More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2480 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2480  penicillin-binding protein transpeptidase  100 
 
 
592 aa  1228    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0973  penicillin-binding protein transpeptidase  68.03 
 
 
590 aa  821    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0739  penicillin-binding protein  48.73 
 
 
584 aa  554  1e-156  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4497  penicillin-binding protein  47.96 
 
 
584 aa  551  1e-155  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.421895  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4274  penicillin-binding protein  47.8 
 
 
584 aa  548  1e-154  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4458  penicillin-binding protein  47.63 
 
 
584 aa  546  1e-154  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.184615 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4606  penicillin-binding protein  47.8 
 
 
584 aa  548  1e-154  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4111  penicillin-binding protein  47.29 
 
 
584 aa  543  1e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4122  penicillin-binding protein  47.29 
 
 
584 aa  542  1e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3090  penicillin-binding protein transpeptidase  46.34 
 
 
584 aa  543  1e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453793  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4511  penicillin-binding protein  46.85 
 
 
584 aa  542  1e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000549941  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4460  penicillin-binding protein  46.61 
 
 
584 aa  538  1e-151  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.587336  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4225  penicillin-binding protein transpeptidase  49.07 
 
 
584 aa  538  1e-151  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1011  peptidoglycan glycosyltransferase  28.05 
 
 
551 aa  206  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.362727  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1500  peptidoglycan glycosyltransferase  28.64 
 
 
535 aa  188  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2260  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.19 
 
 
559 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116507 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0489  peptidoglycan glycosyltransferase  26.67 
 
 
568 aa  171  4e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000313702  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0902  peptidoglycan glycosyltransferase  28.17 
 
 
566 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000133887  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0919  peptidoglycan glycosyltransferase  29.33 
 
 
553 aa  160  5e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0272604  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1486  penicillin-binding protein transpeptidase  26.4 
 
 
551 aa  160  6e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73283  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0772  stage V sporulation protein D  26.08 
 
 
719 aa  146  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.655623  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1434  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.34 
 
 
549 aa  145  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  25 
 
 
695 aa  141  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  26.96 
 
 
639 aa  137  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  25.68 
 
 
636 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2304  peptidoglycan glycosyltransferase  29.21 
 
 
610 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  26.2 
 
 
643 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  25.81 
 
 
645 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2679  penicillin-binding protein  24.78 
 
 
712 aa  127  6e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.314189  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2431  penicillin-binding protein transpeptidase domain-containing protein  25.46 
 
 
712 aa  127  6e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00172457  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2634  penicillin-binding protein  25.87 
 
 
712 aa  127  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000396671 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2717  penicillin-binding protein  25.51 
 
 
712 aa  127  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.211599  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0979  peptidoglycan glycosyltransferase  25.78 
 
 
723 aa  127  8.000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0528  stage V sporulation protein D  26.44 
 
 
728 aa  125  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2677  penicillin-binding protein  25.87 
 
 
712 aa  125  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2467  penicillin-binding protein  25.14 
 
 
712 aa  125  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00794581  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2648  penicillin-binding protein  25.14 
 
 
712 aa  125  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2666  penicillin-binding protein  24.91 
 
 
712 aa  125  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000149104 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  24.46 
 
 
705 aa  124  3e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  25.38 
 
 
647 aa  125  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2566  peptidoglycan glycosyltransferase  27.43 
 
 
717 aa  124  6e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0544  stage V sporulation protein D  26.28 
 
 
721 aa  124  6e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.6503  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  25.51 
 
 
711 aa  123  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2392  penicillin-binding protein transpeptidase domain-containing protein  24.95 
 
 
712 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.311388  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.71 
 
 
654 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2090  peptidoglycan glycosyltransferase  27.64 
 
 
597 aa  122  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27584  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1298  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.31 
 
 
704 aa  122  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2488  peptidoglycan glycosyltransferase  24.82 
 
 
712 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00738321  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  26.24 
 
