90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2178 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2178  NlpB/DapX family lipoprotein  100 
 
 		 371 aa  746    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000219579  normal  0.501785 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2429  NlpB/DapX family lipoprotein  77.21 
 
 		 373 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000329618  hitchhiker  0.0000381817 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1849  NlpB/DapX family lipoprotein  68.8 
 
 		 373 aa  536  1e-151  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00809428  normal  0.047859 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1981  NlpB/DapX family lipoprotein  67.02 
 
 		 365 aa  531  1e-150  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000195989  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1793  NlpBDapX family lipoprotein  60.32 
 
 		 365 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000036858  hitchhiker  0.0000000180087 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2589  NlpB/DapX family lipoprotein  60.32 
 
 		 365 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000786749  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2551  NlpB/DapX family lipoprotein  60.05 
 
 		 365 aa  474  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000648805  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2411  NlpB/DapX family lipoprotein  58.98 
 
 		 365 aa  472  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00389139  hitchhiker  0.00606094 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1703  NlpB/DapX family lipoprotein  60.05 
 
 		 365 aa  474  1e-132  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000363681  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1657  NlpB/DapX family lipoprotein  58.98 
 
 		 365 aa  472  1e-132  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00297866  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1880  lipoprotein-34 NlpB  59.52 
 
 		 365 aa  473  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2339  NlpB/DapX family lipoprotein  58.71 
 
 		 365 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.014226  hitchhiker  0.00000293311 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2666  NlpB/DapX family lipoprotein  59.52 
 
 		 365 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000276307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1865  NlpB/DapX family lipoprotein  57.1 
 
 		 365 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000807402  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1736  NlpBDapX lipoprotein  54.42 
 
 		 372 aa  436  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000422629  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1907  lipoprotein-34 NlpB  53.33 
 
 		 354 aa  422  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00617793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02135  lipoprotein-34 NlpB  29.23 
 
 		 367 aa  175  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00349153  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2477  NlpBDapX lipoprotein  28.02 
 
 		 368 aa  169  8e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.893949  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2378  lipoprotein  28.03 
 
 		 350 aa  102  9e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1861  NlpB/DapX family lipoprotein  23.47 
 
 		 374 aa  99.8  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127123  normal  0.13379 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002794  NlpB lipoprotein component of the protein assembly complex  25.48 
 
 		 339 aa  92.4  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3182  putative lipoprotein  24.02 
 
 		 389 aa  92.4  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0809995  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1737  lipoprotein  25.42 
 
 		 339 aa  90.5  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3508  lipoprotein  23.36 
 
 		 350 aa  89  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2609  lipoprotein  25.98 
 
 		 344 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2759  lipoprotein  25.98 
 
 		 344 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1199  lipoprotein  25.98 
 
 		 344 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2624  lipoprotein  25.98 
 
 		 344 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02331  hypothetical protein  25.98 
 
 		 344 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1192  NlpBDapX family lipoprotein  25.98 
 
 		 344 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02369  lipoprotein  25.98 
 
 		 344 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2973  lipoprotein  25.45 
 
 		 344 aa  87  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.500746 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3699  lipoprotein  25.98 
 
 		 344 aa  86.7  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2983  lipoprotein  24.08 
 
 		 346 aa  86.3  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1073  lipoprotein  23.31 
 
 		 346 aa  84.7  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2849  lipoprotein  25.68 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2854  lipoprotein  25.08 
 
 		 344 aa  83.6  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2722  lipoprotein  24.77 
 
 		 344 aa  82.8  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.12688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2747  lipoprotein  24.77 
 
 		 344 aa  82.8  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2681  lipoprotein  24.77 
 
 		 344 aa  82.8  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.284296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2633  lipoprotein  24.77 
 
 		 344 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03186  lipoprotein  23.82 
 
 		 339 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1140  lipoprotein  24.17 
 
 		 345 aa  79.7  0.00000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3178  lipoprotein  24.63 
 
 		 345 aa  79.3  0.00000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0463443  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3133  lipoprotein  23.68 
 
