51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1142 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_1244  ATP-dependent nuclease, subunit B  35.67 
 
 		 1171 aa  743    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1775  ATP-dependent nuclease subunit B  34.95 
 
 		 1149 aa  753    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2833  ATP-dependent nuclease subunit B  34.62 
 
 		 1218 aa  660    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1219  ATP-dependent nuclease, subunit B  35.58 
 
 		 1171 aa  741    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4149  ATP-dependent nuclease, subunit B  35.75 
 
 		 1171 aa  740    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1192  ATP-dependent nuclease, subunit B  35.67 
 
 		 1171 aa  739    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.102099  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1296  ATP-dependent nuclease, subunit B  35.58 
 
 		 1171 aa  743    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0670  ATP-dependent nuclease subunit B  35.24 
 
 		 1171 aa  748    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1277  UvrD-like DNA helicase, C terminal  35.17 
 
 		 1165 aa  764    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0202  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  38.23 
 
 		 1149 aa  855    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1040  ATP-dependent nuclease subunit AddB  35.75 
 
 		 1171 aa  719    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.20152  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3424  ATP-dependent nuclease subunit B  32.03 
 
 		 1171 aa  651    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0859  ATP-dependent nuclease subunit AddB  35.32 
 
 		 1170 aa  711    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1485  ATP-dependent nuclease subunit B  35.89 
 
 		 1172 aa  737    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1415  UvrD-like DNA helicase, C terminal  36.88 
 
 		 1155 aa  788    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2040  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  38.11 
 
 		 1146 aa  842    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1141  ATP-dependent nuclease subunit B  35.58 
 
 		 1171 aa  740    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990093  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1038  ATP-dependent nuclease, subunit B  35.58 
 
 		 1171 aa  738    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0481  ATP-dependent deoxyribonuclease subunit B  34.04 
 
 		 1151 aa  671    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1060  ATP-dependent nuclease subunit B  35.58 
 
 		 1171 aa  740    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1040  ATP-dependent nuclease, subunit B  35.67 
 
 		 1171 aa  743    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0024  ATP-dependent nuclease, subunit B  34.56 
 
 		 1158 aa  743    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.199779  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1142  ATP-dependent nuclease subunit B  100 
 
 		 1124 aa  2303    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0024  ATP-dependent nuclease subunit B  34.73 
 
 		 1158 aa  741    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1856  ATP-dependent nuclease subunit B  28.23 
 
 		 1186 aa  532  1e-149  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.274018 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0966  ATP-dependent nuclease subunit AddB  26.84 
 
 		 1157 aa  429  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0985  ATP-dependent nuclease subunit AddB  26.84 
 
 		 1157 aa  429  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0554  exonuclease RexB  27.11 
 
 		 1159 aa  424  1e-117  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0522  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  26.82 
 
 		 1121 aa  384  1e-105  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0049  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  24.01 
 
 		 1260 aa  335  3e-90  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1032  ATP-dependent nuclease, subunit B  23.28 
 
 		 1158 aa  289  2e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.30431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1482  ATP-dependent nuclease, subunit B  22.25 
 
 		 1159 aa  243  2e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0308  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  22.74 
 
 		 1161 aa  226  2e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0003  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  23.25 
 
 		 1099 aa  210  1e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2077  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  22.61 
 
 		 1169 aa  203  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0873  exonuclease RexB  21.78 
 
 		 1077 aa  156  2e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.458095  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1682  ATP-dependent exonuclease, subunit B  21.77 
 
 		 1106 aa  154  1e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1804  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  23.5 
 
 		 986 aa  104  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1499  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  22.21 
 
 		 1049 aa  99.4  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1287  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  21.24 
 
 		 994 aa  89.4  4e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2513  ATP-dependent nuclease subunit B-like  29.02 
 
 		 1029 aa  73.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.260712  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2361  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  20.3 
 
 		 1113 aa  70.1  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1438  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  29.91 
 
 		 1029 aa  67  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.140223  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1608  double-strand break repair protein AddB  24.38 
 
 		 1037 aa  52.4  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62778  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0089  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  25.56 
 
 		 1048 aa  50.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.476876 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0840  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  25.65 
 
 		 1048 aa  49.7  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.564215  hitchhiker  0.00099262 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1570  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  27.56 
 
 		 1043 aa  47.8  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0049  hypothetical protein  23.78 
 
 		 1053 aa  47  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.258638  normal  0.374652 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0946  hypothetical protein  21.39 
 
 		 1081 aa  46.6  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.975146  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4407  ATP-dependent nuclease subunit B-like  27.75 
 
 		 1045 aa  45.4  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.546962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5799  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.2 
 
 		 1203 aa  45.1  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0523355 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>