 
640 aa  120  6e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  27.78 
 
 
660 aa  120  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  25.08 
 
 
570 aa  119  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  24.74 
 
 
610 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0091  peptidoglycan glycosyltransferase  25.9 
 
 
709 aa  118  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371789  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3969  penicillin-binding protein  26.2 
 
 
699 aa  118  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00715296  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3931  penicillin-binding protein 2  28.49 
 
 
600 aa  118  3e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3962  penicillin-binding protein  26.07 
 
 
716 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  24.47 
 
 
642 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00541  putative penicillin-binding protein  26.42 
 
 
609 aa  118  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2015  peptidoglycan glycosyltransferase  26.39 
 
 
649 aa  117  5e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0378  penicillin-binding protein 2  25.81 
 
 
586 aa  117  5e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  25.39 
 
 
708 aa  117  6e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  25.36 
 
 
646 aa  117  6.9999999999999995e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0478  penicillin-binding protein transpeptidase  25.57 
 
 
734 aa  117  7.999999999999999e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0121873  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00411  putative penicillin-binding protein  25.69 
 
 
548 aa  117  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.563194  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00471  putative penicillin-binding protein  26.71 
 
 
548 aa  116  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  27.79 
 
 
657 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0041  putative penicillin-binding protein  25.67 
 
 
596 aa  116  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.381944  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  25.47 
 
 
657 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1886  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.38 
 
 
736 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3675  penicillin-binding protein  25.67 
 
 
716 aa  114  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1442  stage V sporulation protein D  25.57 
 
 
740 aa  115  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.542093  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  25.13 
 
 
574 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3658  penicillin-binding protein  25.67 
 
 
716 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1887  stage V sporulation protein D  27.35 
 
 
644 aa  114  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3931  penicillin-binding protein  25.49 
 
 
699 aa  114  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0456911 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0051  peptidoglycan glycosyltransferase  30.29 
 
 
503 aa  114  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.948858  normal  0.601931 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2665  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.85 
 
 
677 aa  114  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1112  peptidoglycan glycosyltransferase  25.38 
 
 
553 aa  114  7.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0521932  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00200  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  30.23 
 
 
489 aa  114  7.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.765368  normal  0.710729 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4434  peptidoglycan glycosyltransferase  30.14 
 
 
480 aa  113  8.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2706  Peptidoglycan glycosyltransferase  24.92 
 
 
689 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0219846  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1373  putative penicillin-binding protein  26.22 
 
 
609 aa  113  9e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.741954  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3767  penicillin-binding protein  25.93 
 
 
716 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4055  penicillin-binding protein  25.93 
 
 
716 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0136  peptidoglycan glycosyltransferase  30.35 
 
 
482 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00209785 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2476  penicillin-binding protein transpeptidase  28.21 
 
 
471 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  24.6 
 
 
640 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3635  peptidoglycan glycosyltransferase  24.68 
 
 
729 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3016  peptidoglycan glycosyltransferase  28.09 
 
 
603 aa  111  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236598 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00896  penicillin-binding protein 3  25.43 
 
 
601 aa  110  5e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  25.61 
 
 
634 aa  110  5e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1015  stage V sporulation protein D  25.83 
 
 
646 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14210  Peptidoglycan glycosyltransferase  23.68 
 
 
671 aa  110  8.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000118475  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3743  peptidoglycan glycosyltransferase  25.65 
 
 
699 aa  109  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.41017  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4017  penicillin-binding protein  25.31 
 
 
716 aa  109  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0016  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.86 
 
 
478 aa  109  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1463  peptidoglycan glycosyltransferase  24.96 
 
 
655 aa  109  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37559  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1304  penicillin-binding protein 2  24.95 
 
 
701 aa  109  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000662569  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0456  peptidoglycan synthetase FtsI  25.04 
 
 
607 aa  109  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.619421 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1326  penicillin-binding protein 2  26.3 
 
 
617 aa  109  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>