More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0499 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1836  putative glycerol-3-phosphate dehydrogenase  72.4 
 
 		 529 aa  757    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.399827  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0499  glycerol-3-phosphate oxidase  100 
 
 		 525 aa  1055    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0717318  normal  0.0321239 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2890  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  39.76 
 
 		 532 aa  305  2.0000000000000002e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2819  FAD dependent oxidoreductase  41.37 
 
 		 531 aa  303  5.000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158053  normal  0.100824 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0408  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, FAD-dependent  37.62 
 
 		 545 aa  297  3e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  40.12 
 
 		 539 aa  291  2e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  38.4 
 
 		 537 aa  290  4e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  39.05 
 
 		 537 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01396  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial (AFU_orthologue; AFUA_1G08810)  34.07 
 
 		 700 aa  280  6e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00220943 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.81 
 
 		 530 aa  279  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1508  FAD dependent oxidoreductase  39.01 
 
 		 548 aa  277  3e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  35.94 
 
 		 546 aa  272  1e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30486  predicted protein  36.4 
 
 		 602 aa  265  2e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.349562  normal  0.801939 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0811  FAD dependent oxidoreductase  35.03 
 
 		 542 aa  263  4e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  38.3 
 
 		 528 aa  262  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174141  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  36.02 
 
 		 516 aa  261  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  39.07 
 
 		 529 aa  261  3e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2429  FAD dependent oxidoreductase  35.95 
 
 		 519 aa  260  5.0000000000000005e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.765246  hitchhiker  0.000212597 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6051  FAD dependent oxidoreductase  37.25 
 
 		 552 aa  259  1e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.42 
 
 		 525 aa  258  1e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  38.57 
 
 		 533 aa  257  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000858537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  37.83 
 
 		 543 aa  256  6e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  39.33 
 
 		 532 aa  256  7e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000868135  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2005  FAD dependent oxidoreductase  35.73 
 
 		 543 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.758416  normal  0.433601 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2687  FAD dependent oxidoreductase  36.42 
 
 		 518 aa  254  3e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.95747  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0390  FAD dependent oxidoreductase  38.94 
 
 		 532 aa  253  6e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808861  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04310  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, putative  34.3 
 
 		 798 aa  252  9.000000000000001e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2761  FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit  37.78 
 
 		 517 aa  252  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00308859  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  36.84 
 
 		 566 aa  251  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04320  conserved hypothetical protein  35.44 
 
 		 668 aa  249  7e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.931414  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2135  FAD dependent oxidoreductase  36.98 
 
 		 519 aa  248  2e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68764  mitochondrial glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.12 
 
 		 640 aa  247  4e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  37.24 
 
 		 519 aa  246  6e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0610  FAD dependent oxidoreductase  38.83 
 
 		 540 aa  243  5e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0615442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2214  FAD dependent oxidoreductase  36.72 
 
 		 534 aa  239  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4885  FAD dependent oxidoreductase  31.92 
 
 		 525 aa  238  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1921  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, N-terminal:FAD dependent oxidoreductase  35.69 
 
 		 524 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0569  FAD dependent oxidoreductase  34.68 
 
 		 536 aa  231  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2239  FAD dependent oxidoreductase  35.49 
 
 		 546 aa  230  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0659803 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  34.52 
 
 		 582 aa  221  3e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1243  FAD dependent oxidoreductase  43.39 
 
 		 520 aa  217  5e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0560  FAD dependent oxidoreductase  35.52 
 
 		 603 aa  217  5e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000358551 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.73 
 
 		 591 aa  215  1.9999999999999998e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.39 
 
 		 585 aa  212  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5301  FAD dependent oxidoreductase  35.52 
 
 		 572 aa  209  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4019  FAD dependent oxidoreductase  34.52 
 
 		 573 aa  209  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2593  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.79 
 
 		 605 aa  209  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  33.67 
 
 		 574 aa  205  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2580  FAD dependent oxidoreductase  34.26 
 
 		 579 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000016538 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0265  FAD dependent oxidoreductase  34.66 
 
 		 569 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.339178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0938  FAD dependent oxidoreductase  35.34 
 
 		 595 aa  200  5e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00411841  normal  0.908691 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4251  FAD dependent oxidoreductase  33.8 
 
