More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0973 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0973  penicillin-binding protein transpeptidase  100 
 
 
590 aa  1212    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2480  penicillin-binding protein transpeptidase  68.03 
 
 
592 aa  848    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4274  penicillin-binding protein  45.95 
 
 
584 aa  536  1e-151  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4606  penicillin-binding protein  45.95 
 
 
584 aa  536  1e-151  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4460  penicillin-binding protein  45.61 
 
 
584 aa  534  1e-150  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.587336  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4122  penicillin-binding protein  45.61 
 
 
584 aa  534  1e-150  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4497  penicillin-binding protein  45.35 
 
 
584 aa  535  1e-150  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.421895  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4458  penicillin-binding protein  45.78 
 
 
584 aa  534  1e-150  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.184615 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4511  penicillin-binding protein  45.61 
 
 
584 aa  534  1e-150  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000549941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4111  penicillin-binding protein  45.44 
 
 
584 aa  531  1e-149  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0739  penicillin-binding protein  45.1 
 
 
584 aa  530  1e-149  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4225  penicillin-binding protein transpeptidase  46.69 
 
 
584 aa  523  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3090  penicillin-binding protein transpeptidase  45.58 
 
 
584 aa  524  1e-147  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453793  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1011  peptidoglycan glycosyltransferase  28.93 
 
 
551 aa  201  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.362727  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2260  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.5 
 
 
559 aa  187  4e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116507 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0902  peptidoglycan glycosyltransferase  30.07 
 
 
566 aa  187  7e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000133887  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1486  penicillin-binding protein transpeptidase  27.36 
 
 
551 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73283  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1500  peptidoglycan glycosyltransferase  28.02 
 
 
535 aa  170  5e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0919  peptidoglycan glycosyltransferase  29.83 
 
 
553 aa  168  2.9999999999999998e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0272604  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0489  peptidoglycan glycosyltransferase  26.74 
 
 
568 aa  163  8.000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000313702  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  26.06 
 
 
639 aa  150  9e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1434  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.12 
 
 
549 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  25.71 
 
 
636 aa  145  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.38 
 
 
654 aa  144  7e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  26.99 
 
 
660 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2488  peptidoglycan glycosyltransferase  26.55 
 
 
712 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00738321  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  28.9 
 
 
657 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3931  penicillin-binding protein 2  28.86 
 
 
600 aa  140  7.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2634  penicillin-binding protein  25.89 
 
 
712 aa  139  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000396671 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  26.45 
 
 
643 aa  139  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2677  penicillin-binding protein  25.89 
 
 
712 aa  139  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  26.81 
 
 
645 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  26.29 
 
 
647 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0979  peptidoglycan glycosyltransferase  24.88 
 
 
723 aa  134  6e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2304  peptidoglycan glycosyltransferase  29.38 
 
 
610 aa  133  7.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2431  penicillin-binding protein transpeptidase domain-containing protein  25.71 
 
 
712 aa  133  9e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00172457  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2467  penicillin-binding protein  25.93 
 
 
712 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00794581  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2648  penicillin-binding protein  25.93 
 
 
712 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2666  penicillin-binding protein  25.93 
 
 
712 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000149104 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2679  penicillin-binding protein  25.62 
 
 
712 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.314189  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2717  penicillin-binding protein  25.71 
 
 
712 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.211599  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  27.21 
 
 
657 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0016  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.86 
 
 
478 aa  131  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1442  stage V sporulation protein D  26.13 
 
 
740 aa  130  7.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.542093  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  25.82 
 
 
642 aa  130  8.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2392  penicillin-binding protein transpeptidase domain-containing protein  25.75 
 
 
712 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.311388  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3962  penicillin-binding protein  25.85 
 
 
716 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2706  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.08 
 
 
689 aa  128  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0219846  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0866  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.93 
 
 
562 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.07417  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  26.19 
 
 
708 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1886  Peptidoglycan glycosyltransferase  25.55 
 
 
736 aa  128  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3969  penicillin-binding protein  25.81 
 
 
699 aa  126  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00715296  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  24.31 
 
 
705 aa  126  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0378  penicillin-binding protein 2  24.92 
 
 
586 aa  125  2e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1685  penicillin-binding protein 2  24.51 
 
 
670 aa  125  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.361275  normal  0.0578136 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0772  stage V sporulation protein D  24.96 
 
 
719 aa  125  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.655623  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.76 
 
 
570 aa  124  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0091  peptidoglycan glycosyltransferase  25.9 
 
 
709 aa  124  6e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371789  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00200  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  32.31 
 
 
490 aa  123  8e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0669  stage V sporulation protein D  24.75 
 
 
713 aa  123  9e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2566  peptidoglycan glycosyltransferase  26.09 
 
 
717 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2476  penicillin-binding protein transpeptidase  29.19 
 
 
471 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3658  penicillin-binding protein  25.34 
 
 
716 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  25.67 
 
 
711 aa  122  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4434  peptidoglycan glycosyltransferase  30.17 
 
 
480 aa  122  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0136  peptidoglycan glycosyltransferase  31.34 
 
 
482 aa  121  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00209785 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3675  penicillin-binding protein  25.34 
 
 
716 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1304  penicillin-binding protein 2  27.54 
 
 
701 aa  121  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000662569  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3961  sporulation specific penicillin-binding protein  25.58 
 
 
638 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1463  peptidoglycan glycosyltransferase  26.13 
 
 
655 aa  120  6e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37559  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3767  penicillin-binding protein  25.77 
 
 
716 aa  120  7e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  26.76 
 
 
656 aa  120  7e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4055  penicillin-binding protein  25.77 
 
 
716 aa  120  7e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3743  peptidoglycan glycosyltransferase  25.13 
 
 
699 aa  120  7e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.41017  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00200  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  31.84 
 
 
489 aa  120  7e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.765368  normal  0.710729 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3968  sporulation specific penicillin-binding protein  25.58 
 
 
638 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.313702  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14210  Peptidoglycan glycosyltransferase  25.2 
 
 
671 aa  120  9e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000118475  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3766  sporulation specific penicillin-binding protein  25.77 
 
 
638 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3657  sporulation specific penicillin-binding protein  25.77 
 
 
638 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3674  sporulation specific penicillin-binding protein  25.77 
 
 
638 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3930  sporulation specific penicillin-binding protein  25.75 
 
 
638 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00892193 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4054  sporulation specific penicillin-binding protein  25.77 
 
 
638 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3931  penicillin-binding protein  24.87 
 
 
699 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0456911 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  26.12 
 
 
640 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  26.22 
 
 
610 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  23.63 
 
 
695 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1537  penicillin-binding protein 2  25.59 
 
 
646 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  25.99 
 
 
634 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  26.77 
 
 
657 aa  118  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4016  sporulation specific penicillin-binding protein  25.43 
 
 
638 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.622695  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1225  sporulation specific penicillin-binding protein  25.43 
 
 
638 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00126151  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0178  penicillin-binding protein 2  24.21 
 
 
588 aa  117  5e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1172  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.52 
 
 
656 aa  117  6e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0172  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.1 
 
 
483 aa  117  6e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.81873 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3742  stage V sporulation protein D  25.08 
 
 
638 aa  117  7.999999999999999e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3840  peptidoglycan glycosyltransferase  29.33 
 
 
577 aa  116  8.999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527285  hitchhiker  0.000155287 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4017  penicillin-binding protein  24.66 
 
 
716 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0528  stage V sporulation protein D  24.39 
 
 
728 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2665  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.55 
 
 
677 aa  116  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0041  putative penicillin-binding protein  25.99 
 
 
596 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.381944  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>