58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0068 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0068  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  100 
 
 		 252 aa  528  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000292755 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0105  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  75.63 
 
 		 240 aa  362  2e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0110  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  65.82 
 
 		 243 aa  335  3.9999999999999995e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3706  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  61.41 
 
 		 241 aa  323  1e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0043809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0061  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  63.16 
 
 		 251 aa  323  2e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0783873  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4337  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  62.75 
 
 		 251 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4282  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  61.94 
 
 		 251 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000676386 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4477  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  61.54 
 
 		 251 aa  315  3e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.621367 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4677  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  60.41 
 
 		 250 aa  309  4e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3898  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  60.41 
 
 		 253 aa  308  8e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.217964  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3612  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  61.73 
 
 		 249 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.194342  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3935  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  62.03 
 
 		 242 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0314402  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3897  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  59.35 
 
 		 250 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3989  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  59.59 
 
 		 250 aa  291  9e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0225112 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4101  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  59.59 
 
 		 250 aa  289  4e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.238645 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0101  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  56.72 
 
 		 250 aa  276  2e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139094 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0117  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  47.18 
 
 		 258 aa  232  5e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0055  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  45.58 
 
 		 239 aa  201  9e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00060  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  42.25 
 
 		 214 aa  177  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00664  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  45.07 
 
 		 238 aa  176  4e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0330  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  37.39 
 
 		 231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2607  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  44.91 
 
 		 251 aa  172  2.9999999999999996e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.221231  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1694  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  36.24 
 
 		 236 aa  169  5e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001809  3-deoxy-D-manno-octulosonic acid kinase  42.06 
 
 		 236 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0241  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  41.71 
 
 		 234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0182  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  41.71 
 
 		 234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0160927  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0778  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  42.79 
 
 		 239 aa  163  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1292  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  40.09 
 
 		 249 aa  159  5e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1357  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  40.09 
 
 		 249 aa  159  5e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.232254  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0015  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  39.73 
 
 		 239 aa  157  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.595566  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0850  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  41.23 
 
 		 249 aa  152  4e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2807  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  37.86 
 
 		 256 aa  150  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.7235 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0306  lipopolysaccharide kinase  41.3 
 
 		 236 aa  145  5e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02451  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  37.44 
 
 		 249 aa  137  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2259  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  46.75 
 
 		 244 aa  123  3e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5852  protein of unknown function RIO1  32.32 
 
 		 387 aa  53.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.445195  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0316  lipopolysaccharide kinase  33 
 
 		 272 aa  51.2  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0128  hypothetical protein  27.59 
 
 		 324 aa  50.4  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116046 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0924  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  28 
 
 		 217 aa  48.5  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0678  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  25.96 
 
 		 190 aa  47.8  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.458535  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0598  O-sialoglycoprotein endopeptidase/protein kinase  30 
 
 		 519 aa  45.4  0.0009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.379748  normal  0.995378 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2439  serine/threonine protein kinase  42.55 
 
 		 482 aa  45.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6141  protein of unknown function RIO1  31 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.487286  normal  0.0422512 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40859  predicted protein  26.53 
 
 		 320 aa  44.3  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0450714 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0653  O-sialoglycoprotein endopeptidase/protein kinase  29.27 
 
 		 525 aa  44.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0825  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  32.26 
 
 		 208 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0324565 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2247  O-sialoglycoprotein endopeptidase/protein kinase  25 
 
 		 527 aa  43.9  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33379  predicted protein  27.66 
 
 		 422 aa  43.9  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00101834 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2984  Serine/threonine protein kinase involved in cell cycle control-like protein  28.43 
 
 		 291 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.513296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1195  O-sialoglycoprotein endopeptidase  28.85 
 
 		 190 aa  43.1  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.112433  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1531  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  25 
 
 		 206 aa  43.1  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000195612 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0361  protein of unknown function RIO1  30.1 
 
 		 246 aa  42.7  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1269  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  29.09 
 
 		 252 aa  42.7  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0705  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  26.92 
 
 		 219 aa  42.7  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.369661  hitchhiker  0.00000000383184 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5882  serine/threonine protein kinase  37.31 
 
 		 296 aa  42  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0086799  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0370  lipopolysaccharide kinase  28.81 
 
 		 244 aa  42  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00124  RIO1 family protein kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11730)  27.36 
 
 		 405 aa  42  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.270962  normal  0.782816 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6050  hypothetical protein  31.31 
 
 		 300 aa  42  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>