More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0511 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0511  GTPase ObgE  100 
 
 
329 aa  657    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130161  normal  0.255445 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1824  GTPase ObgE  86.63 
 
 
329 aa  523  1e-147  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.853156  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03941  GTPase ObgE  82.37 
 
 
329 aa  487  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.937616 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1586  GTPase ObgE  71.04 
 
 
329 aa  468  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.928628  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02961  GTPase ObgE  71.04 
 
 
329 aa  467  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.115383  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02391  GTPase ObgE  72.04 
 
 
329 aa  454  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02481  GTPase ObgE  63.27 
 
 
327 aa  417  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.492857  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02381  GTPase ObgE  64.2 
 
 
327 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.636357  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02391  GTPase ObgE  64.2 
 
 
327 aa  414  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4390  GTPase ObgE  66.36 
 
 
329 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4453  GTPase ObgE  66.36 
 
 
329 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.584179 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  64.42 
 
 
350 aa  402  1e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0220  GTPase ObgE  64.51 
 
 
327 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.915369  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  63.61 
 
 
338 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0959  GTPase ObgE  66.98 
 
 
343 aa  400  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1586  GTPase ObgE  66.56 
 
 
342 aa  395  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0414808  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2049  GTPase ObgE  66.67 
 
 
359 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.390946  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4115  GTPase ObgE  62.88 
 
 
352 aa  373  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593697  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1631  GTPase ObgE  52.6 
 
 
397 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  51.71 
 
 
346 aa  302  4.0000000000000003e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2309  GTPase ObgE  51.69 
 
 
326 aa  300  3e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000014819  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  55.21 
 
 
356 aa  299  4e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  52.25 
 
 
397 aa  299  4e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0165  GTPase ObgE  51.82 
 
 
343 aa  298  6e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  50.77 
 
 
427 aa  297  2e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0866  GTPase ObgE  51.94 
 
 
350 aa  294  1e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  49.69 
 
 
337 aa  294  1e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  54.6 
 
 
419 aa  292  5e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2217  GTPase ObgE  53.14 
 
 
353 aa  291  1e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000677684  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1142  GTPase ObgE  50.61 
 
 
372 aa  289  4e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  50.92 
 
 
372 aa  288  6e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3736  GTPase ObgE  51.54 
 
 
397 aa  288  8e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0046392  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  50.92 
 
 
372 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3522  GTPase ObgE  50.92 
 
 
372 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.091064  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  50.92 
 
 
372 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0196  GTPase ObgE  51.38 
 
 
362 aa  288  1e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825185  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0444  GTPase ObgE  50.92 
 
 
372 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  50.92 
 
 
372 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  50.92 
 
 
372 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3680  GTPase ObgE  51.43 
 
 
406 aa  287  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  49.69 
 
 
365 aa  287  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.36 
 
 
482 aa  287  2e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  49.85 
 
 
327 aa  287  2e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3187  GTPase ObgE  49.06 
 
 
350 aa  287  2e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0509  GTPase ObgE  50.46 
 
 
373 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.626266 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  49.39 
 
 
365 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  52.94 
 
 
422 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0343  GTPase ObgE  50.91 
 
 
346 aa  286  4e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591605  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  52.15 
 
 
347 aa  286  4e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2655  GTPase ObgE  53.92 
 
 
364 aa  285  5e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.031606  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1010  GTPase ObgE  50 
 
 
402 aa  285  5e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000125239  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0476  GTPase ObgE  49.4 
 
 
395 aa  285  5e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3447  GTPase ObgE  50.15 
 
 
373 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179081  hitchhiker  0.00548922 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40770  GTPase ObgE  52.7 
 
 
405 aa  285  7e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0233  GTPase ObgE  51.08 
 
 
332 aa  285  7e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0214  GTPase ObgE  51.08 
 
 
370 aa  285  7e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.301302 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3065  GTPase ObgE  53.92 
 
 
364 aa  285  8e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  48.77 
 
 
387 aa  285  9e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0252  GTPase ObgE  50 
 
 
337 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0998753  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0002  GTPase ObgE  50.3 
 
 
424 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0248  GTPase ObgE  49.69 
 
 
392 aa  283  2.0000000000000002e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.85 
 
 
438 aa  284  2.0000000000000002e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03729  GTPase ObgE  51.54 
 
 
392 aa  283  3.0000000000000004e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.76 
 
 
425 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3668  GTPase ObgE  49.7 
 
 
370 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0100142  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1701  GTPase ObgE  50.62 
 
 
430 aa  282  5.000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0184021  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1734  GTPase ObgE  50.62 
 
 
430 aa  282  5.000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00227669  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  47.99 
 
 
435 aa  282  7.000000000000001e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  47.99 
 
 
435 aa  282  7.000000000000001e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2650  GTPase ObgE  49.09 
 
 
370 aa  281  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0689213  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2820  GTPase ObgE  53.24 
 
 
366 aa  281  1e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0271751  normal  0.376646 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.4 
 
 
434 aa  281  1e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2248  GTPase ObgE  52.31 
 
 
345 aa  280  2e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000169157  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3619  GTPase ObgE  53.82 
 
 
392 aa  280  2e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000171752  normal  0.293815 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5206  GTPase ObgE  52.52 
 
 
406 aa  280  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.683682  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0847  GTP1/OBG domain-containing protein  50.45 
 
 
358 aa  280  3e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3035  GTPase ObgE  51.23 
 
 
345 aa  279  4e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.736033  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1817  GTPase ObgE  50.5 
 
 
354 aa  279  4e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.389419  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60445  GTPase ObgE  51.1 
 
 
406 aa  279  4e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233536 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.38 
 
 
429 aa  279  5e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1027  GTPase ObgE  46.77 
 
 
440 aa  279  5e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1846  GTP1/OBG domain-containing protein  51.8 
 
 
346 aa  278  8e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.603761  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  50.16 
 
 
370 aa  278  8e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  48.92 
 
 
423 aa  278  8e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  49.23 
 
 
408 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  49.23 
 
 
408 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.31 
 
 
426 aa  278  1e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2180  GTPase ObgE  50 
 
 
350 aa  278  1e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.236885  normal  0.801258 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2702  GTPase ObgE  51.55 
 
 
341 aa  277  2e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2574  GTPase ObgE  51.72 
 
 
341 aa  277  2e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0561  GTPase ObgE  53.77 
 
 
390 aa  277  2e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00587502  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0469  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.59 
 
 
327 aa  277  2e-73  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0423  GTPase ObgE  49.38 
 
 
356 aa  277  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0722  GTPase ObgE  48.92 
 
 
408 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4726  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.52 
 
 
342 aa  276  3e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0890343  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0163  GTP1/OBG subdomain-containing protein  49.69 
 
 
424 aa  276  3e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0703  GTPase ObgE  49.54 
 
 
407 aa  276  3e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1871  GTPase ObgE  50.31 
 
 
338 aa  276  3e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0157  GTPase ObgE  49.38 
 
 
349 aa  276  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.526376  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0799  GTP-binding protein, GTP1/Obg family  49.38 
 
 
407 aa  276  4e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>