More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0489 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0489  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
568 aa  1170    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000313702  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2260  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.28 
 
 
559 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116507 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1434  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.16 
 
 
549 aa  293  8e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0902  peptidoglycan glycosyltransferase  31.36 
 
 
566 aa  276  8e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000133887  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1486  penicillin-binding protein transpeptidase  32.7 
 
 
551 aa  274  3e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73283  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1011  peptidoglycan glycosyltransferase  32.47 
 
 
551 aa  273  5.000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.362727  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0919  peptidoglycan glycosyltransferase  31.12 
 
 
553 aa  265  2e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0272604  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1500  peptidoglycan glycosyltransferase  31.46 
 
 
535 aa  258  1e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  31.73 
 
 
695 aa  252  1e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0772  stage V sporulation protein D  30.83 
 
 
719 aa  240  5e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.655623  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1442  stage V sporulation protein D  30.96 
 
 
740 aa  226  9e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.542093  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1887  stage V sporulation protein D  30.77 
 
 
644 aa  225  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  29.91 
 
 
711 aa  224  4e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1015  stage V sporulation protein D  30.2 
 
 
646 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0669  stage V sporulation protein D  28.42 
 
 
713 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1298  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.17 
 
 
704 aa  214  3.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  30.51 
 
 
708 aa  209  2e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3766  sporulation specific penicillin-binding protein  29.78 
 
 
638 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3657  sporulation specific penicillin-binding protein  29.78 
 
 
638 aa  208  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3674  sporulation specific penicillin-binding protein  29.78 
 
 
638 aa  208  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4054  sporulation specific penicillin-binding protein  29.78 
 
 
638 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3968  sporulation specific penicillin-binding protein  29.6 
 
 
638 aa  207  4e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.313702  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  27.38 
 
 
643 aa  207  4e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1225  sporulation specific penicillin-binding protein  29.6 
 
 
638 aa  207  5e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00126151  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4016  sporulation specific penicillin-binding protein  29.6 
 
 
638 aa  207  5e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.622695  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3961  sporulation specific penicillin-binding protein  29.6 
 
 
638 aa  206  6e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3742  stage V sporulation protein D  30.15 
 
 
638 aa  206  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0979  peptidoglycan glycosyltransferase  28.45 
 
 
723 aa  205  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3930  sporulation specific penicillin-binding protein  29.78 
 
 
638 aa  205  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00892193 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  29.03 
 
 
705 aa  201  3e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1048  stage V sporulation protein D  29.49 
 
 
708 aa  201  3e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  27.8 
 
 
574 aa  200  6e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2565  stage V sporulation protein D  30.32 
 
 
638 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.18233  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.22 
 
 
657 aa  195  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  28.1 
 
 
639 aa  194  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4069  stage V sporulation protein D  27.74 
 
 
682 aa  191  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  28.69 
 
 
657 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0528  stage V sporulation protein D  28.02 
 
 
728 aa  190  5.999999999999999e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  28.78 
 
 
642 aa  190  7e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  28.67 
 
 
636 aa  187  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  29.71 
 
 
657 aa  187  4e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2015  peptidoglycan glycosyltransferase  30.71 
 
 
649 aa  186  8e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  27.48 
 
 
647 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0544  stage V sporulation protein D  26.89 
 
 
721 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.6503  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  27.44 
 
 
645 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1272  stage V sporulation protein D  29.52 
 
 
645 aa  179  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.144454  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3931  penicillin-binding protein 2  27.55 
 
 
600 aa  178  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2476  peptidoglycan glycosyltransferase  27.73 
 
 
649 aa  177  4e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.09 
 
 
654 aa  176  8e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  28.32 
 
 
640 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0478  penicillin-binding protein transpeptidase  25.54 
 
 
734 aa  172  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0121873  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  29.42 
 
 
586 aa  172  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2480  penicillin-binding protein transpeptidase  26.67 
 
 
592 aa  171  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2134  stage V sporulation protein D  26.19 
 
 
727 aa  171  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  30.14 
 
 
660 aa  171  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2117  stage V sporulation protein D  27.08 
 
 
739 aa  171  4e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  27.15 
 
 
586 aa  170  6e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1846  stage V sporulation protein D  26.28 
 
 
727 aa  170  7e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.23 
 
 
662 aa  169  9e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  29.31 
 
 
657 aa  169  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0378  penicillin-binding protein 2  26.49 
 
 
586 aa  168  2e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1831  stage V sporulation protein D  26.46 
 
 
739 aa  168  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1112  peptidoglycan glycosyltransferase  27.61 
 
 
553 aa  168  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0521932  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3635  peptidoglycan glycosyltransferase  25.99 
 
 
729 aa  167  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2771  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.8 
 
 
672 aa  166  8e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.47482  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4111  penicillin-binding protein  26.06 
 
 
584 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4122  penicillin-binding protein  26.06 
 
 
584 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  33.18 
 
 
473 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000594466  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4458  penicillin-binding protein  26.06 
 
 
584 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.184615 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0104  penicillin-binding protein 2  26.75 
 
 
599 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.14442  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4274  penicillin-binding protein  25.9 
 
 
584 aa  164  6e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4606  penicillin-binding protein  25.9 
 
 
584 aa  164  6e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1107  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.45 
 
 
710 aa  162  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2304  peptidoglycan glycosyltransferase  25.91 
 
 
610 aa  162  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0866  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.94 
 
 
562 aa  161  2e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.07417  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.96 
 
 
582 aa  160  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4620  penicillin-binding protein, transpeptidase  27.5 
 
 
609 aa  160  6e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27060  cell division membrane protein  29.41 
 
 
933 aa  160  7e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358527  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.79 
 
 
645 aa  159  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3042  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.18 
 
 
924 aa  158  2e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0514  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.32 
 
 
822 aa  157  4e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3047  peptidoglycan glycosyltransferase  30.43 
 
 
470 aa  157  6e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000101617  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2305  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.45 
 
 
458 aa  156  8e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.117419  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  26.32 
 
 
634 aa  155  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  27.05 
 
 
656 aa  155  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1172  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.09 
 
 
612 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1199  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.09 
 
 
612 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1372  penicillin-binding protein 2  26.62 
 
 
596 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0973  penicillin-binding protein transpeptidase  26.72 
 
 
590 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1004  peptidoglycan glycosyltransferase  26.68 
 
 
638 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.855584  normal  0.147704 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4511  penicillin-binding protein  24.76 
 
 
584 aa  154  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000549941  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  26 
 
 
646 aa  154  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  25.81 
 
 
610 aa  154  5e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4460  penicillin-binding protein  24.76 
 
 
584 aa  153  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.587336  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4497  penicillin-binding protein  25.08 
 
 
584 aa  153  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.421895  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2665  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.72 
 
 
677 aa  153  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  29.78 
 
 
504 aa  152  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3465  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.45 
 
 
703 aa  152  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575858 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  26.92 
 
 
578 aa  151  4e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2706  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.66 
 
 
689 aa  150  5e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0219846  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>