor A  36.45 
 
 		 123 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.014786  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_854  ribosome-binding factor A  30.63 
 
 		 118 aa  76.6  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000358033  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1863  ribosome-binding factor A  36.45 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8062  predicted protein  32.62 
 
 		 171 aa  75.5  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00519858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0384  ribosome-binding factor A  34.48 
 
 		 117 aa  75.1  0.0000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1020  ribosome-binding factor A  38.32 
 
 		 153 aa  73.9  0.0000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3607  ribosome-binding factor A  35.25 
 
 		 129 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.858095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3329  ribosome-binding factor A  28.99 
 
 		 156 aa  73.9  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.414674  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2488  ribosome-binding factor A  35.71 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.180348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1445  ribosome-binding factor A  34.51 
 
 		 171 aa  73.9  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.084347  normal  0.20066 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0818  ribosome-binding factor A  30 
 
 		 119 aa  73.6  0.0000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>