 		 352 aa  77.4  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1248  lipoprotein  23.36 
 
 		 352 aa  77  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1363  lipoprotein  23.36 
 
 		 352 aa  76.6  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.206221  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0847  NlpBDapX lipoprotein  23.62 
 
 		 374 aa  67.4  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165438 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1069  hypothetical protein  21.14 
 
 		 413 aa  62  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.700306 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3433  NlpBDapX family lipoprotein  21.6 
 
 		 364 aa  59.3  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1084  NlpBDapX family lipoprotein  20.22 
 
 		 398 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1905  hypothetical protein  21.67 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1749  putative lipoprotein  21.11 
 
 		 408 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0988  NlpBDapX family lipoprotein  19.95 
 
 		 398 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.359862  normal  0.208847 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1726  putative lipoprotein  21.11 
 
 		 408 aa  57  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1080  putative lipoprotein  20.83 
 
 		 410 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0976  putative lipoprotein  20.83 
 
 		 408 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0190  putative lipoprotein  20.83 
 
 		 408 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.225592  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1146  hypothetical protein  19.95 
 
 		 398 aa  55.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0438045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1524  putative lipoprotein  20.83 
 
 		 408 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.254018  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3171  NlpBDapX lipoprotein  21.39 
 
 		 383 aa  53.1  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0338919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1105  transmembrane protein  32.04 
 
 		 411 aa  51.6  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2547  putative lipoprotein  24.66 
 
 		 379 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00204284  normal  0.0198608 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0923  NlpBDapX family lipoprotein  20.69 
 
 		 362 aa  48.9  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1195  NlpB/DapX family lipoprotein  27.45 
 
 		 386 aa  49.3  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.621133 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1009  NlpB/DapX family lipoprotein  20.69 
 
 		 380 aa  48.9  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1099  uncharacterized lipoprotein  21.86 
 
 		 367 aa  48.1  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.822383  normal  0.47194 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0990  NlpBDapX family lipoprotein  21.91 
 
 		 382 aa  48.5  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000475285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1539  NlpBDapX lipoprotein  23.24 
 
 		 374 aa  48.1  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.591947  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0848  NlpB/DapX family lipoprotein  21.92 
 
 		 381 aa  47.8  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.733963  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0986  uncharacterized lipoprotein  21.52 
 
 		 412 aa  47.4  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00100518  normal  0.616376 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0842  uncharacterized lipoprotein  21.52 
 
 		 412 aa  47.4  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00443208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1462  uncharacterized lipoprotein-like protein  20.32 
 
 		 402 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1004  uncharacterized lipoprotein-like  20.32 
 
 		 402 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460446  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1486  uncharacterized lipoprotein-like protein  20.32 
 
 		 402 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.749081  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3006  putative lipoprotein  32.29 
 
 		 381 aa  45.8  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.169613  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1409  uncharacterized lipoprotein-like protein  20.59 
 
 		 402 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2641  NlpB/DapX family lipoprotein  22.32 
 
 		 398 aa  44.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1369  uncharacterized lipoprotein-like protein  20.59 
 
 		 402 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5090  NlpB/DapX family lipoprotein  19.05 
 
 		 385 aa  43.9  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.010697 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3138  putative lipoprotein  21.97 
 
 		 380 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2179  putative lipoprotein  21.97 
 
 		 380 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0381414  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1677  putative lipoprotein  21.97 
 
 		 380 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.466833  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1452  putative lipoprotein  21.97 
 
 		 380 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.477634  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2697  putative lipoprotein  21.97 
 
 		 418 aa  43.5  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2564  putative lipoprotein  21.97 
 
 		 380 aa  43.1  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.601002  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2618  putative lipoprotein  21.97 
 
 		 380 aa  43.1  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2475  NlpBDapX lipoprotein  21.19 
 
 		 346 aa  43.1  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1444  putative exported lipoprotein  19.86 
 
 		 411 aa  42.7  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0210161  normal  0.0324872 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1336  NlpB/DapX family lipoprotein  24.58 
 
 		 364 aa  42.7  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.970964  normal  0.901337 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>