 		 577 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5123  FAD dependent oxidoreductase  34.69 
 
 		 600 aa  198  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0248  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic  30.92 
 
 		 520 aa  197  4.0000000000000005e-49  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1173  FAD dependent oxidoreductase  34.78 
 
 		 578 aa  196  8.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6411  FAD dependent oxidoreductase  32.67 
 
 		 579 aa  195  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0626  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.8 
 
 		 567 aa  195  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1799  FAD dependent oxidoreductase  32.71 
 
 		 582 aa  194  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2873  FAD dependent oxidoreductase  31.98 
 
 		 583 aa  195  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186763  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1006  FAD dependent oxidoreductase  33.26 
 
 		 576 aa  194  4e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.194481  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1363  FAD dependent oxidoreductase  32.66 
 
 		 579 aa  193  6e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0391  FAD dependent oxidoreductase  34.09 
 
 		 582 aa  193  8e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452734  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1277  FAD dependent oxidoreductase  32.7 
 
 		 579 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21330  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.85 
 
 		 554 aa  192  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609696  normal  0.519106 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  32.8 
 
 		 543 aa  192  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05790  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.13 
 
 		 587 aa  192  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.837912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1250  FAD dependent oxidoreductase  32.7 
 
 		 579 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1267  FAD dependent oxidoreductase  32.7 
 
 		 579 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0487  FAD dependent oxidoreductase  32.58 
 
 		 582 aa  190  5e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0836475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1009  FAD dependent oxidoreductase  33.4 
 
 		 568 aa  189  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2437  FAD dependent oxidoreductase  33.85 
 
 		 573 aa  187  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00112879 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1014  FAD dependent oxidoreductase  34.39 
 
 		 552 aa  187  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.106527 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5801  FAD dependent oxidoreductase  33.4 
 
 		 567 aa  187  5e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5038  FAD dependent oxidoreductase  34.02 
 
 		 575 aa  186  8e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.991443  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0016  FAD dependent oxidoreductase  33.01 
 
 		 562 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13331  glycerol-3-phosphate dehydrogenase glpD2  32.29 
 
 		 585 aa  183  6e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.819547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5746  FAD dependent oxidoreductase  36.47 
 
 		 583 aa  182  9.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411962  normal  0.0261037 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5604  FAD dependent oxidoreductase  34.87 
 
 		 593 aa  182  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.969598  hitchhiker  0.0026989 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_1129  predicted protein  30.08 
 
 		 562 aa  181  2e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0027  FAD dependent oxidoreductase  33.21 
 
 		 582 aa  181  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3637  FAD dependent oxidoreductase  32.95 
 
 		 584 aa  181  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256736  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3955  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.02 
 
 		 495 aa  181  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0079  FAD dependent oxidoreductase  33 
 
 		 545 aa  181  4e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656011  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2088  FAD dependent oxidoreductase  29.66 
 
 		 554 aa  180  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0044542  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0315  FAD dependent oxidoreductase  33.85 
 
 		 603 aa  180  5.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259452 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2018  FAD dependent oxidoreductase  34.56 
 
 		 581 aa  180  7e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.523268 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4065  FAD dependent oxidoreductase  32.34 
 
 		 567 aa  179  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1360  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.05 
 
 		 573 aa  179  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000254105  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4611  FAD dependent oxidoreductase  32.92 
 
 		 574 aa  179  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.497063 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1386  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.05 
 
 		 557 aa  179  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.806879  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0868  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.78 
 
 		 557 aa  177  3e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0953137  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0192  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.09 
 
 		 514 aa  176  7e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0865  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.67 
 
 		 502 aa  176  8e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  32.38 
 
 		 556 aa  175  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0812  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.67 
 
 		 502 aa  176  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4821  FAD dependent oxidoreductase  32.91 
 
 		 581 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.929207  normal  0.0366818 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0272  FAD dependent oxidoreductase  33.85 
 
 		 639 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688812  normal  0.0156592 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2081  FAD dependent oxidoreductase  31.32 
 
 		 559 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2910  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.75 
 
 		 502 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0293172  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0029  FAD dependent oxidoreductase  34.09 
 
 		 555 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>